段婷婷
- 作品数：1 被引量：3H指数：1
- 供职机构：山西师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：山西省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 受青枯菌诱导表达的马铃薯转录因子类StWRKY8的克隆与表达分析被引量：3
- 2015年
- [目的]从接种青枯菌(Ralstonia solanacearum)的马铃薯中薯3号(Solanum tuberosum)中克隆类St WRKY8部分序列,分析其序列结构特征,研究该基因在感、抗病基因型马铃薯中受诱导的差异表达模式及其不同的组织表达定位。[方法]分别培养抗病基因型马铃薯ED13、感病基因型中薯3号至9—10叶期,以伤根浸菌法接种青枯菌菌株PO41。提取叶片总RNA,反转录为cDNA,使用PCR筛选cDNA差减试剂盒构建消减文库,筛选出384个阳性克隆作为原始SMART cDNA文库,采用5'-RACE法根据SMART-RACE cDNA扩增试剂盒说明克隆全长类St WRKY8。并分别应用生物信息学软件Bio Edit、BLAST、MEGA 5.0分析类St WRKY8的基因序列、序列相似性比对以及建立系统进化树。利用Prot Param、Prot Scale、SWISS-MODEL、Net Phos2.0 Server、WOLF PSORT、Target P1.1Server等在线服务器预测类St WRKY8的理化特性、三级结构、磷酸化位点以及亚细胞定位。提取马铃薯ED13、中薯3号接种青枯菌后的叶片总RNA,采样时间点分别为处理后6 h、12 h、1 d、2 d、3 d、4 d和6 d,运用反转录PCR和荧光定量PCR检测类St WRKY8的表达情况。以类St WRKY特异PCR产物制备地高辛标记探针,取材料茎、叶组织制作石蜡切片,并与标记探针进行原位杂交,定位其组织表达。[结果]获得了类St WRKY8 cDNA部分序列,长563 bp,包括一个完整开放阅读框258 bp,编码85个氨基酸。类St WRKY8属于第二类WRKY,锌指结构类型为C2H2,具有一个典型的WRKY保守结构域。其氨基酸序列与茄科(Solanaceae)其他成员具有高度同源性,与马铃薯转录因子St WRKY8相似性高达98%。预测类St WRKY8等电点约为9.1,半衰期大于5.5 h,为水溶性蛋白,其三维结构为非球状分子,含有3个磷酸化位点,亚细胞定位于细胞内。类St WRKY8受青枯菌诱导后表达上调,且在感、抗病基因型马铃薯中表达有差异。类St WRKY8在感病基因型马铃薯接种青枯菌6 h内表达量较低,
- 薛珍李卉孔超越段婷婷郜刚
- 关键词：马铃薯青枯菌转录因子基因表达
