马兴亮
- 作品数:3 被引量:76H指数:3
- 供职机构:华南农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金:国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 植物CRISPR/Cas9基因组编辑系统与突变分析被引量:19
- 2016年
- 基因组定点编辑技术通过可编码核酸酶切割基因组特定位点,进而诱导基因组定点突变。CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)基因组编辑系统由Cas9核酸酶以及sg RNA(Single guide RNA)组成,与其他可编码核酸酶系统如锌指核酸酶(Zinc finger nucleases,ZFNs)和类转录激活因子效应物核酸酶(Transcription activator-like effector nucleases,TALENs)相比具有更简便的操作性和更高的基因组定点编辑效率。目前在植物中已有多例应用CRISPR/Cas9系统进行基因组编辑的报道。本文从Cas9基因与sg RNA表达载体的构建策略,获得基因组定点编辑突变体的转化方法、突变的效率和特征、突变的检测方法等方面进行了总结,最后对植物中利用CRISPR/Cas9系统进行基因组编辑存在的问题以及发展前景进行了讨论。
- 马兴亮刘耀光
- 关键词:植物基因型鉴定
- 植物CRISPR/Cas9多基因编辑载体构建和突变分析的操作方法被引量:38
- 2018年
- CRISPR/Cas9基因组编辑技术是植物基因功能研究与作物改良的有效工具.为此,本实验室开发了高效的CRISPR/Cas9植物多基因编辑载体系统.本载体系统包括6个双元载体和12个含有不同U3/U6启动子的sg RNA中间载体,可满足对单子叶和双子叶植物的遗传转化以及不同抗生素筛选的要求,具有简便、高效,可同时对多基因进行编辑的特点.此外,为了能更高效地应用基因组编辑技术,还开发了一站式在线分析工具包CRISPR-GE.为方便研究人员利用CRISPR/Cas9系统进行植物基因组编辑,本文提供了从靶点选择、CRISPR/Cas9多靶点双元载体构建,以及对靶点突变序列的测序分析等详细的操作方法,以及常见的问题解答.
- 曾栋昌马兴亮谢先荣祝钦泷祝钦泷
- 关键词:定点突变
- 高通量PCR模板植物基因组DNA制备方法被引量:20
- 2013年
- 制备大量生物样品的模板DNA用于PCR检测是费时费工的工作。本文介绍一种快速高通量的植物基因组DNA(gDNA)制备及其用于PCR基因型检测的操作方法。将一小段单子叶植物苗叶片(与96方孔板的孔深大致相同)或一小块(约2~5mg)双子叶植物叶片放入96方孔板的各孔中、放入一粒直径4mm或3mm的合金珠和150μL制备缓冲液,盖上硅橡胶盖,在涡旋器或震动研磨器震动2~4min破碎组织。此方法获得的粗制gDNA样品浓度约2~4ngμL?1。用96针复制器或多通道移液器转移约0.5~1.0μL的gDNA溶液到96孔PCR板的反应液中,利用各种类型的PCR标记(简单序列重复SSR,插入缺失InDel等)进行基因型检测。此方法制备的gDNA模板也适合于较大DNA片段(>1kb)的扩增。本方法的关键是控制好在一定溶液量中破碎合适量的叶片,以及不要加入过量的gDNA溶液,以免带入过多的杂质抑制PCR效果。这种从材料种植、制备gDNA、转移样品gDNA,到PCR都是96格式化操作的快速、高通量、低成本的方法特别适合大量植物样品的规模化基因型检测。
- 王慧娜初志战马兴亮李日清刘耀光
- 关键词:PCR基因分型