张顺
- 作品数：12 被引量：30H指数：4
- 供职机构：广东海洋大学水产学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学一般工业技术天文地球更多>>
- 基于DNA条形码技术的雷州半岛红树林海区仔稚幼鱼物种多样性研究
- 本研究采集雷州半岛红树林海区四个站点(下六、附城、九龙山、高桥)的仔稚幼鱼周年样本(2013年3月至2015年4月),测定的286条cox1条形码序列可分为58种.鉴定结果表明该海区仔稚幼鱼绝大多数为鲈形目(44种)的虾...
- 廖健张顺贺亮龙水生沈自慧郭昱嵩王中铎
- 关键词：仔稚幼鱼物种组成生态类群系统进化DNA条形码
- 基于线粒体cox1基因序列的弹涂鱼类系统进化关系被引量：8
- 2017年
- 于我国雷州半岛红树林海区捕获隶属于弹涂鱼属(Periophthalmus)、大弹涂鱼属(Boleophthalmus)与青弹涂鱼属(Scartelaos)的4种弹涂鱼,克隆4种弹涂鱼23个个体cox1基因序列,通过分析4种弹涂鱼与Gen Bank中12种弹涂鱼cox1基因序列的变异特征,探讨4种弹涂鱼与后者的种间亲缘关系。结果表明,16种弹涂鱼的82个体的cox1基因序列共检测到单倍型44个,核苷酸多态位点212个(占35.4%),种间平均核苷酸差异数为4(占2.01%);基于最大似然法(ML)和邻接法(NJ)构建的系统发育树显示,各弹涂鱼属多形成一独立分支,亲缘关系明显,齿弹涂鱼属(Periophthalmodon)镶嵌于弹涂鱼属内,大弹涂鱼属与青弹涂鱼属形成并列分支,亲缘关系较近。依化石记录标定的松散分子钟估算物种分歧时间,结果表明,各弹涂鱼属出现明显分化大约发生于渐新世末期至中新世早期(23.61~15.65 Ma)。
- 张顺廖健郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：弹涂鱼线粒体DNA系统进化
- 5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化被引量：10
- 2016年
- 获得雷州半岛红树林海区5 种虾虎鱼稚幼鱼的45 条线粒体COI 基因序列,其T、C、A、G 碱基平均含量分别为29.9%、28.4%、23.9%、17.8%.45 条序列共定义23 个单倍型,其中检测到变异位点184 个,双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）单倍型比例最高（80.0%）, 湖栖鳍虾虎鱼（Gobiopterus lacustris）单倍型比例最低（18.2%）.Kimura 2-parameter 遗传距离显示,种间遗传距离为0.137 6 - 0.263 5,种内遗传距离为0.000 0 - 0.020 8.NJ 进化树及ML 进化树均表明,聚为5大支系的虾虎鱼类中,阿部氏鲻虾虎鱼（Mugilogobius abei）与诸氏鲻虾虎鱼（M. chulae）亲缘关系最近,湖栖鳍虾虎鱼与其他4 种虾虎鱼的亲缘关系稍远.基于群体内等位基因频率分布的中性检验结果表明,双带缟虾虎鱼（Tridentiger bifasciatus）、小口拟虾虎鱼（ Pseudogobius masago）、阿部氏鲻虾虎鱼、诸氏鲻虾虎鱼4 个群体存在大量低频等位基因位点,而湖栖鳍虾虎鱼群体以中等频率等位基因为主.
- 廖健张顺龙水生黄承勤郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：虾虎鱼COI基因系统进化
- 5种虾虎鱼类线粒体COⅠ基因序列变异及系统进化
- 以雷州半岛红树林海区虾虎鱼科仔稚幼鱼为研究对象，获得了5 种虾虎鱼类的45 条线粒体COⅠ基因序列，其T、C、A、G 碱基平均含量分别为：29.9％、28.4％、23.9％、17.8％.45 条序列共定义23 个单倍型，...
- 廖健张顺龙水生黄承勤郭昱嵩王中铎
- 关键词：虾虎鱼线粒体系统进化
- 基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异被引量：6
- 2016年
- 设计双层洞穴式弹涂鱼捕捉器,于雷州半岛红树林海区捕获弹涂鱼类野生群体,筛选出弹涂鱼(Periophthalmus modestus)、大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)2个优势种群,并获取其线粒体控制区(D-loop)和cox 1基因部分序列,进行序列变异分析及遗传分析。结果表明,cox 1基因和D-loop区碱基组成A+T含量均大于C+G。cox 1数据揭示,大弹涂鱼变异位点占总长度2.1%,弹涂鱼占2.4%,种内平均遗传距离分别为0.003、0.006,种间遗传距离为0.158,37个个体共定义22个单倍型,单倍型多样性为0.950 45。而D-loop区数据指明,大弹涂鱼变异位点占总长度4.9%,弹涂鱼占7.5%,种内平均遗传距离分别为0.012、0.019,种间距离为0.409,37个个体定义32个单倍型,单倍型多样性水平极高(0.989 49)。中性检验结果显示,2种弹涂鱼进化历程符合中性进化假设,且存在群体扩张的可能。综合cox 1基因和控制区数据显示:弹涂鱼种群遗传多样性高于大弹涂鱼。
- 廖健贺亮张顺沈自慧黄永胜龙水生黄承勤王中铎
- 关键词：红树林弹涂鱼系统进化
- 基于线粒体cox1基因序列探讨弹涂鱼属鱼类系统进化关系
- 本文基于线粒体cox1基因DNA条形码对我国雷州半岛红树林区常见弹涂鱼进行分类鉴定,并结合从GenBank中获得的12种弹涂鱼的cox1基因序列,探讨16种弹涂鱼之间的系统进化关系。在所分析的82条cox1基因同源序列(...
- 张顺黄承勤廖健郭昱嵩王中铎刘楚吾
- 关键词：线粒体DNA系统进化
- 文献传递
- 一种弹涂鱼捕捉器的制作与应用被引量：1
- 2017年
- 利用防腐蚀的塑化玻璃板制作一种双层单向通道的弹涂鱼捕捉器,于2015年12月至2016年6月投放于雷州半岛高桥镇国家级红树林保护区(N21°36′24″,E109°47′8″)、下六镇红蒔地红树林区(N21°19′54″,E109°48′57″)、九龙山湿地公园(N20°39′51″,E110°17′13″)、附城镇北家村红树林区(N21°9′0″,E110°17′58″)、东海岛红树林保护区(N21°06′22″,E110°18′54″)五个站点。共捕获大弹涂鱼128尾、弹涂鱼105尾、青弹涂鱼41尾,经F检验表明,该捕捉器对大弹涂鱼、弹涂鱼的捕捉能力具有明显的偏倚性。并对大弹涂鱼进行遗传分析,发现弹涂鱼遗传多样性高于大弹涂鱼。总体而言,双层洞穴式捕捉器与传统铲挖式、甩竿式、竹筒法捕捉弹涂鱼相比较,具有明显的省时、省力、逃逸率低、对环境破坏力度小等特征,适合科学研究所需弹涂鱼野生群体样本采集之用。
- 廖健贺亮张顺龙水生黄承勤王中铎
- 关键词：弹涂鱼野生群体
- COⅠ条形码辅助分析雷州半岛红树林区鱼类的物种多样性被引量：9
- 2016年
- 于2014年3月至2015年7月从我国雷州半岛红树林区采集成鱼和幼鱼样本共1720尾,在依据Fish Base等鱼类形态分类系统进行鉴定的基础上,利用COⅠ条形码技术确认存在94个物种,分属11目33科72属。结果表明:红树林区鱼类种群极其丰富,其中鲈形目(Perciformes)鱼类物种最多,为59种,占总物种数的62.77%,其次是鲱形目(Clupeiformes)和鲻形目(Mugiliformes),分别占6.38%和5.32%。鲈形目中又以虾虎鱼科(Gobiidae)为优势类群,含29种(占30.85%)。按生态类群分:海洋洄游鱼类最多,占物种总数的32.98%,其次为海洋偶见鱼类、两侧洄游鱼类,分别占22.34%、17.02%,以虾虎鱼类物种为主的红树林定居鱼类约占11%。本研究表明红树林生态系统是许多海水、淡水和洄游性鱼类在特定生活阶段的重要栖息地和育幼场所。另外,COⅠ条形码技术可有效快捷地鉴定出红树林海域的鱼类。
- 张顺廖健柏琴陈冲郭昱嵩刘楚吾王中铎
- 关键词：红树林COI基因DNA条形码物种多样性
- 5种虾虎鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化
- 以雷州半岛红树林海区虾虎鱼科仔稚幼鱼为研究对象,获得了5种虾虎鱼类的45条线粒体COI基因序列,其T、C、A、G碱基平均含量分别为:29.9％、28.4％、23.9％、17.8％.45条序列共定义23个单倍型,其中检测到...
- 廖健张顺龙水生黄承勤郭昱嵩王忠铎
- 关键词：COI基因系统进化
- 基于DNA条形码探讨红树林区背眼虾虎鱼亚科鱼类的分子系统学
- 2017年
- 本研究分别基于线粒体的Cox1基因DNA条形码序列和12个蛋白编码基因序列,探讨我国雷州半岛红树林常见9种背眼虾虎鱼的分类与演化历程。采用Kimura双参数法计算遗传距离,基于邻接法(NJ)和最大似然法(ML)构建的系统进化树显示,属于背眼虾虎鱼亚科(Oxudercinae)的弹涂鱼属(Periophthalmus)聚为一枝,呈单系群;大鳍弹涂鱼(P.magnuspinnatus)与弹涂鱼(P.modestus)的平均遗传距离高达12.55%,分属分子系统树的不同分支,从分子水平证实了大鳍弹涂鱼为新纪录种。依化石记录标定的松散分子钟估算物种的分歧时间,推测背眼虾虎鱼亚科与虾虎鱼亚科(Gobiinae)及其它亚科于始新世晚期至渐新世中期(39.48~26.09 Mya)出现了明显的分化,到中新世(27.98~20.03 Mya),背眼虾虎鱼亚科的两栖类型开始出现。本研究表明线粒体Cox1条形码能清楚反映出虾虎鱼类亚科、属及种间分类单元的系统发育关系。
- 张顺黄承勤廖健郭昱嵩刘楚吾王中铎
- 关键词：DNA条形码线粒体DNA分子系统学
