- 一株脱氯艾德昂菌及其应用
- 本发明提供了一株脱氯艾德昂菌及其应用，所述的菌为艾德昂菌(<I> Ideonella sp.</I>)FZJG233，该菌株已于2016年1月21日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏，保藏号为CGMCC N...
- 叶文雨鲁国东倪明月林占熺张恒黄昊陈晓斌刘朋虎
- 文献传递
- 一株脱氯艾德昂菌及其应用
- 本发明提供了一株脱氯艾德昂菌及其应用，所述的菌为艾德昂菌(<I>Ideonella sp.</I>)FZJG233，该菌株已于2016年1月21日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心保藏，保藏号为CGMCC No...
- 叶文雨鲁国东倪明月林占熺张恒黄昊陈晓斌刘朋虎
- 文献传递
- 水稻E3泛素连接酶OsUBC26IP2和OsUBC26IP4的功能分析
- 蛋白翻译后修饰在维持蛋白稳定性和蛋白活性调节中发挥重要作用。作为蛋白翻译后修饰的一种重要方式,泛素蛋白酶体介导的蛋白质水解是细胞内蛋白水解的主要途径。蛋白泛素化降解广泛参与植物生长发育,非生物与生物胁迫等方面的调节。E3...
- 张恒
- 关键词：水稻酵母双杂交E3泛素连接酶
- 水稻泛素结合酶基因家族的生物信息学与表达分析被引量：5
- 2016年
- 泛素/蛋白酶体系统在植物的生长发育、形态建成和抗病反应等过程中起着重要的作用。近年的研究表明,某些病原菌能够模拟寄主植物泛素/蛋白酶体系统组分,从而达到利用该系统为病原菌服务的目的。泛素结合酶是泛素化反应过程中的第二个酶,对植物泛素/蛋白酶体系统的正常运行不可或缺。已有的研究表明,水稻基因组数据库中存在48个预测的泛素结合酶基因。为了初步揭示这些泛素结合酶基因在植物抗病防御反应中的功能,研究其与植物抗病性的关系。本研究通过生物信息学、RNA-seq和qRT-PCR的方法,分析了水稻泛素结合酶基因家族的特征及其表达模式。系统进化树分析表明,48个水稻泛素结合酶基因可分为3个大组,总共7个亚组。蛋白结构域分析表明,水稻泛素结合酶基因主要由一个泛素结合酶催化结构域组成。电子表达谱分析表明,大多数水稻泛素结合酶基因能被稻瘟病菌诱导表达。启动子区顺式作用元件分析表明,4个抗病相关顺式作用元件和1个过敏性反应相关顺式作用元件在48个水稻泛素结合酶基因的启动子区有很高的分布。稻瘟病菌接种亲和性和非亲和性水稻单基因系的RNA-seq结果表明,处理36h读取到的水稻泛素结合酶基因为44个,其中高表达基因数量超过读取到的泛素结合酶基因总数的50%。qRT-PCR分析结果表明稻瘟病菌的侵染在亲和和非亲和组合中都能诱导部分水稻泛素结合酶基因的表达。在非亲和组合中水稻泛素结合酶基因的表达倾向于受到抑制。
- 刘鑫张恒阚虎飞周立帅黄昊宋林林翟焕趁张君鲁国东
- 关键词：水稻泛素结合酶生物信息学稻瘟病菌RNA-SEQQRT-PCR
