王江燕
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 供职机构：广西医科大学附属肿瘤医院更多>>
- 发文基金：广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 幽门螺杆菌感染相关胃癌的差异蛋白分析被引量：4
- 2015年
- 目的 利用核素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术筛选幽门螺杆菌（Hp）感染相关胃癌的差异蛋白,以便寻找胃癌的生物学标志物和药物治疗靶标.方法 分别收集人胃癌细胞HGC-27及与Hp共培养24h的HGC-27的各组蛋白,iTRAQ试剂标记后利用强离子交换柱（SCX）分离,经串联质谱鉴定及相对定量;同时通过查阅Pubmed数据库中1995年1月至2014年7月公开发表的文献,其中使用任一种差异蛋白质组学方法鉴定Hp感染相关胃癌的差异蛋白;将iTRAQ数据与文献报道数据进行荟萃分析,对获得的差异蛋白采用PANTHER数据库进行基因功能聚类（GO）分析、PANTHER蛋白分类及路径（Pathway）分析.结果 通过iTRAQ标记鉴定出Hp感染相关胃癌细胞HGC-27的差异蛋白共47个,其中下调表达的37个,上调表达的10个.通过文献检索共纳入符合要求的文献7篇,其中2个以上实验室（包括iTRAQ实验）重复发现的蛋白为21个.将iTRAQ数据与文献报道数据荟萃分析得到65个差异蛋白,进行GO分析显示,生物学过程主要集中在细胞组分重组和各种代谢过程;分子功能主要集中在核酸、DNA结合,具有催化活性和转移酶活性;PANTHER蛋白分类主要为分子伴侣、结合蛋白、骨架蛋白、转氨酶和转录因子;Pathway分析显示差异蛋白主要参与帕金森疾病通路、凋亡信号通路和促性腺激素释放激素（GnRH）通路.结论 筛选出多种与Hp感染相关胃癌的差异蛋白,为胃癌患者的早期诊断提供可能的生物学标志物和药物治疗的靶标.
- 陈佳玮袁燕玲王江燕刘爱群葛莲英
- 关键词：胃肿瘤幽门螺杆菌蛋白质组学
