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董丽娜: 作品数：10 被引量：8H指数：2; 供职机构：浙江省血液中心更多>>; 发文基金：浙江省医药卫生科学研究基金浙江省医药卫生平台重点资助计划浙江省自然科学基金更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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TypeStream Visual软件在浙江汉族人群HLA分型结果指定的情况分析被引量：1: 2022年; 目的基于Ion Torrent S5平台评价TypeStream Visual(TSV)软件应用于HLA基因分型结果指定的情况。方法采用AllType NGS测序试剂盒在Ion Torrent S5平台上对364例标本检测HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1基因型。对HLA-DRB1位点纯合子标本采用PCR-SSO流式磁珠法复核HLA-DRB1基因。对外显子区域碱基存在报警的标本采用PCR-SBT法复核。使用TSV1.3.0软件指定NGS法的HLA分型结果,直接计数法统计分析每个位点的各类报警情况。结果364例标本HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRB1、HLA-DQB1位点结果中,至少有一个等位基因报警的组合有1193对,占总数的65.55%。共计18对等位基因组合报警存在外显子区域碱基错配,经PCR-SBT方法复核仅发现2例为真实的错配,其他16例为NGS错误的判定。发现2例标本NGS法结果分别在HLA-B和HLA-DRB1位点中判定出现偏差。HLA-DRB1位点纯合子标本NGS法与PCR-SSO法检测结果一致。结论基于Ion Torrent S5平台,AllType NGS测序试剂和TSV专业软件应用于HLA基因分型结果准确,针对外显子区域碱基错配的报警宜采用PCR-SBT法进行复核。; 董丽娜王芳王芳何吉章伟; 关键词：人类白细胞抗原

人类白细胞抗原HLA-C*04:01:01G组的区分鉴别: 研究探讨区分人类白细胞抗原(HLA)-C*04:01:01G组内等位基因,并分析其与HLA-A、-B的连锁情况.收集HLA-C*04:01:01G组标本,采用聚合酶链反应测序分析方法(PCR-SBT)检测其第2-7外显子...; 王炜章伟陈男英何俊俊韩浙东秦斐董丽娜朱发明吕杭军; 关键词：人类白细胞抗原等位基因多态性; 文献传递

基于Ion Torrent S5平台的二代测序技术对HLA-DRB1基因分型模棱两可进行分析被引量：3: 2021年; 目的基于Ion Torrent S5平台NGS法进行HLA-DRB1基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例进行分析。方法对471例脐带血造血干细胞库标本采用基于Ion Torrent S5平台的二代测序法检测HLA-DRB1位点,并同步对其中的94例标本采用PCR-SBT测定HLA-DRB1位点,余下377例标本采用PCR-SSO流式磁珠法检测。使用分型软件指定NGS法的HLA-DRB1分型结果,以HLA-DRB1*后第三区的数字作为高分辨水平统计,直接计算法分析模棱两可组合比例。结果标本中470例HLA-DRB1基因NGS检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合;其中1例标本NGS法漏检一个等位基因,符合率为99.8%。NGS法检测结果中,471例标本中有160例标本HLA-DRB1等位基因型出现模棱两可,比例为33.97%(160/471)。最常见的模棱两可结果组合为DRB1*09∶01∶02/09∶21。结论基于Ion Torrent S5平台的NGS技术可降低HLA-DRB1基因分型的模棱两可结果比例,但仍有一定比例的模棱两可组合结果,同时应注意NGS法检测漏检等位基因的风险。; 赵烁贤董丽娜王芳王芳何吉章伟; 关键词：HLA-DRB1 测序分型

HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位基因重组的分析: 2023年; 目的:探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法:采集家系成员的外周血,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位,通过家系遗传分析确定个体HLA单体型。结果:家系1中单体型HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:02~DQB1*03:01~DPB1*05:01:01G与HLA-A*03:01~C*04:01~B*35:03~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G在HLA-B和HLA-DRB1座位间进行了交换,形成HLA-A*11:01~C*03:04~B*13:01~DRB1*12:01~DQB1*03:01~DPB1*04:01:01G。家系2中单体型HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*13:01:01G与HLA-A*11:01~C*07:02~B*38:02~DRB1*15:02~DQB1*05:01~DPB1*05:01:01G在HLA-DQB1和HLA-DPB1座位间进行了交换,形成HLA-A*02:06~C*03:03~B*35:01~DRB1*08:02~DQB1*04:02~DPB1*05:01:01G。结论:2个中国汉族人群家系分别发生了HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位间的基因重组。; 陈晨王炜王炜董丽娜陈男英朱发明; 关键词：基因重组

AllType NGS11位点测序试剂在HLA-DPB1基因分型中的模棱两可结果分析: 2023年; 目的统计分析AllType NGS 11位点测序试剂在Ion Torrent S5和Illumina Miseq 2种二代测序平台对HLA-DPB1基因进行分型检测时的模棱两可结果情况。方法采用One Lambda公司AllType NGS 11位点测序试剂盒检测434个患者或供者标本的HLA-DPB1基因,其中在Ion Torrent S5测序平台上检测了336个标本,在Illumina Miseq测序平台上检测了98个标本;并同步对434份标本采用PCR-SSO流式磁珠法复核HLA-DPB1基因。对HLA-DPB1*13∶01∶01/107∶01模棱两可等位基因,采用Sanger测序法检测区分。使用TypeStream Visual专业软件指定NGS法的HLA-DPB1基因分型结果,直接计数法统计分析模棱两可组合比例。结果 NGS法以HLA-DPB1命名*后第3区域数字作为高分辨结果进行统计,434个标本中共有357个标本出现模棱两可结果,占82.3%(357/434);其中Ion Torrent S5测序平台336个标本有275个标本存在模棱两可结果,占81.8%(275/336),表现出45种类型;Illumina Miseq测序平台98个标本有82个标本存在模棱两可结果,占83.7%(82/98),表现出27种类型。所有标本HLA-DPB1基因经PCR-SSO法复核,未发现NGS法漏检HLA-DPB1等位基因情况。Sanger测序法检测区分41个标本,共43个HLA-DPB1*13∶01∶01/107∶01模棱两可的等位基因,发现HLA-DPB1*13∶01∶01等位基因为25个,占58.1%(25/43);HLA-DPB1*107∶01等位基因为18个,占41.9%(18/43)。结论应用AllType NGS 11位点测序试剂仍有较高比例的HLA-DPB1基因模棱两可组合结果。利用Sanger测序法分析HLA-DPB1基因1号外显子可区分解决部分HLA-DPB1*13∶01∶01/107∶01模棱两可等位基因。; 董丽娜陈男英陈男英章伟王炜朱发明; 关键词：测序分析

人类白细胞抗原HLA-C＊04：01：01G组的区分鉴别被引量：1: 2014年; 本研究旨在区分人类白细胞抗原(HLA)-C*04:01:01G组内等位基因,并分析其与HLA-A、-B的连锁情况。通过收集HLA-C*04:01:01G组标本,采用多聚酶链反应序列分型法(PCR-SBT)分析HLA-C座位第2-7外显子序列,采用PCR-SBT方法对HLA-A、-B、-DRB1和-DQB1基因进行分型。结果表明:在189例HLA-C*04:01:01G组标本中,178例(94.2%)为HLA-C*04:01,11例(5.8%)为C*04:82;共检出HLA-C*04:01:01和C*04:82相关单体型72条,频率大于0.0050的单体型为26条;连锁分析显示HLA-C*04:01:01与A*02:03,A*02:07,A*11:01,A*33:03,B*13:01,B*15:01,B*15:05,B*15:27,B*40:01,B*54:01关联,而HLA-C*04:82与B*40:01关联。结论:HLA-C*04:01:01G组中存在HLA-C*04:01:01和HLA-C*04:82,在常规分型指定中应加以鉴别。; 王炜陈男英章伟何俊俊韩浙东秦斐董丽娜朱发明吕杭军; 关键词：HLA

AllType^(TM) Fastplex^(TM) NGS试剂基于Ion Torrent S5平台进行HLA基因分型的评价: 2023年; 目的AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂增加了HLA-Ⅱ类基因1号外显子序列分析,本文旨在评价该试剂基于Ion Torrent S5平台进行HLA基因分型的性能情况。方法利用AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1位点,使用TSV 2.0.0软件指定NGS法的HLA基因型。采用聚合酶链反应-序列分析法(PCR-SBT)复核部分标本进行质量控制。结果94份标本NGS法检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1位点,指定为单一组合分型结果为58份,占61.70%。结果分析中软件提示至少有一个等位基因报警的组合有432个,占76.60%。共有5个等位基因组合,报警存在外显子区域碱基错配,经PCR-SBT方法复核发现均为NGS软件错误的判定。随机抽取16份标本,NGS法和PCR-SBT方法检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1、-DPB1基因结果在高分辨水平上完全一致。增加HLA-Ⅱ类基因1号外显子序列,有效解决了DRB1*12:01:01/12:10、DRB1*15:02:01/15:140/15:149、DPB1*13:01/107:01组合的指定。结论AllType^(TM)Fastplex^(TM)NGS试剂增加分析HLA-Ⅱ类基因1号外显子,提升HLA分型指定能力。HLA基因型结果指定中应注意软件分析报警信息的处理,必要时采用其他方法进行验证,以保证分型结果准确性。; 何亿镇董丽娜王芳王炜章伟朱发明; 关键词：人类白细胞抗原

应用下一代测序技术进行HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可结果情况分析被引量：3: 2019年; 目的统计分析NGS法进行HLA-A、HLA-B基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例。方法对369例浙江省脐带血库标本采用NGS法检测HLA-A、HLA-B位点,并同步对其中94例标本采用PCR-SBT测序法测定HLA-A、HLA-B位点,余下275例标本采用PCR-SSO流式磁珠法检测。使用专业软件指定NGS法的HLA-A、HLA-B分型结果,直接计算法分析模棱两可组合比例。结果所有标本NGS法检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合,未发现NGS法遗漏等位基因情况。NGS法以HLA-A、HLA-B命名*后第四区域的数字作为高分辨水平统计,369例有34例标本出现模棱两可结果,占9.21%(34/369),其中只有2例标本HLA-A、HLA-B位点同时存在模棱两可结果。HLA-A位点有9例标本存在模棱两可结果,表现出8种类型;HLA-B位点有27例,25种类型,分别占标本总数的2.44%(9/369)、7.32%(27/369)。结论应用NGS技术仍有少量HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可组合结果。; 董丽娜赵烁贤王芳王芳何吉章伟; 关键词：测序分析

一例白血病患者HLA位点杂合性丢失的分析: 2022年; 目的分析1例白血病患者人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)杂合性丢失情况。方法采用聚合酶链反应序列特异性寡核苷酸探针法和聚合酶链反应测序方法对患者移植后外周血、头发毛囊、口腔黏膜拭子及其父母外周血进行HLA分型。采用23位点短串联重复序列(short tandem repeat,STR)测定试剂盒和本实验室建立的HLA区域内的6个STR位点方法对患者移植后的外周血、口腔黏膜拭子及其父母外周血进行STR位点检测。结果患者经父亲源单倍型造血干细胞移植后,外周血标本HLA基因型与父亲完全一致。患者头发毛囊标本HLA结果为HLA-A*02:01,24:02,C*03:03,03:04,B*13:01,15:01,DRB1*08:03,12:02,DQB1*03:01,06:01。口腔黏膜拭子为HLA纯合子,只存在父亲单倍型HLA-A*24:02-C*03:03-B*15:01-DRB1*08:03-DQB1*06:01,丢失了母亲单倍型HLA-A*02:01-C*03:04-B*13:01-DRB1*12:02-DQB1*03:01。患者移植后外周血23个STR位点与父亲完全一致。口腔黏膜拭子23位点短串联重复位点无丢失,但6号染色体上HLA区域的6个STR位点至少有4个发生了丢失。结论发现1例单倍型造血干细胞移植白血病患者的口腔黏膜拭子发生HLA杂合性丢失。; 王炜王芳王芳陈男英董丽娜章伟陈男英朱发明; 关键词：白血病患者 HLA基因分型造血干细胞移植

KIR3DL1启动子区域CpG岛甲基化对抗原表达的影响被引量：1: 2015年; 目的：探索KIR3DL1启动子区域CpG岛甲基化对抗原表达的影响。方法选择抗原高表达KIR3DL1＊01502和低表达KIR3DL1＊005样本，分别测定启动子区域碱基序列和启动子区CpG岛甲基化程度。对携带有KIR3DL1＊01502、KIR3DL1＊005的NK细胞分别采用5-aza进行去甲基化处理，利用流式细胞仪检测KIR3DL1抗原。结果 KIR3DL1＊01502和KIR3DL1＊005启动子区域－65和－269位存在碱基差异，这导致它们的启动子区域有两个不同的CpG岛。 KIR3DL1＊01502启动子区CpG岛高度甲基化，去甲基化后相应的细胞表面抗原表达显著增加。而携带KIR3DL1＊005的细胞去甲基化处理后，抗原表达没有明显变化。结论 KIR3DL1＊01502启动子区域CpG岛甲基化影响抗原的表达，但是不同抗原表达模式的KIR3DL1等位基因可能存在不同的调控机制。; 陶苏丹和艳敏董丽娜章伟何吉朱发明吕杭军; 关键词：杀伤细胞免疫球蛋白样受体甲基化启动子

董丽娜

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