薛亚杰
- 作品数：3 被引量：7H指数：1
- 供职机构：信阳师范学院生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 被子植物中核糖体失活蛋白基因家族分子进化研究被引量：1
- 2018年
- 利用34种具有全基因组数据的代表植物,通过生物信息分析方法,深入挖掘和分析不同植物类群基因组中RIPs基因家族的成员构成,推测其可能的扩增方式和功能分化,并探讨了该基因家族在植物中的总体进化趋势.采用BLAST和HMMsearch两种检索方法共鉴定出79个RIPs基因家族成员;通过序列比对和系统进化树的构建,发现RIPs在单双子叶中存在双起源,RIPs在两者分化之前就已存在.它们可能为适应复杂的环境而出现在早期陆生植物中,随后在长期进化过程中不断发生谱系的扩张和拷贝丢失,最后通过功能分化在不同植物中保留下来,其在被子植物进化的过程中有物种特异性的重复.
- 薛亚杰余亚军侯佳佳程柯韩雅彭袁红雨周思源程琳
- 关键词：核糖体失活蛋白被子植物分子进化
- 茶树SSR分子标记序列引物设计研究被引量：1
- 2016年
- SSR分子标记是一种基于DNA重复序列长度多态性的分子标记技术,是进行群体遗传学结构分析、构建遗传连锁图谱非常有力的工具。应用该技术的前提条件是要有相应的SSR引物,可利用CTAB法提取茶树基因组DNA,对茶树基因组DNA进行Mse I酶切连接获得目的基因,将目的基因进行PCR扩增后通过磁珠法洗脱,对产物进行测序,得到目的基因的序列组成。
- 程琳薛亚杰袁红雨
- 关键词：茶树SSR分子标记
- 大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究被引量：5
- 2019年
- 碱性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的Pfam蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91～815aa,相对分子量为10 273.88～91 300.38,理论等电点为4.56～10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大.
- 程琳薛亚杰付觉民刘旭阳曲骁冲代幸龙董沛峰徐月霞洪一峰姚远赵基海
- 关键词：大豆HLH转录因子系统发育分析
