张文
- 作品数：12 被引量：33H指数：3
- 供职机构：江苏大学临床医学院更多>>
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- 新型冠状病毒SARS-CoV-2亟待阐明的若干关键科学问题被引量：7
- 2020年
- 2019年底爆发的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)至今在全球已造成超过8万人感染、2700多人死亡(截至2020年2月25日)。虽然SARS-CoV-2与2003年爆发的SARS-CoV同属冠状病毒科、β冠状病毒属且相似性较高,全基因组同源性约79%,但是两者在病程、致死率等方面存在诸多差异。到目前为止,SARS-CoV-2的宿主(包括自然宿主和中间宿主)、传播途径、毒力变异等方面还亟待阐明。本文将对上述存在的若干科学问题进行简要阐述。
- 沈权王建强杨世兴王晓春张文
- 关键词：新型冠状病毒宿主
- 不明原因发热患者肺泡灌洗液病毒群落解析被引量：1
- 2020年
- 目的:分析不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒谱。方法:将58例肺泡灌洗液样本随机分为5组分别构建5个文库,利用病毒宏基因组学技术进行病毒群落分析,并对获得的细环病毒及鼻病毒进行阳性样本筛选。结果:肺泡灌洗液病毒群落组成中,指环病毒科占主体地位(19.4%),其次为圆环病毒科(11.0%),藻去氧核糖核酸病毒科(11.0%),人类内源性递转录病毒科(10.2%),痘病毒科(4.9%),逆转录病毒科(3.2%),帚状病毒科(2.3%),小RNA病毒科(0.6%);并发现了4株序列较长的细环病毒,根据细环病毒开放阅读框1进行系统进化分析,显示其与已知的细环病毒在核酸水平上有一定的差异。通过对细环病毒及鼻病毒阳性样本的筛选,发现细环病毒阳性率为11.3%,鼻病毒阳性率为10.0%。结论:应用病毒宏基因组学技术成功解析出不明原因发热患者肺泡灌洗液中的病毒群落组成,病毒群落中指环病毒科占比最高,其中细环病毒因发热导致的炎性环境以及患者免疫力低下而大量增殖。
- 李欣霖刘齐陈旭肖宇晴杨世兴张文陈建国
- 关键词：肺泡灌洗液鼻病毒系统进化分析
- 人类肠道病毒的特征和研究进展被引量：1
- 2020年
- 噬菌体和真核生物病毒是最具代表性的肠道病毒,其中CrAss噬菌体是人类病毒组的核心,人内源性逆转录病毒是人类基因组中稳定的遗传标志。噬菌体的溶原转化增强了其自身和宿主菌的进化优势,使其逐渐与宿主基因融为一体。本综述通过对肠道病毒的分类与特性、细菌-病毒-宿主的相互作用、研究肠道病毒的挑战与解决措施进行探讨,旨在给人类肠道病毒的研究提供证据。研究者应趋利避害,利用噬菌体特异性杀灭细菌的特性,研发相应的抗菌药物,使其成为肠道的守护军。病毒宏基因组测序的过程中会遇到许多已知、未知的挑战,本综述在讨论常规实验室经验的基础上,采用模拟社区模拟肠道的生态环境,减少环境因素对病毒检测的影响。
- 王惠玲朱柯颖王心灵张文
- 关键词：噬菌体细菌
- 新发林麝环状类病毒的鉴定和分析被引量：1
- 2022年
- 利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circoviruslike)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc。其基因组全长约3552 nt,GC含量39.00%,含有2个开放阅读框(ORF),即ORF1和ORF2。其中ORF1长度为1386 nt,ORF2长度为1953 nt。ORF1编码的氨基酸序列与来自猪血清圆环状病毒的(MH170058.1)序列相似度为34.31%。系统进化分析表明其与来自猪的圆环状病毒(MH170058.1)和鸭相关环状病毒(NC_030134.1)为同一进化分支。该病毒是否与林麝特定疾病相关有待于进一步流行病学研究。
- 刘齐杨世兴张文齐敦武付为国
- 关键词：林麝环状病毒系统发育分析
- 病毒宏基因组学方法鉴定出小熊猫粪便中一株新型指环状病毒被引量：2
- 2018年
- 研究从2份小熊猫粪便样品中检测到了一种新型的指环状病毒,命名为AV-Chengdu1(GenBank KX611132)。全基因组测序结果表明,其基因组全长约2 900nt,GC含量为49.8%;基因组结构分析表明其含3个开放阅读框(ORF1:1 743nt,ORF2:393nt,ORF3:399nt),其中ORF1编码产物的氨基酸序列与一株来自松貂的指环状病毒的氨基酸序列(JN704611)同源性为56.4%。系统进化分析表明其与来自松貂的指环状病毒(JN704611)紧密聚类。
- 郭靓骅吴孔菊华修国崔立张文齐敦武
- 关键词：小熊猫系统进化分析
- 中性粒细胞促进胃癌细胞体外迁移能力被引量：3
- 2016年
- 目的探讨中性粒细胞体外对胃癌细胞生物学特性的影响及机制。方法采用胃癌细胞条件培养基作用于中性粒细胞,实时荧光定量PCR检测其炎症因子基因(IL-8、CCL2、TNF-α)表达情况。用活化后的中性粒细胞条件培养基作用于胃癌细胞,MTT实验检测胃癌细胞增殖情况,流式细胞术分析胃癌细胞的细胞周期,细胞划痕实验检测胃癌细胞迁移能力,western blot检测胃癌细胞信号通路蛋白表达情况。结果经胃癌细胞条件培养基作用后,中性粒细胞IL-8、CCL2和TNF-α等炎症因子基因表达明显上调(P<0.05);活化的中性粒细胞条件培养基能够显著促进胃癌细胞体外迁移(P<0.01),但对胃癌细胞增殖无明显影响(P>0.05);经活化的中性粒细胞条件培养基作用后,胃癌细胞STAT3和ERK1/2信号通路蛋白磷酸化增加(P<0.05)。结论胃癌细胞条件培养基能够诱导中性粒细胞活化,通过分泌炎症因子激活胃癌细胞STAT3和ERK1/2信号通路促进其体外迁移能力。
- 朱琼芳张文袁潇许文荣张徐
- 关键词：胃癌中性粒细胞活化炎症因子迁移
- 镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔病毒谱构成
- 2021年
- 目的通过病毒宏基因组学分析镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔病毒谱构成。方法收集100份呼吸道疾病患儿鼻黏膜分泌物样本,提取核酸,采用高通量测序平台进行测序,通过病毒宏基因组学分析平台分析病毒谱。结果镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔微环境内病毒群落主要由腺病毒科(30.13%)、小RNA病毒科(24.04%)、冠状病毒科(11.22%)、指环病毒科(10.58%)、多瘤病毒科(10.58%)和副黏液病毒科(7.37%)等组成。所检测文库病毒主要为腺病毒科(30.13%)和小RNA病毒科(24.04%)。结论镇江地区上呼吸道病毒感染患儿鼻腔内病毒类型较为丰富,主要为腺病毒科和小RNA病毒科。上呼吸道病毒感染患儿鼻腔病毒谱的初步筛查,可为儿童病毒性上呼吸道感染的预防及临床治疗提供实验室依据。
- 王亚楠张文
- 关键词：上呼吸道腺病毒科小RNA病毒科
- 病毒宏基因组学在新发病毒快速确认中的优势被引量：3
- 2021年
- 新发病毒性传染病已成为人类健康的巨大威胁。自然界存在大量的未知新型病毒,它们可能构成人类未来新发传染病的传染源。由于未知新型病毒遗传信息与已知病毒差异较大,因而传统的病毒检测方法难以有效发现它们。近年来,随着病毒分子生物学和下一代测序等技术的发展,一些新的病毒高通量检测方法应用于未知新型病毒的挖掘中,其中病毒宏基因组学检测技术越来越成为人类猎取未知病毒的高效工具。本文阐述病毒宏基因组学技术的原理、主要技术流程,其在新发病毒快速确认中的优势以及新发病毒感染与特定疾病的关联分析策略,并对该技术在未来临床病毒感染诊断中的应用提出展望。
- 张文代紫苑鲍思雯茅庆庆
- 关键词：下一代测序新发传染病
- 中性粒细胞在肿瘤中作用的研究进展被引量：12
- 2017年
- 近年来研究发现,中性粒细胞具有表型和功能可塑性。一方面,中性粒细胞可通过细胞毒和免疫活化作用发挥抗肿瘤效应;另一方面,在肿瘤及其微环境作用下中性粒细胞可发生表型和功能转变,推动肿瘤发生、生长和转移,促进肿瘤血管生成,以及介导肿瘤免疫抑制。临床研究表明,肿瘤患者外周血和肿瘤组织中性粒细胞数量增加,且与肿瘤恶性进展及预后不良密切相关。本文就中性粒细胞在肿瘤中的作用、机制以及临床意义进行综述。
- 张文张鹏徐雪莹许文荣张徐
- 关键词：肿瘤中性粒细胞
- 1例引起突发性耳聋的猪链球菌的鉴定及分子流行病学分析被引量：2
- 2020年
- 目的分离鉴定1例突发性耳聋患者血液和脑脊液分离的猪链球菌并进行分子流行病学分析。方法采用VITEK-2 Compact微生物系统进行初步鉴定和药敏试验,PCR扩增细菌的16S rRNA基因、7个管家基因及4种毒力基因。通过实时荧光定量PCR进行血清学分型,多位点序列分型(MLST)进行序列分型(STs)。结果传统细菌鉴定方法和16S rRNA基因测定方法均鉴定为猪链球菌,实时荧光定量PCR鉴定为猪链球菌2型,MLST分型为ST7,毒力因子溶血素基因、细胞外蛋白因子编码基因、荚膜多糖编码基因均为阳性。结论引起患者突发性耳聋的细菌为我国常见的猪链球菌2型,属于ST7型强毒株。
- 郑礼杰李欣霖张文陈建国谈忠鸣许金凤
- 关键词：猪链球菌突发性耳聋多位点序列分型毒力因子
