胡跃明
- 作品数:10 被引量:2H指数:1
- 供职机构:深圳大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 针对SOX4基因靶点的小干扰RNA、短发卡RNA及重组载体和应用
- 本发明涉及分子生物学、基因工程技术以及生物医药领域,具体涉及一种针对SOX4基因靶点的小干扰RNA、短发卡RNA及重组载体和应用。小干扰RNA包括SEQ ID NO.1所示的正义链和SEQ ID NO.2所示的反义链。短...
- 郑多韩荣飞肖田徐亚菲胡跃明汪天富
- 文献传递
- 一种新的沙门氏菌成簇重复序列的预测方法被引量:1
- 2017年
- 目的建立一个新的、直观的鉴定和显示细菌基因组成簇重复序列的方法,了解沙门氏菌基因组成簇重复序列的组成特征。方法直接将细菌的基因组用滑动窗口法切割成重叠片段,每一个片段自体比对,利用Pip Maker生成共线性图。通过共线性图特征识别成簇重复序列区。结果用所设计方案-成簇重复序列预测器(CRpred)对鼠伤寒沙门氏菌LT2菌株基因组进行扫描,总共鉴定出151个成簇重复区。特征分析表明,这些成簇重复区包含低拷贝简单串联重复、高拷贝简单串联重复、间隔串联重复、反向回文重复和反向间隔重复等5种类型。此外,沙门氏菌基因组中有9个复杂重复区域无法使用上述模式进行归类。结论提出了一个新的、简便直观的基因组成簇重复序列的鉴定方法,为搜寻成簇的、规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)、数目可变串联重复序列(VNTR)以及其他重复序列相关研究提供支持。
- 程希郭志荣胡跃明汪业军
- 关键词:沙门氏菌数目可变串联重复序列
- 沙门氏菌Ⅲ型分泌候选基因yiiG的比较基因组分析被引量:1
- 2017年
- 目的研究沙门氏菌Ⅲ型分泌候选基因yiiG的分布和进化。方法利用序列比对检测yiiG分布,通过比较基因组学和进化树重建分析基因进化史。结合RNA-seq数据,分析yiiG和其他沙门氏菌毒性基因表达相关性。生物信息预测Yii G蛋白是否含有公认的Ⅲ型分泌系统(T3SS)分泌信号。结果 yiiG在S.enterica种内enterica亚种高度保守,在其他亚种多变;S.bongori种内无分布。在沙门氏菌外其他菌属中,仅在部分志贺氏菌和大肠杆菌中有yiiG分布。所有yiiG所在基因组近邻区域位置保守。S.enterica种内enterica亚种的大量血清型中,yiiG基因上游存在一个head-to-head排列的高同源未注释基因(yiiGRrc)。RNA-seq数据分析揭示yiiG在细菌侵染环境刺激下表达、表达水平和T3SS相关毒性基因高度相关。各种新效应蛋白预测软件分析提示Yii G具有T3SS分泌/转运信号。结论 yiiG基因座为一个古老、遗传重组活跃的热点区域;yiiG与沙门氏菌毒性高度相关;另外,新鉴定的yiiG密切相关基因yiiGRrc,为进一步理解yiiG基因家族及其功能分化研究奠定基础。
- 程希胡跃明郭志荣汪业军
- 关键词:沙门氏菌比较基因组
- 针对NFAT3基因靶点的短发卡RNA、重组载体及应用
- 本发明公开了一种针对NFAT3基因靶点的短发卡RNA、重组载体及应用,所述基因靶点的序列如SEQ ID NO:3所示,所述RNA的正义链序列如SEQ ID NO:1所示,所述RNA的反义链序列如SEQ ID NO:2所示...
- 郑多肖田黄诗莹胡跃明
- 文献传递
- 诱导辣椒素受体Y739位点的特异性抗体的多肽
- 本发明公开了一种诱导辣椒素受体Y739位点的特异性抗体的多肽;在制备治疗与鳞状细胞皮肤癌的转化有关的疾病的药物组合物过程中,采用所述多肽获得辣椒素受体Y739位点的特异性抗体,并且所述特异性抗体包含在所述药物组合物中。
- 郑多肖田朱江徐亚菲汪业军王亮胡跃明宋硕
- 高通量筛选抗亨廷顿疾病活性物质的植物细胞模型的建立方法及其应用
- 本发明涉及植物基因工程领域,公开了一种高通量筛选抗亨廷顿疾病活性物质的植物细胞模型的建立方法,包括:构建表达HttQ蛋白的植物表达载体;利用所述植物表达载体转化植物细胞,获得含有HttQ基因的植物细胞。本发明所述方法制备...
- 郑易之刘国宝胡跃明刘昀
- 文献传递
- 用于子痫前期风险评估的SNP组合及其应用
- 本申请涉及基因检测技术领域,尤其涉及一种用于子痫前期风险评估的SNP组合及其应用。SNP组合包括3个SNP位点中的至少一个,3个SNP位点在SNP数据库中的rs号为:rs147440497、rs149025589和rs1...
- 汪业军倪东徐晨红周璐胡跃明方琼芳
- 高通量筛选抗亨廷顿疾病活性物质的植物细胞模型的建立方法及其应用
- 本发明涉及植物基因工程领域,公开了一种高通量筛选抗亨廷顿疾病活性物质的植物细胞模型的建立方法,包括:构建表达HttQ蛋白的植物表达载体;利用所述植物表达载体转化植物细胞,获得含有HttQ基因的植物细胞。本发明所述方法制备...
- 郑易之刘国宝胡跃明刘昀
- 文献传递
- 针对NFAT3基因靶点的短发卡RNA、重组载体及应用
- 本发明公开了一种针对NFAT3基因靶点的短发卡RNA、重组载体及应用,所述基因靶点的序列如SEQ ID NO:3所示,所述RNA的正义链序列如SEQ ID NO:1所示,所述RNA的反义链序列如SEQ ID NO:2所示...
- 郑多肖田黄诗莹胡跃明
- 诱导辣椒素受体Y739位点的特异性抗体的多肽
- 本发明公开了一种诱导辣椒素受体Y739位点的特异性抗体的多肽;在制备治疗与鳞状细胞皮肤癌的转化有关的疾病的药物组合物过程中,采用所述多肽获得辣椒素受体Y739位点的特异性抗体,并且所述特异性抗体包含在所述药物组合物中。
- 郑多肖田朱江徐亚菲汪业军王亮胡跃明宋硕
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