刘桂荣
- 作品数:19 被引量:18H指数:3
- 供职机构:哈尔滨医科大学更多>>
- 发文基金:教育部留学回国人员科研启动基金国家自然科学基金黑龙江省研究生创新科研项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>
- 鸡沙门菌基因组物理图被引量:1
- 2006年
- 目的建立鸡沙门菌287/91株的基因组物理图,与鸡沙门菌SARB21以及鼠伤寒沙门菌LT2的基因组物理图进行比较,以找出同种细菌不同菌株之间以及近缘菌之间基因组的差异,进而探讨细菌基因组进化的一般规律。方法细菌基因组DNA用XhaⅠ、AvrⅡ和Ⅰ-CeuⅠ进行酶切,再用脉冲场凝胶电泳方法分离出DNA片段,通过Tn10插入等方法对这些片段进行精确排列。结果构建了鸡沙门菌287/91株的基因组物理图。与SARB21株的基因组物理图比较发现,二者相对于鼠伤寒沙门菌LT2有相似的插入和缺失片段。结论鸡沙门菌287/91株与SARB21株基因组很相似,其主要差异在于rrn操纵子DNA介导的同源性重组发生的具体部位不同,导致了基因组DNA片段的不同排列,因而造成二者不同的基因组结构。
- 刘桂荣刘葳峤祁丹妮何晓燕张凤民刘树林
- 关键词:基因组重排脉冲场凝胶电泳
- 大肠埃希菌临床分离株的基因组结构分型研究
- 2004年
- 目的 通过基因组结构分析对临床分离的大肠埃希菌进行分型 ,并探讨型别与临床疾病的关系。方法 取临床不同疾病病人的痰、尿、血、分泌物等标本 ,分离大肠埃希菌。用I -CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后 ,根据酶切图谱的异同进行分型。结果 从临床上分离的 6 4株大肠埃希菌中 ,6 2株有 7个I -CeuI酶切位点 ,2株有 8个I -CeuI酶切位点。菌株间I -CeuI酶切图谱差异明显。这些菌株根据基因组结构的差异分为 32个型 ,某些疾病与特定基因组型密切相关。结论 临床分离的大肠埃希菌基因组结构存在多样性 ,其与临床疾病之间存在一定的对应关系 ,但尚需大宗病例进一步研究。
- 衣美英高东田刘桂荣朱永红朱万孚刘树林
- 关键词:大肠埃希菌基因组结构临床分离株脉冲场凝胶电泳酶切图谱组型
- 72株大肠埃希菌参考菌株的基因组分型及种系发育关系被引量:3
- 2013年
- 目的通过两种分子生物学分型方法对72株分离自不同地域不同宿主的大肠埃希菌进行分型以及种系进化研究,并比较两种方法的差异。方法利用72株大肠埃希菌的7个持家基因序列进行多位点序列分型;培养大肠埃希菌,用I-CeuI酶切全基因组DNA以及用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后,根据酶切图谱的异同进行脉冲场凝胶电泳分型。结果这些菌株根据多位点序列分型可以分为49个型,而通过I-CeuI酶切条带差异可以分为68个型,二者有一定程度的重叠。结论脉冲场凝胶电泳分型的分辨率更高,并且72株大肠埃希菌的基因序列以及基因组结构都存在多样性。
- 王春晓王晓宇刘桂荣刘树林
- 关键词:大肠埃希菌多位点序列分型脉冲场凝胶电泳
- 沙门菌病原性的分子进化
- 刘树林刘桂荣冯晔李用国李庆海包红霞朱松岭王春晓
- 背景:课题组在前期工作中发现,某些重要致病菌的进化可能遵循趋异进化与趋同进化这一模式.来自同一祖先的细菌,在不同的生存环境中,由于碱基变异或外来基因的获得,可进化为各种不同的致病菌(宿主不同或所致疾病不同),此为趋异进化...
- 关键词:
- 关键词:疾病治疗动物实验
- 细菌基因组结构:识别种系群的分子标志(英文)被引量:2
- 2002年
- 目的 :评价细菌基因组结构作为种系标志在细菌亲缘关系识别中的应用。方法 :本研究选用 3个属的细菌 :Klebsiel la ,Neisseria以及Vibrio。为得到完整的基因组DNA ,整个提取的操作过程都在琼脂糖凝胶中进行。经proteinaseK除蛋白后 ,基因组DNA置于TE缓冲液中待用。内切酶Ⅰ CeuⅠ是本研究中主要的工具酶。酶切后的基因组DNA经脉冲场电泳分离。结果 :Klebsiella的所有菌株 (两个种 ,即Klebsiellapneumoniae和Klebsiellaoxytoca)都有一个共同的基因组结构 ,而这一“Klebsiella基因组结构”与Escherichiacoli或Salmonella的基因组结构很相似 ,其主要不同之处有 3点 :(1)有 8个rrn操纵子 (Escherichiacoli和Salmonella各有 7个 ) ;(2 )基因组较大 ;(3)Ⅰ CeuⅠE片段易位。以往学术界认为Neisseria具有高度易变和多态的基因组结构。而我们的研究结果表明 ,Neisseria的基本基因组结构是相对稳定的。我们比较研究了 30 0株N .meningitidis,结果仅仅发现了少数几个不同的基因组结构。其中Z2 4 91株代表 5 0 %的群体 (Ⅰ型基因组结构 ) ,MC5 8株代表 2 0 %的群体 (Ⅱ型基因组结构 ) ,N0 4 5株代表 17%的群体 (Ⅲ型基因组结构 )。已知Z2 4 91和MC5 8代表不同的种系群 。
- 刘树林刘桂荣李绍贤刘葳峤郑君芳朱万孚谷鸿喜郭晓奎马佳毓K.E.Sanderson周宇光R.N.Johnston
- 关键词:基因结构I
- 一株从人体肠道中分离的能产生抗癌活性代谢产物的放线菌BI87及其用途
- 本发明公开了一株从人体肠道中分离的能产生抗癌活性代谢产物的放线菌BI87及其用途。本发明从人体肠道中分离得到的能产生抗癌活性代谢产物的放线菌,命名为BI87,保藏在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心,其保藏编号为...
- 刘树林周玉洁赵丹丹刘慧迪李佳静陈浩庭刘桂荣沐晓芹
- 文献传递
- 幽门螺杆菌临床分离株的基因组结构多样性研究
- 2007年
- 我们建立并改进了幽门螺杆菌(Hp)的厌氧培养方法,将通过胃镜获取的临床患者的胃部黏膜组织研磨均匀,并在特定培养基中培养出43株Hp。随后用I-CeuI酶切及脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行基因组结构的初步分析。结果发现Hp具有多样的基因组结构,一种遗传型引起一种疾病。认为拟用基因组结构分析方法联合其他分子技术建立可靠的鉴定分型方法将有助于早期诊断及早期治疗。
- 郑君芳刘桂荣刘树林
- 关键词:幽门螺杆菌凝胶电泳胃镜基因组结构
- E.coli临床分离株的基因组结构分型被引量:2
- 2003年
- 目的 通过基因组结构分析对临床分离的Escherichiacoli(E .coli)进行分型 ,并探讨分型与临床疾病的关系。方法 取临床不同疾病病人的痰、尿、血、分泌物等标本 ,分离E .coli。用I CeuⅠ酶切全基因组DNA ,用脉冲场凝胶电泳分离DNA片段后 ,根据酶切图谱的异同进行分型。结果从临床上分离的 6 4株E .coli中 ,6 2株有 7个I CeuⅠ酶切位点 ,2株有 8个I CeuⅠ酶切位点。菌株间I CeuⅠ酶切图谱差异明显。这些菌株根据基因组结构的差异分为 32个型 ,分型与疾病之间的对应关系分散。结论 临床分离的E .coli基因组结构存在多样性 ,其与临床疾病之间的关系有待进一步探讨。
- 衣美英刘桂荣朱永红朱万孚刘树林
- 关键词:E.COLI临床分离株基因组结构
- 基因组结构揭示的根瘤菌系统发育群被引量:1
- 2003年
- 阐明根瘤菌之间的系统发育关系,可使人们更有效地利用这些自然资源,因而对农业生产和环境保护具有重大意义。通过Ⅰ-CeuⅠ酶切表明64株根瘤菌的基因组结构特征,揭示根瘤菌的系统发育关系。结果表明,64株根瘤菌依据基因组结构特征可聚为21个系统发育群,这些群与16S rRNA分子聚群结果大致相符,但与现行的根瘤菌分类体系所得结果有较大差异。
- 郑君芳刘桂荣朱万孚周宇光刘树林
- 关键词:基因组结构根瘤菌固氮DNA序列分析
- 沙门菌致病岛7的获取对沙门菌进化的影响
- 2014年
- 致病岛是负责编码细菌毒力相关基因的染色体片段,它一般具有相对分子量较大,处于染色体特定位置(如tRNA位点内或附近,或位于与质粒,噬菌体整合位点附近),其G+C含量与宿主细菌有明显差异等特点…。大多数致病岛两端具有顺向重复序列或插入序列。致病岛可以在不同细菌之间进行水平平移,尤其是噬菌体和质粒介导的水平平移,这与病原菌的进化是有密切联系的。
- 赵尔樱谭雪琴周玉洁魏晓维金刚丁凤枝刘桂荣刘树林
- 关键词:毒力因子