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郭丽: 作品数：12 被引量：72H指数：5; 供职机构：南京邮电大学地理与生物信息学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金江苏省高校自然科学研究项目江苏省自然科学基金更多>>; 相关领域：文化科学生物学医药卫生更多>>

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测序数据特征选择方法比较:以microRNA为例: 背景与目的:生物技术的蓬勃发展,尤其是第二代测序技术,使得生物数据的规模快速增长.面对生物大数据,基于统计和机器学习思想,特征选择方法日益增多.因此,比较这些方法的效果对于进一步研究有着很重要的意义.方法:本研究采用模拟...; 杨晟张慧郭丽赵杨陈峰

生物医学大数据背景下学习生物信息学的学科特点分析被引量：4: 2016年; 大数据时代,特别是几乎无穷无尽的生物医学大数据,给生物信息学及统计学带来了新的机遇和挑战,同时也形成对生物学、统计学和计算机信息科学交叉领域中富有经验的专业人才的高度需求。生物信息学在大数据时代的重要性不言而喻,因此其教学也显得尤为重要。文章通过分析生物统计学专业学生在学习生物信息学课程的优势和劣势,旨在结合生物统计学专业的特点,为生物信息学教学内容及教学方式的调整提供参考,从而激发学生的学习兴趣,提高教学效果。; 郭丽胡栋王俊吴建盛汤丽华; 关键词：生物信息学生物统计学大数据

互联网与新媒体时代对高校课程思政的影响及提升对策研究被引量：5: 2022年; 高校的专业课教学不但承担着“授业”的职责,更肩负着“传道”的重任,以实现立德树人的根本目标。而课程思政则是落实立德树人根本任务的重要战略举措,也是高校思政教育改革的重要方向。在无处不在的网络环境下,课程思政建设显得至关重要。教师应努力做好“把门人”,以形成良性循环的健康网络环境,努力建设专业思政教师队伍,不断优化网络授课方法,积极挖掘专业课程所蕴含的思政元素,融入教学的各个内容模块及环节中。以实现思政教育与知识体系教育的有机统一,让互联网与新媒体成为课程思政的广阔平台。; 郭丽江畅; 关键词：互联网新媒体

新型混合式生物信息学教学模式研究被引量：5: 2016年; 具有典型学科交叉特点的生物信息学相关课程,传统的教学模式不足以更好地开展此课程。本文基于生物信息学导论的课程特点及知识模块,结合当前应用广泛的教学手段,提出多种教学手段联合应用的一种新型教学模式。; 郭丽胡栋王俊; 关键词：混合式教学

基于R语言的医学统计学教学实践和探索——以南京邮电大学生物医学工程专业为例被引量：7: 2022年; 医学统计学是生物医学工程专业人才培养的重要基础课程。本课程知识点具有概念抽象、理论难懂的特点,需在医学大数据背景下进行统计分析和可视化展示,以揭示大数据中所蕴含的潜在信息和规律。在教学中引入R语言,借助其编程语法通俗、易掌握及可扩展等优点,将抽象的概念和晦涩的理论具体化和可视化,通过教学改革和课程设计创新,加深学生对理论的学习和掌握,做到提升教学效果的同时,也有助于培养和提高创新思维和编程能力。; 郭丽江畅王俊; 关键词：课堂教学改革 R语言生物医学工程专业

表观基因组甲基化数据的统计分析方法被引量：1: 2016年; 近年来,全基因组关联研究（genome-wide association studies,GWAS）取得了举世瞩目的成就,识别了成千上万个复杂疾病（complex disease）遗传易感位点[1]。然而,疾病的发生还与遗传以外的诸多因素有关,包括表观遗传（epigenetics）的改变[2]。这类问题的阐述需要通过与全基因组关联研究类似的大规模、; 张秋伊陈峰魏永越郭丽赵杨; 关键词：表观遗传全基因组复杂疾病易感位点

医学院校生物统计学专业生物信息学教学探索被引量：15: 2013年; 生物信息学是一门新兴的前沿交叉学科。多种专业选择其作为必修课或选修课。由于专业性质及对学生培养目标的不同,生物信息学课程在知识体系和教学方法等方面都有所区别。文章就医学院校生物统计学专业如何优化生物信息学教学内容及方法等进行探索,并对如何提高教师的专业水平进行讨论。; 郭丽赵杨柏建岭于浩陈峰; 关键词：生物统计学生物信息学教学

大数据背景下的生物信息学研究现状被引量：23: 2017年; 生物信息学(Bioinformatics)已成为整个生物医学领域发展的重要组成部分及研究前沿。生物信息学的迅速发展是生物医学发展新阶段的必然结果,特别是伴随着高通量测序技术发展而产生的海量多元组学数据,为该学科的快速发展提供了丰富的数据资源,也提出了极大的挑战。文中基于大数据背景,拟从该交叉学科的迅速发展,主要研究模块,基础背景等方面分析生物信息学的研究现状。; 王俊郭丽吴建盛汤丽华胡栋; 关键词：生物信息学

miRNA异构体:miRNA序列多样性: 2016年; 微RNA(microRNA,miRNA)是一类抑制基因表达的调控分子,在多种生物学进程中扮演重要角色。近来,基于新一代测序技术获得的小RNA测序数据发现,对于某一miRNA来说,它并不是单一的序列,而是由一系列长度/序列及表达不同的异构微RNA(isomicroRNA,isomiRNA/isomiR)所组成。这些isomiR表达多样且序列多样,甚至引入多样的5'端及种子区域。特定miRNA位点在疾病组织中可具有异常的表达模式,现已证实,部分isomiR具有重要的生物学功能。所关注的经典miRNA序列,其实仅是多重isomiR序列中的1条特殊序列,仅从miRNA角度的研究已不足以揭示小RNA的奥秘,全面的研究应同时在miRNA和isomiR中开展,由此可进一步拓宽miRNA的研究思路。本文主要从isomiR的生物学特点、表达及功能等方面进行介绍。; 徐畅青相升龙郭丽; 关键词：微RNA

密码子偏好角度对比研究不同物种肽编码sORFs异同特征: 2021年; 具有蛋白质编码能力的小开放阅读框(sORFs)是一类长度小于100个氨基酸的重要基因组元件,在许多生物过程中发挥着重要作用.然而,由于其序列长度短、表达水平低和缺乏有效的研究方法,多年来在基因组中对sORFs编码肽的研究一直被忽视.近年来,随着核糖体谱、蛋白质组等测序技术的发展,越来越多的研究发现肽编码的转录因子在真核生物和原核生物中发挥着重要的生物学功能,从而引起了人们对转录因子的广泛关注,并逐渐成为生命科学的一个重要研究领域.在此背景下,从密码子偏好性的角度比较了人、小鼠、拟南芥和原核生物中肽编码的sORFs的序列特征.结果表明,不同物种肽编码sORFs具有一定的共性。其中,小鼠、人和原核生物的sORFs密码子偏好性较弱,大多数sORFs密码子的CAI值较低,表明这4个物种的sORFs密码子表达水平较低.进一步的分析表明,不同物种来源sORFs具有一定程度的结构无序特征.; 钱博文王瑞萍姜雯雯夏道良郭丽于家峰; 关键词：基因组