刘霞
- 作品数:24 被引量:45H指数:4
- 供职机构:浙江省动物疫病预防控制中心更多>>
- 发文基金:浙江省公益性技术应用研究计划项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 浙江省猪圆环病毒2型流行株遗传变异分析
- 2023年
- 为了解浙江省猪圆环病毒2型(PCV2)基因型和遗传变异情况,本试验对2021年采自浙江省不同地区的27份PCV2阳性病料进行PCV2全基因组扩增、克隆和测序,并将其全基因组、ORF 2基因核苷酸序列及其推导的Cap蛋白氨基酸序列与不同国家和地区的流行株进行遗传变异分析。结果显示,27株PCV2流行株之间全基因组和ORF 2基因核苷酸序列同源性分别为91.0%~99.9%和81.7%~99.9%,与不同国家和地区的PCV2参考株之间全基因组和ORF 2基因核苷酸序列同源性为90.7%~99.9%和81.8%~100%。遗传进化树分析显示,27株PCV2流行株分别处于4个分支,其中8株为PCV2a基因型,6株为PCV2b基因型,12株为PCV2d基因型,1株为PCV2e基因型。27株PCV2流行株Cap蛋白的糖基化位点和核定位信号区氨基酸序列呈高度保守,B细胞抗原表位和T细胞抗原表位存在多个氨基酸突变。结果表明,浙江省多种基因型PCV2共存,以PCV2d基因型流行为主。本试验结果对于了解浙江省PCV2流行毒株的基因型和变异状况具有重要的意义。
- 张璐安慧婷王雅婷黄靖张红丽董建斐孙仁杰刘霞赵灵燕徐辉谢荣辉
- 关键词:猪圆环病毒2型基因型遗传变异分析
- 两种H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的敏感性和特异性评价被引量:1
- 2022年
- 为评价两种(A、B)H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的检测性能,对50份疑似感染H7N9流感病毒的禽拭子样品进行H7N9流感病毒核酸检测,使用TG-ROC分析方法筛选荧光RT-PCR最适Ct值(阈值),通过2×2列联表分析两种试剂盒的敏感性和特异性,并用Kappa检验评估其一致性。结果显示:以国家禽流感参考实验室的鸡胚病毒分离鉴定结果为“金标准”,A和B两种试剂盒的敏感性、特异性分别为90.9%(10/11)、56.4%(22/39)和54.5%(6/11)、94.9%(37/39);两种试剂盒检测结果差异较大,Kappa值为0.28。TG-ROC分析得出:A试剂盒的检测阳性最适阈值为33,对应的敏感性和特异性为90.91%和92.31%;B试剂盒的检测阳性最佳阈值为37,对应的敏感性和特异性分别为81.82%和87.18%。通过调整阈值,A试剂盒的敏感性和特异性均达到90%以上,B试剂盒均达到81%以上,Kappa值为0.85,检测结果一致。结果表明,虽然不同H7N9流感病毒荧光RT-PCR试剂盒的检测性能有差别,但通过调整阈值,可以达到检测所需的最适敏感性和特异性,从而增加临床检测结果的可靠性。本研究为H7N9流感病毒检测试剂盒的应用提供了指导。
- 冯肖肖赵灵燕刘霞黄靖陈伟良董建斐张璐徐辉
- 关键词:敏感性特异性
- 猪嵴病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立和应用被引量:7
- 2018年
- 根据猪嵴病毒3D基因保守序列设计引物和TaqMan探计.通过优化反应体系.建立了猪嵴病毒荧光定量RT—PCR检测方法,并对该方法进行特异性、敏感性和重复性评价;同时以10倍梯度稀释的质粒标准品建立荧光定量RT—PCR的标准曲线,构建定量分析模型。结果显示.建立的方法能特异性检测猪嵴病毒,与其他引起猪腹泻的病毒无交叉反应,对标准品的检测灵敏度达10copies/pL;标准曲线CI值和模板终浓度在107~10copies/μL范围内有良好的线性关系;重复性试验变异系数均小于2.5%。对139份猪粪便样品进行检测,荧光定量RT-PCR阳性检出率为30.94%(43/139),常规RT—PCR为29.50%(41/139)。本研究建立的荧光定量RT-PCR可用于猪嵴病毒的快速检测和流行病学调查。
- 谢荣辉刘霞赵灵燕倪柏锋柴娟王雅婷吴赟竑徐辉
- 关键词:荧光定量RT-PCR
- 2018-2020年浙江省禽白血病血清学调查及分析被引量:1
- 2023年
- 为了解浙江省禽白血病病毒(ALV)流行情况,本研究对2018-2020年浙江省定点监测场点开展ALV J亚群和A/B亚群抗体检测,共检测来自9个地市518个场次的19 224份次鸡血清样品,通过对时间、群间、空间等情况分析,掌握当前浙江省禽白血病感染及分布情况。结果显示:浙江省ALV-J平均个体阳性率为11.63%,平均场次阳性率为61.78%,ALV-A/B平均个体阳性率为3.52%,平均场次阳性率为39.77%;不同群体、地市均有感染分布。监测结果分析表明,浙江省禽白血病存在一定范围的感染,种鸡场内相对可控但感染有上升,研究结果可为浙江省禽白血病防控、净化提供依据。
- 孙冰冰刘霞黄晓兵张璐黄靖董建斐安慧婷周彩琴徐辉赵灵燕
- 关键词:禽白血病血清学流行病学调查
- 非洲马瘟检测诊断及防控建议被引量:2
- 2020年
- 非洲马瘟是由属于呼长孤病毒科环状病毒属的非洲马瘟病毒引起,以发热、皮下水肿和病毒血症为主要临床特征,主要通过库蠓在马属动物之间传播,世界动物卫生组织(OIE)将其列为必须报告的动物疫病,我国将其列为一类动物疫病。该文概括比较非洲马瘟的临床诊断、实验室病原学、血清学等检测诊断方法,在实际应用中根据不同检测方法的优点和局限性,综合考虑做出针对性选择。
- 薛银张红丽黄靖王雅婷冯肖肖刘霞张传亮赵灵燕
- 关键词:非洲马瘟
- 浙江省部分地区猪病毒性腹泻的流行病学调查被引量:3
- 2018年
- 猪病毒性腹泻是一类呈全国性散发流行的急性、接触性肠道传染病。临床上以引起仔猪水样腹泻、呕吐、脱水消瘦甚至死亡为典型症状,成年猪多不可见临床症状或仅有一过性软便。该病病原主要有猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(transmissible gastroenteritis virus,TGEV)和猪轮状病毒(porcine rotavirus,PoRV),是影响我国生猪养殖业经济效益和健康可持续发展的重要因素之一。
- 刘霞董建斐谢荣辉张红丽刘爱军黄靖黄晓兵赵灵燕徐辉
- 关键词:病毒性腹泻流行病学调查猪传染性胃肠炎病毒猪流行性腹泻病毒VIRUS
- 猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒双重荧光定量PCR方法的建立和应用被引量:3
- 2023年
- 根据猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒保守基因序列设计引物和探针,通过优化反应体系,建立了猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒双重荧光定量PCR检测方法,评估了该方法的特异性、敏感性及重复性。结果显示,该方法能特异性扩增猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒核酸,与猪圆环病毒2型、猪瘟病毒、猪流行性腹泻病毒、日本脑炎病毒、猪圆环病毒1型、猪细小病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒及猪博卡病毒无交叉反应。猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒的最低检测限均为10 copies/μL;批内和批间重复性试验的变异系数均小于3%。用建立的双重荧光定量PCR方法对87份猪组织样品进行检测,结果显示,猪伪狂犬病病毒和猪圆环病毒3型的阳性率分别为17.24%和24.14%。上述结果表明,本研究建立的双重荧光定量PCR方法具有特异、敏感、稳定和快速的优点,可用于猪圆环病毒3型和猪伪狂犬病病毒鉴别诊断和流行病学调查。
- 赵灵燕张璐安慧婷王雅婷黄靖张红丽董建斐刘霞孙仁杰徐辉谢荣辉
- 关键词:猪伪狂犬病病毒
- 猪圆环病毒2,3,4型三重荧光定量PCR检测方法的建立和应用被引量:5
- 2022年
- 为建立同时检测猪圆环病毒2型(PCV2)、3型(PCV3)和4型(PCV4)的方法,根据GenBank中的PCV2、PCV3和PCV4基因保守序列设计引物和探针,通过反应体系优化后,建立同时检测PCV2、PCV3和PCV4的三重荧光定量PCR方法,并对其特异性、敏感性、稳定性、与普通PCR方法的一致性进行评价。结果显示,建立的方法可特异性检测PCV2、PCV3和PCV4,与猪细小病毒、猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒1型、猪伪狂犬病病毒、口蹄疫病毒、猪流行性腹泻病毒和猪传染性胃肠炎病毒无交叉反应产生。批间与批内重复性试验变异系数系数均小于3%。对83份猪组织样品进行检测,其中PCV2、PCV3和PCV4阳性率分别为68.67%,28.92%,20.48%。结果表明建立的三重荧光定量PCR方法具有敏感度高、特异性强和稳定性好的优点,可用于PCV2,PCV3,PCV4型的流行病学调查和鉴别诊断。
- 谢荣辉王雅婷安慧婷黄靖张红丽刘霞冯肖肖陈伟良董建斐张璐徐辉赵灵燕
- 关键词:猪圆环病毒2型
- 一种猪伪狂犬病毒和猪圆环病毒3型双重荧光定量PCR检测引物和探针、试剂盒及方法
- 本发明提供了一种猪伪狂犬病毒和猪圆环病毒3型双重荧光定量PCR检测引物和探针、扩增试剂及方法,属于病毒检测技术领域,所述引物探针包括引物PRV gD real‑F1、PRV gD real‑R2、PCV3‑real‑F2...
- 谢荣辉赵灵燕徐辉王雅婷姚春雷黄靖张红丽董建斐刘霞冯肖肖孙冰冰薛银柴娟安慧婷
- 文献传递
- 基于液相芯片技术的7种猪繁殖障碍疾病相关病毒检测用引物探针、试剂盒及其应用
- 本发明提供了基于液相芯片技术的7种猪繁殖障碍疾病相关病毒检测用引物探针组、试剂盒及其应用,属于病毒检测技术领域。本发明提供的引物探针组,包括猪瘟病毒检测引物探针、美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒检测引物探针、猪圆环病毒2型检...
- 谢荣辉赵灵燕徐辉王雅婷黄靖孙冰冰张红丽董建斐刘霞冯肖肖张璐安慧婷薛银柴娟虞一聪
- 文献传递