姚文静
- 作品数:8 被引量:51H指数:4
- 供职机构:东北林业大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 拟南芥ERF转录因子基因应答非生物胁迫表达模式被引量:2
- 2016年
- 以122条拟南芥(Arabidopsis thaliana)ERF转录因子家族基因为研究对象,用RT-q PCR检测其应答盐胁迫情况,分析15个盐胁迫敏感基因在盐、干旱和ABA胁迫条件下的表达模式。在盐胁迫条件下,有36个基因上调表达,42个基因下调表达,44个基因无明显变化。其中,15个盐胁迫敏感基因在不同胁迫条件下表现出不同的表达模式。在盐胁迫条件下,15个ERF基因的表达水平随胁迫时间的延长均表现出明显升高,在36和72 h两个时间点达到极显著水平。在ABA胁迫条件下,15个ERF基因中大多数表达水平提高。在干旱胁迫下,15个ERF基因表达水平均随胁迫时间延长有所提高,在48 h达到最高。AT1G06160、AT1G21910、AT2G35700、AT4G17490、AT4G39780和AT5G61890等6个基因在非生物胁迫条件下表达模式相似,表明其可能参与相似的基因调控途径。其他9个ERF基因在非生物胁迫下表现出不同的表达模式,表明其可能参与不同基因调控途径。
- 赵金玲姚文静姜廷波周博如
- 关键词:拟南芥基因表达非生物胁迫
- 柽柳金属硫蛋白基因的cDNA及其编码的多肽
- 柽柳金属硫蛋白基因的cDNA及其编码的多肽,它涉及金属硫蛋白基因的cDNA及其编码的多肽。它要解决植物抗重金属镉离子能力低的问题。柽柳金属硫蛋白基因的cDNA的基因序列如SEQ ID No.1所示。柽柳金属硫蛋白基因的c...
- 周博如姜廷波姚文静王升级王继颖
- 文献传递
- 拟南芥WRKY基因家族应答非生物胁迫基因的鉴定被引量:10
- 2016年
- WRKY转录因子家族是植物特有的一类转录因子家族,在植物生长发育和应答各种胁迫反应过程中起重要作用。为筛选和鉴定植物抗逆关键基因,以拟南芥(Arabidopsis thaliana)WRKY家族基因为研究对象,从数据库中搜索到72个拟南芥WRKY基因,通过生物信息学分析,根据其结构特点,可将其分为3大类:Group I、Group II和Group III。其中,Group II又可分为5个亚类:IIa、IIb、IIc、IId和IIe。用实时定量RT-PCR筛选出30个应答盐胁迫的基因,其中上调表达的23个,下调表达的7个。
- 魏晓爱姚文静姜廷波周博如
- 关键词:拟南芥WRKY转录因子非生物胁迫
- 杨树AP2/ERF转录因子家族生物信息学分析被引量:19
- 2015年
- AP2/ERF基因家族是植物所特有的一类转录因子,该转录因子参与多种生物学过程,包括植物生长、花发育、果实发育、种子发育、损伤、病菌防御、高盐、干旱等环境胁迫响应等。从毛果杨基因组数据库中查找210个毛果杨AP2/ERF家族基因,根据其编码氨基酸序列的相似性和AP2/ERF结构域的数量可分为4类,分别为AP2、ERF、DREB和RAV亚家族及其他(Potri.002G246100)。利用生物信息学方法分析了毛果杨210条AP2/ERF蛋白序列的系统发生、基因组定位、氨基酸组成、理化性质及二级和三级结构等。研究结果可为杨树AP2/ERF家族基因的功能分析提供参考依据。
- 赵金玲姚文静王升级姜廷波周博如
- 关键词:杨树生物信息学
- 杨树PsnERF1基因cDNA及其编码的多肽
- 杨树PsnERF1基因的cDNA及其编码的多肽,它涉及杨树PsnERF1基因的cDNA及其编码的多肽。杨树PsnERF1基因的cDNA,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。杨树PsnERF1基因的cDNA序列编...
- 姜廷波姚文静周博如赵凯
- 文献传递
- 小黑杨HD-Zip转录因子家族生物信息学及应答盐胁迫分析被引量:4
- 2017年
- HD-Zip转录因子基因是植物中特有的一类蛋白家族,在植物生长发育和逆境应答胁迫过程中发挥重要作用。HD-Zip转录因子基因是由高度保守的同源异型结构域(HD)和亮氨酸拉链域(LZ)结构域构成的特殊结构模型。杨树HD-Zip转录因子家族共有63个基因,可被分为HD-ZipⅠ、HD-ZipⅡ、HD-ZipⅢ和HD-ZipⅣ四个亚家族。本文利用RNA-Seq分析了盐胁迫条件下HD-Zip基因家族在小黑杨根、茎、叶等不同组织的基因表达差异,从转录组水平揭示其应答胁迫环境的分子机制,结果表明,盐胁迫下在叶中有25个HD-Zip基因下调表达,21个基因上调表达;茎中有42个基因下调表达,11个基因上调表达;根中有26个基因下调表达,24个基因上调表达。另外,本文根据拟南芥HD-Zip转录因子家族基因的已知功能,预测了杨树HD-Zip转录因子同源基因的功能,并利用生物信息学方法分析了杨树HD-Zip转录因子蛋白序列的保守结构域、氨基酸组成和理化性质等,为进一步研究杨树HD-Zip转录因子基因功能提供参考。
- 张雪梅姚文静赵凯姜廷波周博如
- 关键词:非生物胁迫小黑杨生物信息学
- 杨树NAC7转录因子基因应答盐胁迫表达被引量:10
- 2017年
- 从小黑杨中克隆915 bp的NAC7转录因子基因(Potri.007G099400.1)cDNA,其编码304氨基酸,该蛋白属热稳定性较高的亲水性蛋白。用RT-qPCR分析杨树盐胁迫条件下NAC7基因表达情况,表明该基因对盐胁迫具有应答反应,且基因主要在根部表达。克隆获得1 062 bp的NAC7基因启动子DNA序列,其中含有许多胁迫应答元件,其驱动的GUS报告基因主要集中在根中表达,而在茎和叶中的表达很少,这个结果与NAC7基因表达进行RT-qPCR分析结果一致。
- 张雪梅姚文静赵凯姜廷波周博如
- 关键词:小黑杨基因表达启动子转录因子盐胁迫
- 杨树转录因子ERF76基因耐盐功能研究
- 转录因子以反式作用因子的形式与基因启动子序列中的顺式作用元件特异性结合,通过与其他相关蛋白之间的互作来激活或者抑制转录,从而调控下游靶基因的表达。ERF家族基因是一类植物中特有的与植物生长发育和生物、非生物胁迫应答相关的...
- 姚文静
- 关键词:杨树转录因子耐盐能力