尉春艳
- 作品数：4 被引量：7H指数：2
- 供职机构：西安交通大学更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- TNFα基因-238、-863位点单核苷酸多态性与宫颈癌以及HPV感染的关系
- 尉春艳
- 高级别浆液性卵巢癌中的差异表达基因及其临床意义
- 2023年
- 目的 探讨高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的差异表达基因(DEGs)及其临床意义。方法 从GEO数据库下载与HGSOC相关的基因芯片数据集GSE54388,使用R语言筛选DEGs,并采用DAVID数据库进行富集分析。选取35例HGSOC患者的组织标本(包含卵巢癌组织及距离癌组织>1 cm处的癌旁组织),采用实时荧光定量PCR检测DEGs在卵巢癌组织和癌旁组织中的表达水平。利用STRING数据库和Cytoscape 3.8.0软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络并筛选核心基因。结果 在GSE54388数据集中共筛选出537个DEGs,其中表达下调基因369个,表达上调基因168个。实时荧光定量PCR结果显示,卵巢癌组织PEX5L、ITLN1和SLC4A4的mRNA表达水平低于癌旁组织(P<0.05)。富集分析结果显示,DEGs富集于细胞外液、细胞外基质等细胞组分上,涉及肝素结合、钙离子结合等分子功能,参与细胞黏附、分裂和增殖等生物过程,与Ras信号通路、癌症相关通路等密切相关。从PPI网络中筛选出10个核心基因,即CDK1、CDC20、cyclin B1、BUB1B、KIF20A、DLGAP5、NDC80、NCAPG、TTK和KIF11。结论 PEX5L、ITLN1和SLC4A4可能是影响HGSOC发生发展的关键DEGs, Ras信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶信号通路、经典Wnt信号通路可能参与调控HGSOC的进展。
- 高美尉春艳闫桂花刘亮亮
- 关键词：差异表达基因生物信息学分析
- 应用HMM和加权距离判别法的真核基因识别程序研究被引量：4
- 2005年
- 根据现代科学对基因的认识 ,应用了隐马尔科夫模型 (HMM)的算法 ,以大量核酸序列为信息来源 ,通过计算机计算来寻找未知基因的大体位置 ;再通过基因的固有结构特征及密码子使用的偏向性 ,使用加权距离判别法来准确地定位基因 ,以图形及文本的形式输出 ,从而极大地方便了实验室的研究工作。考虑到基因的许多特征还不为人们所了解 ,而且不同物种之间基因结构又有一定的差异 ,所以还开发了程序自学习功能 ,不断地存储已知的基因 ,再据此改变一些已有固有数据 ,以便更好地适应和了解不同生物基因结构的特异性 ,更加准确地寻找未知基因的位置。
- 史良尉春艳高琦
- 关键词：隐马尔可夫模型基因识别
- 国内外基因计算机识别的研究方法及进展被引量：4
- 2004年
- 史良尉春艳高琦
- 关键词：计算机基因识别基因预测
