唐远菊
- 作品数:3 被引量:19H指数:2
- 供职机构:西南大学动物科技学院更多>>
- 相关领域:生物学农业科学医药卫生更多>>
- 曼氏血吸虫EST中的微卫星分析被引量:9
- 2007年
- 美国基因组研究协会网上公布了138 259条曼氏血吸虫EST(表达序列标签)序列,总长约为52345kb。通过分析发现,其中包含了8 133条SSR(简单重复序列),检出率为5.88%,平均每6.4 kb含有一个SSR。三核苷酸重复基元的SSR最多,占总数的54.2%,其次为二核苷酸和四核苷酸,分别占20.5%和20.6%,五核苷酸最少,只占4.7%。在曼氏血吸虫EST中没有发现单核苷酸重复基元和六核苷酸重复基元的SSR。同时,在各种SSRs重复单元中,富含A碱基的重复单元占据优势地位,如:AT、AG、AC、AAT、AAG、AAC、AAAT、AAAC、AAAAT和AAAAG重复基序,而富含GC碱基的重复单元在基因编码区中含量较低。本文通过分析SSR在曼氏血吸虫EST中的分布频率与密度,为曼氏血吸虫和近缘种属寄生虫SSR标记的开发提供信息,有利于进一步开展吸虫的系统发育以及比较基因组学的研究。
- 唐远菊罗洪林聂奎
- 关键词:曼氏血吸虫表达序列标签微卫星简单重复序列
- SSR标记和SCAR标记对片形吸虫的分类鉴别研究
- 片形吸虫是一种危害牛羊等反刍兽和人类的寄生性蠕虫,常见的有两个种:肝片吸虫(Fasciola hepatica)和大片吸虫(Fasciola gigantica)。牛、羊片形吸虫病呈全球性流行,在全球每年造成约20亿美元...
- 唐远菊
- 关键词:片形吸虫微卫星SSR标记SCAR标记
- 文献传递
- 一株鸭源恶臭假单胞菌16S rDNA的序列测定与分析被引量:10
- 2008年
- 从病鸭翅静脉无菌采集抗凝血,直接镜检和姬姆萨染色镜检,微生物感染呈阳性.从血液中分离出该微生物,用细菌16S rDNA通用引物扩增出约1500bp的条带,经DNA测序得到一条长1499bp的16S rDNA序列,与GeneBank已提交的序列进行BLAST相似性搜索表明该微生物应归属于假单胞菌属(Pseudomonas),并用DNAStar进行同源性分析并构建系统进化树,显示与恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida)同源性最近,首次发现恶臭假单胞菌可能感染家鸭.
- 於剑聂奎密金玲周作勇罗洪林刘勤妮唐远菊
- 关键词:恶臭假单胞菌RDNA系统进化树