刘晓梁
- 作品数：10 被引量：31H指数：3
- 供职机构：山西医科大学汾阳学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山西省高等学校科技创新项目国家级大学生创新创业训练计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- MAGE-4抗原MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽的预测
- 2016年
- 1目的预测黑色素瘤相关抗原-4(MAGE-4)抗原的MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽。2方法利用NCBI蛋白数据库检索到MAGE-4抗原的氨基酸序列,BIMAS、SYFPEITH1、IEDB等3种方案分别对MAGE-4抗原的HLA-A*0201限制性MHC-Ⅰ类抗原表位进行预测,选出候选肽;然后利用SYFPEITHI服务器和NetMHCIIpan 3.1服务器对候选肽周围的MHC-Ⅱ限制性表位进行预测。综合分析选出MHC-Ⅰ/MHC-Ⅱ限制性表位肽。3结果筛选得到3条肽段,既存在MHC-Ⅰ限制性表位又存在MHC-Ⅱ限制性表位肽。4结论为MAGE-4抗原用于结肠癌免疫治疗肽段的选择提供了依据。
- 刘晓梁
- 关键词：免疫治疗
- 心血管疾病中血管平滑肌表型研究进展
- 2023年
- 心血管疾病是全球发病率和病死率均位居前列的疾病。血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells, VSMCs)是动脉血管壁中的主要细胞类型,其不同表型转换会导致多种心血管疾病发生。最常见的疾病类型主要包括动脉粥样硬化、心肌梗死、主动脉瘤和血管钙化等。因此,本综述总结常见心血管疾病中VSMCs不同表型及其特征和功能,对其中可能的分子机制进行总结。
- 康杰刘晓梁付慧
- 关键词：心血管疾病血管平滑肌细胞表型转换
- PI3K/Akt/mTOR信号通路在脂多糖诱导的大鼠肝星状细胞自噬中的作用被引量：8
- 2019年
- 该文探讨了磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)信号通路在脂多糖(LPS)诱导的大鼠肝星状细胞-T6(HSC-T6)自噬中的作用。体外培养HSCT6细胞,随机分为对照组、LPS组、雷帕霉素(Rapamycin,Rapa)组、LPS+Rapa组、LY294002组、LPS+LY294002组,SC79组、LPS+SC79组,各组经相应处理后,单丹磺酰尸胺(MDC)染色法观察自噬溶酶体变化;细胞免疫荧光法检测各组微管相关蛋白轻链Ⅱ(LC3Ⅱ)表达;Western blot检测各组通路蛋白p-Akt、p-mTOR、Akt、mTOR及自噬相关蛋白LC3Ⅱ、Beclin1的表达;qRT-PCR检测各组LC3Ⅱ和Beclin1 mRNA的表达。结果显示,LPS+Rapa组、LPS+LY294002组较LPS组的自噬溶酶体、LC3Ⅱ荧光亮点含量无明显差异(P>0.05),LPS+SC79组较LPS组的自噬溶酶体、LC3Ⅱ荧光亮点含量明显减少(P<0.05);Western blot显示,LPS+Rapa组、LPS+LY294002组较LPS组LC3Ⅱ、Beclin1、p-Akt、p-mTOR蛋白表达水平无明显差异(P>0.05),LPS+SC79组较LPS组LC3Ⅱ、Beclin1含量明显减少,p-Akt、p-mTOR蛋白表达水平明显增加(P<0.05);qRT-PCR显示LPS+Rapa组、LPS+LY294002组较LPS组LC3Ⅱ、Beclin1 mRNA含量无明显差异(P>0.05),LPS+SC79组较LPS组LC3Ⅱ、Beclin1 mRNA含量明显减少(P<0.05)。该项研究结果表明,LPS可能通过抑制PI3K/Akt/mTOR信号通路促进HSC-T6细胞自噬。
- 崔永佳徐军全王美娇吴惠文王明亮宋彬妤刘晓梁
- 关键词：信号通路肝星状细胞脂多糖自噬
- 果糖饮食致大鼠肠内菌群的变迁及双歧杆菌干预作用的研究被引量：2
- 2018年
- 目的探究果糖饮食致大鼠代谢异常中拟杆菌属、乳杆菌属和梭杆菌属丰度变化及双歧杆菌干预对3种菌属和代谢的影响。方法将SD雄性大鼠随机分为对照组(NC组)、果糖组(HFD组)和双歧杆菌组(B组),每组各10只。NC组,普通饲料+自来水喂养;HFD组,普通饲料+10%果糖水喂养;B组,普通饲料+10%果糖水+双歧杆菌水(1 ml/d,1×109 cfu/ml)灌胃。其他饲养条件相同,每周检测大鼠体重。于16周末空腹抽血检测谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、三酰甘油(TG)、脂多糖(LPS)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)及空腹胰岛素(FINS)水平,计算胰岛素抵抗指数(HOMA-IR);实时聚合酶链反应(real-time PCR)检测大鼠粪便中3种菌属丰度变化;镜下观察肝组织病理学变化。结果与NC组比较,HFD组血浆LPS、ALT、AST、TG、TNF-α、空腹血糖及FINS差异有统计学意义(P <0.05),HFD组升高;粪便中拟杆菌属、乳杆菌属丰度下降,梭杆菌属丰度升高,差异有统计学意义(P <0.05);双歧杆菌干预对HFD组上述指标有一定程度的改善。结论果糖饮食引起3种菌属失调参与机体代谢异常的发生,双歧杆菌通过调节其失调对机体代谢紊乱发挥改善作用。
- 林雅玲王文递许昕瑜王明亮宋彬妤刘晓梁郭松佳吴惠文
- 关键词：代谢紊乱双歧杆菌
- 新冠病毒相关蛋白TMPRSS2结构与功能的生信分析及表达载体构建被引量：1
- 2022年
- 目的人源TMPRSS2是一种跨膜丝氨酸蛋白酶,本文对该蛋白结构与功能进行系统生物信息学分析,优化密码子并构建原核表达载体,以探究其参与SARS-CoV-2侵染宿主细胞的分子机制。方法利用分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-TMPRSS2;采用Protparam、NetPhos3.1、Blast、Clustal X2和MEGA7.0等分析工具对TMPRSS2蛋白的同源性、功能位点、亚细胞定位、三维结构和进化特点等进行生信分析。结果原核表达质粒构建正确;TMPRSS2蛋白属于中等分子量蛋白,由492个氨基酸残基构成,理论等电点为8.12,分子消光系数为118145 L·mol^(-1)·cm^(-1),半衰期30 h;TMPRSS2有15个潜在的糖基化位点,49个可能的磷酸化位点,无信号序列,是一种跨膜的亲水性蛋白。此外,该蛋白有13个潜在的B细胞表位及7个T细胞表位。二级结构分析显示,Random coil在TMPRSS2蛋白中占比最高(0.4533),其次是Extended strand(0.2520)。序列对比和进化分析显示,与人源TMPRSS2序列一致性最高且亲缘关系最近的是Pan troglodytes,其次是Gorilla。结论人源TMPRSS2蛋白在进化上保守,功能重要。本研究结果有助于揭示TMPRSS2蛋白的结构和作用机理,为新冠肺炎的诊疗提供思路,加速了靶向TMPRSS2蛋白的新型药物研发进程。
- 徐本锦李卓禧范蕾李璟严荣荣杜淼宣焱门杰陈晓聪汤文婷侯艳香宋彬妤杨娅男刘晓梁余骏骁刘玲
- 关键词：TMPRSS2进化分析
- 新冠病毒刺突糖蛋白结构与功能的生物信息学分析及原核表达被引量：6
- 2022年
- SARS-CoV-2是一种高致病性且传播迅速的病原体,通过刺突糖蛋白(Spike glycoprotein,S蛋白)识别宿主细胞表面的受体来实现入侵和感染。对S蛋白进行系统的生物信息学分析和原核表达,有助于深入理解S蛋白的功能和阐明该蛋白介导病毒感染的分子机制。本文采用Protparam、Pfam、TMHMM、ExPASy-ProtScale、PSORTⅡ、SignalP、UniProt、NetPhos 3.1、NetNGlyc 1.0、NetOGlyc 4.0和BLAST等生物信息学软件和数据库对S蛋白的理化性质、亚细胞定位、翻译后修饰及相互作用网络等生物学特性进行了系统分析。利用Clustal X2和MEGA7.0软件对该蛋白进行了基于氨基酸序列的同源性分析和系统进化分析。最后,通过分子克隆技术构建重组表达载体pET-22b-S并进行原核表达。结果显示,S蛋白由1273个氨基酸组成,分子量141.2 kD,等电点6.24,有两个卷曲螺旋结构,一个跨膜螺旋区,疏水性较强。S蛋白包含刺突受体结合结构域和S2糖蛋白结构域,主要分布于宿主细胞的内质网膜和细胞膜,含有136个潜在的磷酸化位点和20个可能的糖基化位点。与SARS-CoV-2 S蛋白序列一致性最高的是SARS冠状病毒、SARS冠状病毒WH20和蝙蝠冠状病毒HKU3,均为76%。SARS-CoV-2与SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒聚为一大支,提示它们可能具有共同的祖先。S蛋白主要在细菌裂解液离心之后的沉淀中表达,这为后续的结构分析和疫苗研发奠定了基础。S蛋白在SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒之间保守性较高,提示其在病毒入侵过程中具有重要功能。SARS-CoV-2与SARS冠状病毒和蝙蝠冠状病毒可能具有共同的祖先。本研究为SARS-CoV-2 S蛋白的表达纯化、结构与功能研究提供了重要的数据基础,有助于全面揭示S蛋白的生物学功能,同时为设计和筛选靶向S蛋白的新型抗病毒药物提供了科学依据。
- 徐本锦宣焱杜淼刘玲吴惠文宋彬妤侯艳香陈利荣刘晓梁
- 关键词：生物信息学分析原核表达
- 内毒素在肝胰岛素抵抗中对肝细胞线粒体功能的影响被引量：1
- 2017年
- 目的研究果糖饮食及皮下注射内毒素(LPS)致大鼠肝胰岛素抵抗(IR)及内毒素血症中,LPS对肝细胞线粒体功能的影响。方法 30只SD雄性大鼠随机分为三组。对照组(NC组):普通饲料喂养;果糖组(HFD组):10%果糖水喂养;LPS组:皮下注射LPS 300μg/(kg·d)。8周糖耐量实验后,检测血浆肝酶、空腹胰岛素、LPS变化,计算IR指数;检测肝组织氧化损伤及能量代谢指标;Western blot检测肝组织胰岛素信号转导蛋白及线粒体内膜蛋白(UCP2)表达;观察肝组织病理学变化。分离培养大鼠肝细胞分为四组。NC组:DMEM培养液培养;HFD组:培养液+果糖水(4.5 g/L);LPS组:培养液+LPS(10 mg/L);果糖+LPS组(H+L组):培养液+果糖水(4.5 g/L)+LPS(10 mg/L)。20 h后,检测肝细胞线粒体功能及胰岛素信号转导蛋白表达。结果与NC组比较,HFD组与LPS组LPS、肝酶及氧化损伤产物显著升高,能量代谢异常(P<0.01),胰岛素信号转导蛋白表达降低,UCP2表达升高(P<0.01);HFD组与LPS组上述指标变化差异无统计学意义(P>0.05)。HFD组、LPS组和H+L组细胞上清液氧化损伤产物高于NC组(P<0.05或P<0.01),能量代谢异常(P<0.05),胰岛素信号转导蛋白表达下降,UCP2表达升高(P<0.05或P<0.01);各干预组之间以上指标变化差异无统计学意义(P>0.05)。结论果糖饮食及皮下注射LPS致大鼠肝IR中,伴有内毒素血症。LPS可促发肝氧化应激,影响肝细胞线粒体功能,促进代谢性疾病的发生。
- 王文递林雅玲宋彬妤刘晓梁王明亮赵成瑞王旭文吴惠文
- 关键词：内毒素血症胰岛素抵抗氧化应激线粒体功能
- 吗啡成瘾诱导小鼠大脑前额叶皮层中长链非编码RNA表达谱的变化被引量：2
- 2019年
- 目的探究吗啡成瘾小鼠的大脑前额叶皮层中lncRNA表达谱的变化。方法将C57BL/6小鼠分为两组:吗啡组和对照组。吗啡组小鼠以剂量按日递增的方法腹腔注射盐酸吗啡,建立急性吗啡成瘾的小鼠模型。对照组小鼠每日注射与吗啡组小鼠相同体积的生理盐水。提取两组小鼠大脑前额叶皮层(PFC)的总RNA,利用lncRNA表达谱芯片检测PFC中lncRNA的表达量变化。从芯片检测结果中筛选出表达量发生显著变化,且差异具有统计学意义的前10个lncRNA,并用qRT-PCR的方法验证其表达量变化。结果芯片结果显示,有493个lncRNA表达上调,255个lncRNA表达下调。qRT-PCR的验证结果表明,与对照组相比,吗啡组小鼠的大脑前额叶皮层中有5个lncRNA表达量发生显著变化,差异具有统计学意义(P<0.01),其中AK157323、AK018061和AK140599表达显著上调,AK007908和AK160450表达显著下调。结论吗啡成瘾可诱导小鼠大脑前额叶皮层中lncRNA表达谱发生较大变化。AK157323、AK007908、AK160450、AK018061和AK140599的表达异常可能参与吗啡成瘾的过程。
- 付慧常芬宋彬妤王明亮刘晓梁
- 关键词：吗啡成瘾长链非编码RNA小鼠
- 诱骗受体3的二级结构及B细胞表位预测
- 2016年
- 1目的预测诱骗受体3(Dcr3)蛋白的二级结构及B细胞表位。2方法通过NCBI蛋白数据库检索到Dcr3蛋白的氨基酸序列,以此为基础,通过SOPMA在线服务器预测其二级结构,利用Lasergene软件预测其亲水性、表面可及性、柔韧性区域及抗原性指数,综合分析,预测其可能的B细胞表位。3结果 Dcr3的二级结构由无规则卷曲(43.00%)、β折叠(10.33%)、α螺旋(36.33%)和β转角(10.33%)构成,其可能的B细胞表位位于56-67(TFVQRPCRRDSP),93-101(VLCGEREEE),56-167(GTFSASSSSSEQ),255-261(LKLRRRL),286-293(PGLERSVR)。4结论此结果为制备Dcr3表位特异性抗体肽段选择提供了依据。
- 刘晓梁
- 关键词：DCR3B细胞表位
- 产气荚膜梭菌促进黑腹果蝇的生长和发育被引量：11
- 2016年
- 【目的】黑腹果蝇Drosophila melanogaster肠道中栖生着众多微生物,通过分离和研究其内共生菌,以研究肠道菌群的多态性和作用。【方法】利用Hungate滚管技术从黑腹果蝇成虫肠道分离厌氧细菌;通过记录果蝇的发育历期和生长速率,检测该细菌对果蝇发育和生长的影响。【结果】首次从黑腹果蝇肠道内分离到一株产气荚膜梭菌Clostridium perfringens。该菌能够有效地定植到果蝇肠道内,是果蝇肠道共生菌。产气荚膜梭菌显著地缩短无菌果蝇的发育历期,将无菌果蝇成蛹天数由20 d缩短到8.1 d,羽化天数由30 d缩短到12.7 d。该菌还可以提高果蝇生长速率。【结论】本研究揭示了产气荚膜梭菌是果蝇的内共生菌,可以通过提高生长速率而有效地促进果蝇的生长和发育。
- 刘威李玉娟刘晓梁卓萍姚红
- 关键词：产气荚膜梭菌黑腹果蝇共生菌发育生长速率
