谢华博
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：西北工业大学计算机学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术更多>>
- 行常量差异共表达基因模式挖掘算法研究
- 提出了一个有效的基因差异共表达模式挖掘算法:DiPattern,从两个真实的基因表达数据中挖掘出具有差异共表达特征的行常量基因.该算法使用样本范围支持度来衡量具有关联性的基因组,同时提出了3种在真实数据环境下基因之间共表...
- 王淼尚学群谢华博李战怀
- 关键词：基因共表达
- 文献传递
- 相对行常量差异共表达双聚类挖掘算法被引量：1
- 2013年
- 在生物信息学上,挖掘差异共表达双聚类有助于研究衰老、癌变类变化的生物过程。以往的差异共表达双聚类定义仅仅从一组基因的角度来衡量差异,导致包含了很多噪声。为了克服上述缺点提出新的差异共表达支持度MiSupport,可以将一组基因的差异细化到基因级别;并由此定义提出MiCluster算法,可以在两个真实的基因芯片数据中挖掘最大的差异共表达双聚类。MiCluster算法首先基于两个基因芯片数据构建差异共表达权值图,然后基于权值图,采用样本扩展和层次扩展,并利用精确的候选产生方法和高效的剪枝策略,挖掘出最大的差异共表达双聚类。实验结果证明,MiCluster算法比现有的算法快速高效,而且通过均方误差(MSE)测试和基因本体(GO)评价,挖掘出来结果具有更大的统计意义和生物学意义。
- 谢华博尚学群王淼
- 关键词：基因芯片基因共表达
