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高楠
作品数:
2
被引量:13
H指数:2
供职机构:
中国科学院长春应用化学研究所
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发文基金:
国家自然科学基金
吉林省自然科学基金
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相关领域:
理学
生物学
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合作作者
韩葳葳
吉林大学生命科学学院分子酶学工...
冯雁
吉林大学生命科学学院分子酶学工...
詹冬玲
吉林大学生命科学学院分子酶学工...
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作者
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詹冬玲
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冯雁
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韩葳葳
2篇
高楠
传媒
2篇
高等学校化学...
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1篇
2014
1篇
2013
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2
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嗜热蛋白酶PH1704别构中心量子化学计算与突变体动力学
被引量:6
2014年
通过量子化学计算,确定嗜热菌PyrococcushorikoshiiOT3的PHl704蛋白酶别构位点的关键残基为Argll3,Tyrl20和Asnl29.其中,Argll3及Asnl29与别构抑制剂结合,参与别构调控.Tyrl20残基位于亚基交界面附近,并与亲核残基Cys100之间以氢键相连,可通过影响亚基聚合来影响酶的亲核催化.DJ-1超家族的4种构建蛋白的结构显示,120位点位于亚基交界面处,影响亚基的聚合,进而影响蛋白酶的活力,并间接参与别构调控.分子生物学实验显示,突变体R113T/Y120P/N129D的kcat/km(L·μmol^-1·min^-1)值是野生型kcat/km。值的6倍,h系数由野生型的0.86转变为1.3,负协同效应消失.113和129位点处阴离子别构剂脱离,从而破坏113,120和129位点间的封闭环结构,使AC交界面胡螺旋(124~129,524—529)间聚合度增强;120位点残基由rryr转变为Pro,与Cys100间氢键断裂,亲核进攻的阻力减小,从而使酶活力提高,别构负调控消失.
詹冬玲
高楠
韩葳葳
冯雁
关键词:
嗜热蛋白酶
量子化学计算
定点突变
分子对接和动力学模拟提高嗜热蛋白酶PhpI的活力
被引量:7
2013年
通过分子对接和动力学模拟对嗜热蛋白酶的分子进行改造,确定蛋白酶PH1704(PhpI)定点突变残基,并通过分子生物学实验进行验证.突变体K43C的蛋白酶活力提高了5.8倍.分子动力学模拟结果表明,经过8 ns的动力学模拟后,K43C突变体二级结构由野生型的S2片层(F11-E12-D13)变成环状结构.E12和K43均是活性位点的重要残基,这种变化将导致活性位点的柔性增强,有利于催化反应的发生.
詹冬玲
高楠
韩葳葳
冯雁
关键词:
分子对接
动力学模拟
定点突变
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