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人STC2蛋白的生物学分析被引量：5: 2018年; 运用生物信息学方法预测分析不同物种问STC2蛋白的理化性质、同源性以及人STC2蛋白亲水性、核定位序列，跨膜区域、信号肽结构、亚细胞定位，二级结构、三级结构、互作蛋白、GO注释分析。STC2蛋白由302个氨基酸组成，理论等电点为6．93，具有较强亲水性，在哺乳动物中较为保守，不存在核定位序列和跨膜结构，含有信号肽，主要集中在细胞内质网或分泌到胞外；STC2蛋白二级结构预测有11个α螺旋区和1个β折叠区，拉曼图表明三级预测结构可靠，互作蛋白及GO注释提示STC2可参与多种细胞生物学过程。通过对人STC2蛋白结构和功能的预测分析，为STC2蛋白的进一步研究提供一定的理论依据，也为STC2相关疾病的诊治提供新的思路。; 李伟李伟董秋萍周蒙王星宇董秋萍许世磊; 关键词：糖蛋白肿瘤生物信息学

晚期非小细胞肺癌的内科一线及维持治疗被引量：12: 2016年; 目前,肺癌已成为全球癌症死亡的主要原因之一,每年约有超过100万的人口死于该病[1]。流行病学调查结果表明,非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）占所有肺癌的85%以上,而大部分患者在诊断时已是晚期,总体预后差。针对晚期NSCLC的内科治疗一直是全球研究的热点,也是难点。近年来,; 董秋萍蒋湘俐张连民孙博许世磊; 关键词：晚期非小细胞肺癌一线治疗

人细胞角蛋白Keratin 14的生物信息学分析被引量：2: 2017年; 人细胞角蛋白Keratin 14是I型中间丝蛋白家族的亚群,参与形成上皮细胞的细胞骨架。利用生物信息学分析Keratin 14基因的启动子区、CpG岛及其所编码的蛋白质的理化性质、结构特点和功能特征。结果表明,Keratin 14基因存在两个启动子区,启动子区不存在CpG岛;Keratin 14全长472个氨基酸,其等电点为5.09,是一个无跨膜结构的亲水性蛋白质;角蛋白Keratin 14二级结构具7个α螺旋和5个β折叠,预测三级结构的拉曼图分析显示其结构稳定;与Keratin 14相互作用的蛋白质主要是角蛋白,而且Keratin 14还参与细胞的生长和分裂,有促进细胞分化的作用;此外,Keratin 14的氨基酸序列在哺乳动物间的同源性较高。上述对角蛋白Keratin 14的表达、结构和功能的预测可以为研究其在生命过程中的作用提供重要的信息。; 周蒙董秋萍张连民李伟付欣许世磊; 关键词：上皮细胞细胞骨架生物信息学

人P2X1蛋白生物信息预测: 2017年; 利用生物信息学方法对配体门控离子通道受体人P2X_1蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、亲疏水性、二级结构及三级结构、蛋白质间的相互作用、GO注释等进行预测分析。结果显示:P2X_1蛋白是两次跨膜的亲水蛋白质,由399个氨基酸组成,等电点为8.75,有一段核定位序列;二级结构存在6个α螺旋区和15个β折叠区,三级结构预测结果的可靠性为45.35%,拉曼图分析表明预测结构较稳定;与P2X_1相互作用的蛋白质主要是传导信号的嘌呤受体和离子通道蛋白质,而且P2X_1蛋白可能参与血管凝集及炎症反应等生理过程。上述对人P2X_1蛋白结构及功能的预测为研究人P2X_1蛋白在生物过程及疾病治疗方面的作用提供了重要的理论依据。; 魏梅张连民周蒙李伟董秋萍许世磊; 关键词：炎症反应生物信息学

人TEAD1蛋白质的生物信息学分析被引量：3: 2016年; [目的]采用生物信息学方法对人TEAD1蛋白质的理化性质、跨膜区域、亲疏水性、信号肽区域、二级结构、三级结构、蛋白质之间的相互作用、GO注释进行预测分析。[方法]使用多种分析软件对TEAD1蛋白质进行预测分析。[结果]TEAD1蛋白质由426个氨基酸组成,等电点为8.33,在哺乳动物中高度保守;二级结构预测发现6个α螺旋和10个β折叠片层,三级结构预测结果的可靠性为100%,拉曼图分析表明预测结构稳定;与TEAD1相互作用的蛋白质主要是核内转录调控蛋白质,并可参与Hippo信号通路。[结论]TEAD1一种存在核定位序列、无跨膜结构的亲水不稳定蛋白质,具有转录调控因子的作用,可通过Hippo信号通路,表现出促癌作用。; 王兆松赵文铖张连民周蒙魏梅董秋萍许世磊; 关键词：转录调控因子生物信息学

miR-448通过抑制上皮间质转化抑制肺癌细胞增殖和运动能力被引量：1: 2015年; 探讨mi R-448对肺癌细胞增殖和运动的影响及其分子机制。采用实时荧光定量PCR(polymerase chain reaction)检测原发肺癌组织和癌旁正常组织mi R-448表达水平。转染mi R-448 mimic和inhibitor至肺癌A549细胞系,通过MTT(3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl-2-H-tetrazoliumbromide)、平板克隆形成和Transwell实验观察mi R-448表达对A549增殖和运动能力的影响;利用Western blot检测EMT(epithelial-mesenchymal transition)标志物蛋白表达水平,通过实时荧光定量PCR检测EMT相关转录因子m RNA表达水平。实时荧光定量PCR显示较癌旁正常组织相比,mi R-448在原发肺癌组织中表达降低。MTT和平板克隆形成实验显示,过表达mi R-448抑制A549细胞增殖和运动能力;降表达mi R-448增强A549细胞增殖和运动能力。Western blot显示降表达mi R-448能下调上皮标志物E-cadherin,上调间质标志物Vimentin表达水平。实时荧光定量PCR显示降表达mi R-448能上调EMT相关转录因子Twist1和ZEB1 m RNA表达水平。mi R-448可通过抑制EMT抑制肺癌进展。; 董秋萍徐玥杨少斌冯婧文齐晓敏赵文铖王兆松许世磊; 关键词：EMT 肺癌增殖

人Latexin基因及蛋白质的生物信息学分析被引量：5: 2016年; Latexin(Lxn)是人的羧肽酶抑制剂,并有肿瘤抑制因子的作用。利用生物信息学分析Lxn基因的启动子和Cp G岛以及Lxn蛋白质的理化性质、结构特点、功能特征后发现,Lxn基因存在两个启动子和Cp G岛,且一个Cp G岛与启动子重合;Lxn是全长222个氨基酸,等电点5.52,无信号肽、无跨膜结构的亲水不稳定蛋白质;蛋白质二级结构有4个α螺旋和9个β折叠,三级预测结构可信度为99.55%,拉曼图表明结构稳定;与Lxn相互作用的蛋白质主要是羧肽酶,另外Lxn还参与炎症反应和温度引起的痛觉反应等生物过程;启动子和氨基酸在灵长类间的同源性极高。对Lxn的表达、结构及功能的预测分析可以为研究Lxn在生命过程中的作用提供重要的信息。; 王兆松赵文铖周蒙魏梅董秋萍许世磊; 关键词：肿瘤抑制因子生物信息学

人Ruvbl1蛋白生物信息分析被引量：1: 2017年; 采用生物信息学预测对人AAA+(ATPases associated with diverse cellular Activities)ATP酶家族成员Ruvbl1蛋白质的理化性质、蛋白质同源性、跨膜区域、核定位序列及信号肽、亲/疏水性,蛋白质高级结构、蛋白质间相互作用、GO注释进行预测分析。人Ruvbl1蛋白有456个氨基酸,等电点为6.02,有核定位序列,无信号肽,蛋白质具亲水性且高度保守;二级结构存在21个α螺旋和10个β折叠,相互作用蛋白及GO注释提示其主要在细胞核中发挥功能。人Ruvbl1蛋白是DNA解螺旋的关键酶,通过解螺旋DNA为基因的同源重组以及DNA损伤修复提供结构基础。; 周蒙董秋萍魏梅王星宇付欣许世磊; 关键词：生物信息学

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董秋萍