朱凤云
- 作品数：6 被引量：20H指数：3
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- 赤桉ACT1和ACT2基因的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2014年
- 为了解赤桉(Eucalyptus camaldulensis)肌动蛋白(Actin)在生长发育过程中的功能,根据赤桉幼苗转录组数据库中的肌动蛋白基因序列,从赤桉嫩叶中克隆了2条Actin基因片段,并利用RACE技术获得Actin基因的全长cDNA,分别命名为ECACT1和EC-ACT2基因。生物信息学分析表明,这两条基因的全长cDNA分别为1533 bp和1387 bp,均含有1个编码377个氨基酸的开放阅读框。经比对分析,赤桉Actin蛋白的氨基酸序列与其他植物Actin蛋白的具有较高的相似性,并且具有Actin蛋白特有的保守序列和相关特征。因此推测这两条基因对桉树的生长发育具有一定的调控作用。
- 陈鸿鹏朱凤云吴志华谢耀坚
- 关键词：赤桉ACTIN基因克隆生物信息学分析
- 油桐种子LOX基因的克隆与生物信息学分析被引量：5
- 2013年
- 为了揭示油桐中α-桐酸生物合成的分子机理,利用RT-PCR和RACE技术,从油桐的种子中克隆到脂氧合酶(lipoxygenase,LOX)基因的全长cDNA,并对其进行了生物信息学分析。结果表明,此基因cDNA全长为2 690 bp,编码797个氨基酸。
- 朱凤云陈鸿鹏谭晓风
- 关键词：油桐克隆生物信息学分析
- 赤桉GAPDH家族基因的克隆及其序列分析被引量：3
- 2014年
- 甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GAPDH）是高等植物糖酵解和糖异生反应中的关键酶，是维持生命活动能量形成的最基本酶之一，它氧化甘油醛-3-磷酸生成1，3-二磷酸甘油酸，由此为糖酵解过程提供产生ATP的底物[1-4]。此外，由于该酶基因为管家基因，几乎在所有组织中都高水平表达，在同种细胞或组织中的蛋白质表达量较为恒定，故被广泛用作实时荧光定量PCR的内参基因[5-9]。近年来，随着研究的不断深入，发现GAPDH还参与胚胎的特化、细胞融合、微管结束、磷酸转移酶激活、DNA复制与修复等过程，并调控组蛋白基因的表达、调节端粒结构，具有核膜融合和微管成束的活性[10-14]。同时，GAPDH的mRNA和蛋白质水平会受到各种环境因素的影响，并具有不同的亚细胞定位以及多元化的生理功能[15-16]。
- 陈鸿鹏朱凤云吴志华谢耀坚
- 关键词：赤桉GAPDH家族基因克隆
- 油茶脂氧合酶基因全长cDNA的克隆与序列分析被引量：8
- 2012年
- 为深入了解脂氧合酶基因在油茶果实成熟过程中的功能及其对油茶油脂品质的影响,本研究以油茶种子的转录组数据库中的脂氧合酶基因(lipoxygenase,LOX)的部分cDNA序列为基础,采用RT-PCR和RACE技术从油茶种子中克隆到此基因的全长cDNA,并其进行了序列分析。该基因全长cDNA为2 698 bp,包括5’非编码区161 bp、3'非编码区131 bp以及一个长2 406 bp的编码区和16 bp的polyA尾巴。该基因编码蛋白质的分子量约为91.65 kDa,等电点为5.255。同时该蛋白二级结构以α-螺旋为主,具有跨膜结构,主要分布在细胞内的叶绿体和细胞质中。经过比对分析,发现油茶LOX基因序列与其他物种LOX基因同源性较高,其编码的氨基酸序列与茶树、葡萄、辣椒、马铃薯的LOX氨基酸序列的同源性高达99%,与油橄榄、烟草、番茄、猕猴桃同源性达到了98%。
- 朱凤云陈鸿鹏谭晓风刘凯王建勇
- 关键词：油茶克隆全长CDNA
- 油茶脂氢过氧化物裂解酶基因的克隆与序列分析被引量：2
- 2014年
- 以油茶近成熟种子为材料,根据油茶EST文库中已知的脂氢过氧化物裂解酶EST序列,利用3’RACE与5’RACE技术,克隆到脂氢过氧化物裂解酶的全长cDNA序列。该基因全长1648bp,,包含一个1476bp开放阅读框长,编码491个氨基酸,5’与3’非编码分别为52bp、121bp。预测该蛋白相对分子量为54.7779KDa,等电点为6.77,是个叶绿体转运肽,N端包含有22个疏水氨基酸残基组成的序列,不仅具有转运肽富含的丝氨酸,还含有大量转运肽中很少存在的脯氨酸。多序列比对发现油茶脂氢过氧化物裂解酶核苷酸序列与茶的相似性达到96%,因此将该基因命名coHPL。
- 王建勇谭晓风龙洪旭陈鸿鹏刘凯朱凤云
- 关键词：油茶基因克隆
- 赤桉α-微管蛋白家族基因的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2014年
- 微管蛋白是真核生物中普遍存在的结构蛋白,在细胞的形态维持、分裂、迁移以及信号转导等方面发挥着重要的作用,同时也是荧光定量PCR技术中常见的一种内参基因。为深入了解α-微管蛋白(α-tubulin)对桉树生长发育的调节,本研究根据α-Tubulin基因的保守区段设计简并引物,从赤桉嫩叶中获得了3条tubulin基因的片段,并利用RACE技术得到了这些基因的全长cDNA,将其命名为EC-TUB1、EC-TUB2和EC-TUB3基因。此外,通过网上资源和生物信息学软件对这3条基因进行分析,发现这些基因编码的蛋白具有α-Tubulin蛋白特有的保守序列和活性结构域的相关特征,同时与其他植物的α-Tubulin蛋白具有较高的相似性,这为了解α-tubulin在桉树生长发育过程中的表达特性以及α-tubulin蛋白的功能,进一步揭示和利用桉树生长发育机理和树种间的差异性奠定了理论基础。
- 陈鸿鹏朱凤云谢耀坚
- 关键词：赤桉Α-TUBULIN家族基因生物信息学分析
