陈立
- 作品数:5 被引量:11H指数:3
- 供职机构:山东农业大学园艺科学与工程学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金山东省农业科学院青年科研基金国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 洋葱S型细胞质雄性不育相关基因的挖掘及分子标记开发被引量:4
- 2018年
- 以洋葱(Allium cepa L.)S型细胞质雄性不育系和保持系材料为试材,对洋葱线粒体全基因组中的58个开放阅读框(ORF)进行差异表达分析,发现了一个表达差异片段orf393。采用实时荧光定量PCR技术,利用洋葱S型细胞质雄性不育系和保持系的根,叶片,花茎以及花粉母细胞、四分体、单核花粉粒、成熟花粉粒等4个发育时期的花蕾对orf393进行时空表达分析。结果表明:orf393在洋葱S型细胞质雄性不育系的根、叶片、花茎和4个发育时期的花蕾中均有表达,尤其是在四分体时期花蕾中表达量最高,之后恢复到营养生长时期的表达水平,但在保持系中未见其表达,这表明orf393是组成型表达,可能与洋葱的花粉发育存在某种关联。利用orf393在S型细胞质雄性不育系和保持系之间的序列差异,开发了一个稳定可靠的鉴别洋葱细胞质类型的SCAR分子标记GXX393。
- 陈立杨亚会霍雨猛刘冰江孙雨晴杨建平孙雨晴杨建平
- 关键词:洋葱细胞质雄性不育基因表达分子标记
- 葱属蔬菜作物叶绿体DNA提取及其质量评价体系的建立被引量:3
- 2018年
- 为了探究不同提取方法对葱属蔬菜作物叶绿体DNA提取效果的影响,首先以大葱叶片为实验材料,采用高盐低p H值法和蔗糖DNase法,对其进行叶绿体DNA提取测试。结果表明,高盐低pH法优于蔗糖DNase法,其DNA纯度相似,A260/A280值分别1.984和1.977;产率差异大,分别为0.482μg/g FW (fresh weight, FW)和0.059μg/g FW,高盐低pH值法是蔗糖DNase法产率的8.17倍。随后,利用叶绿体MatK、线粒体Atp6和核LFY基因设计引物,根据各组引物自身的扩增效率,以试剂盒提取的总DNA为对照,分别对三种细胞器DNA拷贝数的比值进行评估研究,高盐低pH法提取叶绿体DNA含量是试剂盒法的78.38倍,而蔗糖DNase法为15.51倍,高盐低pH法是蔗糖DNase法的5.05倍。高盐低pH法提取的叶绿体DNA产率和含量均优于蔗糖DNase法,同时在此基础建立了细胞器DNA含量定量分析方法。随后我们用高盐低pH法对葱属蔬菜作物的洋葱、大蒜和韭菜进行了测试,获得了预期的效果。该研究为今后葱属作物高效、高纯度、无污染的叶绿体DNA提取和葱属蔬菜作物细胞器全基因组测序提供依据。
- 孙雨晴陈立杨亚会陈立吴雄于占东霍雨猛
- 关键词:叶绿体DNA
- 葱属主要蔬菜作物高质量RNA提取方法研究被引量:3
- 2016年
- 葱属蔬菜作物(洋葱、大葱、大蒜和韭菜等)各组织部位富含多糖等次生代谢物质,严重影响了RNA的提取质量。本研究以洋葱叶片为样本,对多种RNA提取方法进行了比较分析,获得了一套适合葱属蔬菜作物RNA提取的系统方法。该方法将CTAB-GT连用、蛋白酶K替代DEPC和冰浴电泳检测相结合,其所提取的RNA样本产量约为152.35μg/g FW,RNA完整性RIN值约为7.5,条带清晰,无多糖、蛋白质和DNA残留,28S约为18S两倍,提取过程安全无强致癌物质DEPC,可满足下游RNA分子实验的要求。且该方法适合于大葱、洋葱、大蒜和韭菜不同组织部位样本RNA的提取。
- 孙亚玲陈立刘冰江缪军孔素萍高莉敏曹辰兴吴雄杨妍妍霍雨猛
- 关键词:RNA提取多糖
- 洋葱AcPME基因的克隆及序列分析被引量:1
- 2017年
- 以洋葱花蕾为试材,通过RACE试验获得了Ac PME基因的全长c DNA序列,Gen Bank登录号为JF913196.1。该基因DNA序列包含2 786个碱基,4个外显子,3个内含子,c DNA序列长度为2 228 bp,编码序列长度为2 001 bp,编码666个氨基酸。生物信息学分析显示Ac PME蛋白存在明显的信号肽和跨膜区域(SP/TM)、PMEI结构域和PME结构域,在PME家族分类中属于第Ⅰ类,即含有一个长的N末端前区域(PRO-region)。氨基酸同源比对与系统进化分析表明,Ac PME蛋白与水稻、玉米、高粱等单子叶植物的同源蛋白具有较高的一致性。三维结构模式图显示该蛋白具有一个明显的凹沟,4个果胶结合位点氨基酸残基(T423、Q453、R565和W567),2个活性位点氨基酸残基(D476和D497)。本研究为洋葱Ac PME基因的结构域蛋白互作及功能研究奠定了基础。
- 孙亚玲陈立孙雨晴杨妍妍吴雄曹辰兴霍雨猛
- 关键词:洋葱克隆
- 植物源杀虫剂对韭菜迟眼蕈蚊的防治效果
- 2017年
- 随着生活水平的提高,食品安全问题成为人们关注的重点,买到无公害有机韭菜是广大消费者的热切期望。如何科学防治韭蛆,降低农药残留是当前韭菜生产上亟待解决的问题。本研究选取了一种在其他植物上防治效果良好的植物源杀虫剂,测定了其对韭蛆的室内毒力及田间防治效果,以期为引进植物源农药防治韭菜病虫害提供依据。
- 赵树华陈立杨建平
- 关键词:韭菜韭蛆有机栽培