郭继云
- 作品数：3 被引量：28H指数：3
- 供职机构：华中农业大学更多>>
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- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 茯苓甾醇C-24甲基转移酶基因克隆与功能验证
- 茯苓为我国的传统用药，有几千年的历史，具有利水渗湿、健脾、宁心之功效，同时在食物方面也有很广的用途，比如茯苓糕，茯苓酒等。茯苓酸是茯苓的主要活性成分之一，其有抗肿瘤，抗炎抗氧化，降血糖，镇静催眠等许多功效。而目前市场上的...
- 郭继云
- 关键词：茯苓生物合成茯苓酸基因克隆原核表达
- 文献传递
- 茯苓转录组SSR序列特征及其基因功能分析被引量：23
- 2015年
- 目的分析茯苓转录组中简单重复序列(SSR)信息,以及含SSR的基因功能,为开发茯苓新型分子标记奠定基础。方法利用MISA软件搜索转录组Unigene及基因组scaffold中SSR,对含SSR的Unigene使用Blast X比对nr及KEGG数据库,注释其功能,并聚类分析。结果在转录组序列中发现4.57%的Unigene序列含有2 075个SSR,平均17 010条Unigene出现1个SSR,SSR的平均长度19.59 bp;而基因组中SSR的平均密度54.00个/Mb,平均长度20.74 bp。在转录组中发现的241种碱基重复模式中,以(CG/CG)n比例最高(10.97%);以六核苷酸类重复数量最多(35.64%),以(ACCACG/CGTGGT)14最长(84 bp)。在1 887条含SSR的Unigene中,115条能被基因本体(GO)分类注释到细胞代谢进程、核酸结合等;1 223条Unigene能被注释到219个KEGG通路图中,其中314条注释到新陈代谢,297条注释到遗传信息处理。结论茯苓转录组SSR的类型丰富、多态性潜能较高,关联功能相关基因的SSR开发对茯苓目的性状的分子标记辅助育种具有巨大潜力。
- 何海郭继云马毅平周梦春王沫舒少华
- 关键词：茯苓SSR转录组生物信息
- 茯苓细胞色素P450还原酶基因的克隆与生物信息学分析被引量：3
- 2016年
- 目的从茯苓Poria cocos中克隆出细胞色素P450还原酶（CPR）基因,并对其进行生物信息学分析。方法利用茯苓转录组注释信息,通过RACE扩增得到茯苓CPR基因（Pc CPR）全长,并PCR得到对应基因组DNA序列。通过生物信息学方法,对该基因编码蛋白的特征进行分析,I-TASSER模拟出蛋白三级结构,MEGA构建蛋白系统进化树。结果获得含有完整开放阅读框（ORF）的c DNA全长2 514 bp（Gen Bank号为KP768251）,Pc CPR的基因组DNA 5 292bp（Gen Bank号为KP896487）,含4个外显子、3个内含子。基因编码732个氨基酸的蛋白,相对分子质量81 147,等电点（p I）为5.39,为不稳定性亲水蛋白,非分泌蛋白,且不具有信号识别功能。蛋白定位于内质网上,第7~22位氨基酸为跨膜区;具有2个黄素结合的保守结构域,FAD、NADP的结合位点各自在蛋白三级结构空间上相邻近。同源性分析显示,Pc CPR与担子菌CPR的相似性明显高于子囊菌CPR。结论成功从茯苓中克隆得到Pc CPR基因,为进一步研究Pc CPR及相关代谢提供基础。
- 何海郭继云舒少华王沫
- 关键词：茯苓基因克隆生物信息学分析RACE
