黄映萍
- 作品数：3 被引量：59H指数：2
- 供职机构：中山大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 锈斑蟳的COI基因序列的扩增和分析
- 2009年
- 本研究通过扩增了广东南海汕尾海域锈斑蟳COI基因的部分序列,初步分析了该海域锈斑蟳的种群遗传多样性。614bp的COI序列共检测到11个多态性位点数(polymorphic sites),其中包含9个单变异位点(singletonvariable sites),2个简约信息位点(parsimony informative sites),平均核苷酸变异位点(K)为2.778,核苷酸多样性指数(Pi)为0.00455。所检测的9个锈斑蟳个体中共定义了7个单倍型(Haplotype),单倍型多样性指数为(Haplotype diversity)0.787。总体分析表明,广东汕尾海域锈斑蟳遗传多样性程度比较均匀,种质资源总体丰度相对可观。
- 黄映萍
- 关键词：单倍型COI基因
- DNA分子标记研究进展被引量：47
- 2010年
- 探究与了解遗传变异有助于我们从分子基础上理解各种生命现象。由于并非所有的物种都进行过基因组测序,因此,分子标记技术以及它们与表型的关系可以作为有用的标签帮助我们研究遗传变异。基于DNA的分子标记如:RFLP(restriction fragment length polymorphism),RAPD(random ampli?ed polymorphic DNA),SSR(simple sequence repeats)and AFLP(ampli-?edfragment length polymorphism)等应用于生态学、分类学、进化方面、系统发生以及遗传学方面的研究。最近几年,出现了一批新的分子标记技术,这些新的分子标记技术最初源自几种基本的分子标记技术的结合。新的分子标记技术联合了基本分子标记技术的优点,提高了灵敏度以及检测基因的不连续性和特异性。新的分子标记技术利用了一组新的DNA元件如:反转录转座子、线粒体微卫星序列、叶绿体微卫星序列等,通过增加基因组的覆盖率而检测遗传的多样性。RAPD和AFLP同样应用在以cDNA为模板来研究基因的表达。这篇综述主要介绍了近二十年来各种分子技术以及其原理。
- 黄映萍
- 关键词：分子标记CAPSREMAPSRAP反转录转座子
- 粤东海域口虾蛄遗传多样性被引量：12
- 2011年
- 采用线粒体COⅠ基因序列对粤东汕尾和深圳2个海域口虾蛄(Oratosquilla oratoria)的遗传多样性进行了分析。研究表明,所分析的口虾蛄mtDNA COⅠ基因(592 bp)共检测到21个变异位点,占总位点的3.55%。转换和颠换位点数分别为18和3个,碱基替换的饱和性分析表明,口虾蛄COⅠ基因碱基替换未达到饱和,COⅠ基因适合作为分析口虾蛄遗传多样性研究的分子标记。所检测的个体一共有15个单倍型,单倍型多样性为0.971,核苷酸多样性为0.007 55。单倍型之间的遗传距离在0.047 6～0.428 6之间,平均遗传距离为0.214 1。两群体间遗传分化系数FST为0.036,群体单倍型之间的UPGAM聚类以及NETWORK亲缘关系网状图并未显示明显的地理聚类结果。粤东海域口虾蛄总体遗传多样性水平较高,遗传分化小。
- 黄映萍王莹苗素英
- 关键词：口虾蛄线粒体DNA
