王小童
- 作品数：2 被引量：5H指数：1
- 供职机构：陕西理工大学生物科学与工程学院更多>>
- 发文基金：陕西省科技统筹创新工程计划项目陕西省教育厅省级重点实验室科研与建设计划项目更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 开口箭基因组中微卫星特征分析与分子标记开发被引量：1
- 2018年
- 开口箭(Tupistra chinensis Baker)为百合科(Liliaceae)开口箭属(Tupistra Ker-Gawl)多年生草本植物,其野生资源稀少,为中国珍稀药用植物。该研究基于第二代测序技术首次建立了开口箭的基因组文库与微卫星文库,对开口箭的微卫星组成进行了特征分析,开发了开口箭SSR引物一套,并对开口箭及其近缘种进行了PCR扩增与聚丙烯酰胺凝胶电泳检测。结果表明:(1)通过对开口箭基因组测序与拼接得到23 362条基因序列,检测出微卫星位点1 465个,其中单核苷酸重复最多,二核苷酸重复长度变异最大。(2)所设计的52对微卫星引物中有14对扩增出的条带清晰且多态性丰富,每个位点的复等位基因数(Na)在2~4之间,平均为3.00;多态性信息含量(PIC)在0.336 9~0.785 6,平均为0.546 3。(3)用筛选出13对多态性引物对6个开口箭近缘种,长柱开口箭(Tupistra grandistigma)、筒花开口箭(Tupistra delavayi)、弯蕊开口箭(Tupistra wattii)、剑叶开口箭(Tupistra ensifolia)、吉祥草(Reineckia carnea)和万年青(Rohdea japonica)进行通用性检测,结果大部分引物均能在开口箭的近缘种中成功扩增,通用率较高。该研究所开发的开口箭微卫星分子标记为开展开口箭的遗传多样性研究及种质资源鉴定奠定了基础。
- 丁家玺周天华王小童
- 关键词：开口箭微卫星分子标记开发
- 开口箭种质资源的SSR遗传多样性分析被引量：4
- 2016年
- 为了分析开口箭的遗传多样性和遗传分化,应用7对微卫星引物对15个产地72份开口箭样本以及4个弯蕊开口箭样本进行了遗传多样性和遗传分化分析,并对这些样本进行UPGMA聚类分析和主相关性分析。结果表明：开口箭15个居群的遗传多样性指数h的变化范围为0.082 1-0.303 5、Nei’s遗传杂合度HE的变化范围0.139 8-0.170 2,弯蕊开口箭4个居群的遗传多样性指数h的变化范围为0.162 9-0.369 1、Nei’s遗传杂合度HE的变化范围为0.112 4-0.128 1。7对SSR引物表现出了较高的多态性,可以区分19个居群的开口箭属植物样本;开口箭和弯蕊开口箭在物种水平上的遗传多样性高,遗传分化显著,聚类分析和主相关性结果表明地理位置相近的种群亲缘关系较为相近。
- 王小童陈征周天华
- 关键词：开口箭简单序列重复种质资源鉴定
