庞美霞
- 作品数：4 被引量：21H指数：3
- 供职机构：中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 三峡库区5个鲢群体遗传变异的微卫星分析被引量：12
- 2015年
- 研究利用10个高度多态的微卫星标记对三峡水库秭归、巫山、云阳、忠县、木洞等5个库区鲢(Hypophthalmichthys molitrix)的野生群体进行了遗传多样性分析。检测到161个等位基因,群体共有等位基因84个,每个微卫星位点的等位基因数7—29不等。平均观测杂合度Ho为0.784—0.846,平均期望杂合度He为0.828—0.847,平均多态信息含量PIC为0.797—0.817。Fst值为–0.001—0.009,表明5个鲢群体间没有遗传分化。Hardy-Weinberg平衡检验表明巫山、云阳、木洞群体在一些位点上偏离遗传平衡。Bottleneck分析显示长江三峡库区江段的鲢群体可能在历史上经历了遗传瓶颈。5个群体间的遗传相似系数为0.891—0.950,遗传距离为0.050—0.115,根据Nei’s遗传距离所绘制的聚类图,表明鲢群体间的遗传距离与其地理距离基本一致。贝叶斯分析结果也证实三峡库区5个鲢群体可视为一个类群。尽管没有检测到遗传分化,数据清晰地表明三峡库区的鲢群体仍有很高的遗传多样性,研究结果为三峡地区和长江上游的鲢种质资源保护和种群评估提供了参考。
- 庞美霞俞小牧童金苟
- 关键词：微卫星野生群体三峡水库
- 基于G-SSR和EST-SSR标记的鲫6个群体遗传结构分析被引量：4
- 2018年
- 研究同时利用非编码区和编码区微卫星标记(G-SSR和EST-SSR)分析黑龙江、长江、奉化江及淮河水系共6个野生鲫(Carassius auratus)群体的遗传多样性及遗传结构,并比较2类不同来源SSR用于鲫群体遗传多样性分析的差异。8个G-SSR标记在6个鲫群体中检测到173个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为22、12.9、0.769、0.893和0.879,群体间Fst值介于0.008—0.085,其中来自黑龙江水系的2个群体与其余水系的所有群体均达到或接近于中等程度的遗传分化,而长江、奉化江和淮河水系4个群体间的遗传分化程度不明显。Nei’s遗传距离介于0.203—0.701;根据遗传距离所绘制的UPGMA聚类图将6个鲫群体划分为2个大分支,其中来自黑龙江水系的2个群体聚为一枝,其余水系群体聚为另一枝。贝叶斯分析也支持这一结果,将6个鲫群体划分为2个最佳理论群。利用8个EST-SSR标记在6个鲫群体中共检测到155个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为19、9.5、0.728、0.870和0.855;群体间Fst值和Nei’s遗传距离分别介于0.005—0.084和0.117—0.683;基于EST-SSR标记的UPGMA聚类分析和贝叶斯分析也将6个鲫群体划为两大类群:黑龙江水系群体;长江、奉化江和淮河水系群体。G-SSR和EST-SSR标记检测6个鲫群体的平均多态信息含量(PIC)分别为0.786—0.864和0.761—0.833。研究结果显示:6个野生鲫群体均具有较高的遗传多样性,但黑龙江水系群体多样性低于其他水系群体;尽管EST-SSR标记的多态性略小于G-SSR标记,但是2类微卫星标记均揭示了相似的鲫群体遗传结构和分化格局。研究结果对鲫种质资源的保护和EST-SSR标记在鱼类群体遗传学研究价值的评价提供了新的信息。
- 甘宝江庞美霞俞小牧俞小牧
- 关键词：EST-SSR
- 利用微卫星分子标记分析长江、赣江和鄱阳湖鲢群体遗传结构被引量：9
- 2016年
- 利用10个高度多态的微卫星标记对采自长江、赣江、鄱阳湖湖口和都昌水域的4个鲢野生群体遗传结构进行分析。检测到148个等位基因,每个微卫星位点的等位基因数5-24,有效等位基因数6.4-7.1,平均观测杂合度Ho为0.802-0.821,平均期望杂合度He为0.817-0.839,表明这4个鲢群体遗传多样性较高。鲢群体间的遗传相似系数为0.922 2-0.944 1,遗传距离为0.057 6-0.081 0,固定系数Fst值为-0.012 35-0.005 28,表明这4个鲢群体间遗传一致性高,遗传距离小,群体遗传分化不显著。AMOVA结果显示遗传变异主要来自群体内,基因流分析认为长江、赣江、鄱阳湖鲢群体存在频繁的基因交流。
- 于悦庞美霞俞小牧童金苟沈建忠
- 关键词：微卫星长江鄱阳湖
