目的研究德国小蠊在低温胁迫下的转录组及低温应答基因的功能富集类别和代谢通路,推测其低温应答分子机制,完善德国小蠊温度适应分子机制。方法试虫为本实验室饲养,以25℃恒温培养箱环境为对照,对4℃低温处理2 h的德国小蠊成虫进行转录组测序,识别差异表达基因,利用Gene Ontology Database基因功能富集数据库和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)基因及基因组京都信息数据库对基因功能富集和代谢途径进行分析。结果共得到44589020个“读序”,计算后表明低温应答上调表达基因332个、下调表达基因371个。低温应答基因功能富集为27个类别和35个KEGG代谢途径,基因分类包括羧酸代谢、胁迫应答反应、碳水化合物代谢、神经递质分泌、碳酸盐脱水酶活性、氧化还原酶活性、裂解酶活性、丙酮酸脱氢酶活性、丙酮酸脱氢酶复合物、水运输、非生物胁迫反应、通道活性、多细胞组织过程、肌膜、质膜、类固醇激素反应、有机物质应答反应、外肽酶、蛋白质代谢、“P-P水解”驱动蛋白跨膜转运蛋白活性、ER靶向蛋白质、水解酶活性、营养储存活性、转移酶活性、金属羧肽酶活性、脂质转运蛋白活性和细胞分裂等方面。结论德国小蠊可能从羧酸代谢、胁迫应答等27个方面应对低温胁迫,为完善德国小蠊温度应答和耐受分子机制提供了依据。
目的利用转录组学方法研究高温环境对德国小蠊基因表达的影响,以及这些基因的功能富集类别和参与代谢通路,进而推测德国小蠊的高温应答分子机制。方法以25℃环境为对照,对40℃高温处理2 h的德国小蠊成虫进行转录组测序,计算差异表达基因,利用Gene Ontology database基因功能富集数据库和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)基因及基因组京都信息数据库分析基因功能富集和代谢途径。结果测序数据经筛选后,得到93725712个读序,计算生成高温应答上调表达基因524个、下调表达基因525个。高温应答基因功能富集到14个类别和30个KEGG代谢途径,基因分类包括真菌防御反应、胁迫应答、苯丙氨酸4单加氧酶活性、L苯丙氨酸分解代谢、细胞外区、色氨酸5单加氧酶活性、芳香化酶活性、铁离子结合、氨基酸结合、膜结合细胞器、内质网膜、氧化还原酶活性、羧酸酯水解酶活性和信息素应答等方面。结论德国小蠊可能从真菌防御反应、胁迫应答等几个方面应对高温胁迫,为揭示德国小蠊高温应答和耐受分子机制提供基础。
