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徐勤民
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
供职机构:
重庆邮电大学生物信息学院生物信息学研究所
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发文基金:
重庆市自然科学基金
国家自然科学基金
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相关领域:
农业科学
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合作作者
周其兴
大连大学生物工程学院
薛庆中
浙江大学农业与生物技术学院
谭军
重庆邮电大学生物信息学院生物信...
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重庆工商大学...
年份
1篇
2007
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水稻亚种间基因组水平微卫星多态性分析
被引量:1
2007年
从公布的水稻两个亚种(籼稻9311和粳稻Nipponbare)基因组草图序列中,搜寻了所有的完整微卫星位点,发现单碱基重复中A/T重复占大多数,二碱基重复中AT/TA、GA/TC、AG/CT重复居多,三碱基中GGC/GCC、GCG/CGC、CCG/CGG重复较多。通过相互比较,不同基序和基因区域的微卫星多态性有较大差异:内含子和基因间区中微卫星的多态性较高(分别约为45%和40%),外显子中的微卫星多为三碱基重复,而且多态性较低(约为25%);两个亚种具多态性的微卫星间距平均约为12.7 kb和16.4 kb。
谭军
徐勤民
周其兴
薛庆中
关键词:
水稻亚种
基因组
微卫星
多态性
分子进化
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