肖碧玉
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：温州大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省科技厅新苗人才计划浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 比较图元向量和点的聚类系数对差异网络的研究被引量：1
- 2013年
- 差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点。网络节点往往通过与局部结构作用实现某种功能,其与局部结构的关系变化,很可能影响其功能。本文利用仿真实验的方法比较了图元向量和点的聚类系数两种局部结构测度的性能,并且利用他们分别设计算法挖掘差异网络中模块化变化的基因簇。应用AGEMAP数据库中小鼠12个组织基因表达数据进行实验,大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的GO项。
- 肖碧玉李先彬沈良忠刘文斌
- 用C++面向对象技术实现复杂生物网络集存储
- 2011年
- 高通量生物技术的发展涌现出了海量的生物网络数据。如何有效的从复杂的生物网络集中挖掘出保守的频繁模式是当代系统生物学研究的热点问题之一。由于生物数据规模大、维数高等的原因,开发出从复杂生物网络集中挖掘出保守频繁模式的应用软件往往面临着一个存储表示的难题。本文用C++面向对象的相关技术,研究了生物网络集的存储表示,并在文中最后讨论了该方法在频繁模式挖掘中的应用。
- 昝乡镇肖碧玉许鹏刘文斌
- 基于图元向量的差异共表达分析研究被引量：2
- 2015年
- 差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点.Przulj提出的图元及图元向量作为一描述网络局部结构信息的方法,已经在网络分析方法面取得了很多重要的结果.本文在图元向量的基础上提出了二种节点变化的差距度量方法,通过聚类可以分别挖掘网络中模块内变化基因簇和模块间变化基因簇.应用AGEMAP数据库中12个小鼠组织基因表达数据的结果表明:大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的CO条目.
- 肖碧玉李先斌刘文斌
