王荣
- 作品数：3 被引量：7H指数：1
- 供职机构：西南民族大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金：四川省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 牦牛病毒性腹泻病毒全基因测序及生物信息学分析被引量：1
- 2013年
- 从牦牛(Yak)体内分离出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒(BVDV/MDV),参考GenBank中已收录的BVDV-Ⅰ型的全基因组序列,设计了19对引物,通过RT-PCR方法,对牛病毒性腹泻病毒牦牛株进行克隆及测序,得到其全基因组序列(Gen-Bank登录号:JQ799141),序列全长12214nt,其中5′-UTR长288nt,3′-UTR长232nt。将牦牛株BVDV全基因序列与Gen-Bank中登录的其他8株BVDV病毒全基因序列进行同源性比对及系统进化分析,结果表明,牦牛株BVDV与BVDV-Ⅰ型毒株出于同一分支,但与其他8株BVDV毒株全基因序列同源性均不高,有可能属于新的独立基因型或基因亚型,仍需进一步研究证实。
- 王研刘亚刚王荣孙凯
- 关键词：全基因序列分析生物信息学分析
- 牛病毒性腹泻病毒实时荧光定量RT-PCR方法的建立及应用被引量：6
- 2014年
- 持续性感染和免疫耐受是牛病毒性腹泻病的重要特征,这一特征给该病的诊断、检疫及防控造成很大困难,为此,建立快速实用、高效敏感的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)检测方法具有重要意义。据GenBank中登录的BVDV 5′UTR保守区域设计并合成1对特异性引物,以SYBR GreenⅠ染料为扩增指示剂,建立了BVDV实时荧光定量RT-PCR检测方法。结果表明,该方法具有快速、敏感、特异、重复性好等优点。该方法的建立为牛病毒性腹泻病的早期快速诊断和有效检出持续性感染动物提供了手段,是该病检疫和诊断方法的补充和完善。
- 王荣李文文王研刘亚刚余琼任永刚
- 关键词：牛病毒性腹泻病毒
- 牦牛病毒性黏膜病病毒结构蛋白核苷酸的序列测定与分析
- 2012年
- 对首次从牦牛体内分离出的BVDV进行结构蛋白的研究与分析具有重要的理论价值和学术意义,本研究参考GenBank中发表的BVDV毒株的基因组序列设计四对对引物,利用PCR扩增出预期的2700bp目的片段.扩增产物克隆至pMD19-T Vector,经质粒PCR鉴定及酶切鉴定获得阳性重组质粒并对其进行测序.测序结果经DNNMAN同源性比较分析,克隆得到的结构蛋白基因与NADL株同源性最高,但核苷酸同源性仅为70.1%,推导氨基酸同源性仅为74.4%,证明牦牛株BVDV结构蛋白基因存在较大的变异.生物信息学分析表明结构序列中有片段高度疏水,蛋白基因推导氨基酸序列亲水性与抗原性成平行相关,亲水性和抗原性与标准毒株很相似.
- 刘亚刚孙凯王妍王盼盼王荣胡炳峰王文伯
- 关键词：克隆测序生物信息学分析
