邓晔
- 作品数：54 被引量：336H指数：11
- 供职机构：中国科学院生态环境研究中心更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院“百人计划”中国科学院战略性先导科技专项更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程农业科学医药卫生更多>>
- 高寒地区根瘤菌拌种对禾/豆混播土壤微生物群落的影响被引量：6
- 2022年
- 拌种根瘤菌是提高植物固氮效率的有效手段之一。本研究探讨了根瘤菌拌种处理对高寒地区典型禾/豆混播中土壤微生物群落结构和多样性的影响,旨在为根瘤菌拌种在牧草生产应用中提供理论依据。以苜蓿‘北林201’、‘川草2号’老芒麦和‘阿坝’垂穗披碱草混播为研究对象,设置根瘤菌拌种和不拌种两个处理。采集根周土壤和根际土壤,基于16S rRNA基因高通量测序技术分析原核生物多样性和群落结构,FAPROTAX对不同处理原核微生物群落功能进行预测,并通过BugBase分析比较不同处理下原核微生物高水平表型的分类和变化。32个土壤样品共检测到8814个OTU,分属于6个门3577个属。优势门为放线菌门(Actinobacteria)(26.11%-46.20%)和变形菌门(Proteobacteria)(20.61%-32.91%)。拌根瘤菌改变了牧草土壤中原核生物的群落结构,拌种处理的原核微生物多样性指数(Observed_richness、Shannon index、inverse Simpson index)都显著(P<0.05)低于不拌种。拌根瘤菌增加了消化作用以及反硝化功能的相对丰度。拌种处理后禾本科根际土壤原核微生物的需氧、厌氧、兼性厌氧、革兰氏阴性、革兰氏阳性的种群增加,而豆科结果与之相反。拌种后,豆科根际的nifH基因显著高于不拌种的丰度。拌根瘤菌降低了禾/豆混播草地土壤原核微生物的α多样性,改变了土壤原核微生物群落的结构组成,增加了消化作用和反硝化作用种群的相对丰度,并提高了nifH基因的丰度。本研究为根瘤菌拌种在禾/豆混播栽培方式提供了科学依据。
- 颜珲璘芦光新邓晔顾松松颜程良马坤赵阳安张海娟王英成周学丽窦声云
- 关键词：NIFH基因微生物多样性微生物群落结构
- 宏基因组技术在氮循环功能微生物分子检测研究中的应用被引量：36
- 2018年
- 氮循环是最重要的生物地球化学循环之一,而微生物是驱动自然环境中氮循环最重要的动力。应用宏基因组技术来研究自然环境中直接参与氮循环的功能微生物类群的总量和多样性是近年来环境微生物的研究热点之一。本文总结最新氮循环功能微生物类群的研究发现,聚焦各转化过程中(包括固氮、硝化、反硝化、厌氧氨氧化、氮同化/异化还原、氨化和同化作用等)分子标记基因的选择,重点介绍通过这些标记基因的分子检测方法在自然环境中检测到的微生物功能类群的分布状况,最后指出分子检测技术的革新和完善的数据分析平台的建立对未来氮循环功能微生物研究的重要意义。
- 王朱珺王尚刘洋荧冯凯邓晔
- 关键词：宏基因组功能基因氮循环分子检测技术
- 真菌介导的纳米金合成及其应用研究进展被引量：9
- 2016年
- 纳米金(AuNPs)凭借其独特的物理化学性质在多个领域得到了广泛的应用。相比于传统的化学、物理合成方法,微生物合成AuNPs凭借其环境友好、条件温和、绿色低毒等优势成为纳米技术领域的研究热点。相较于其他微生物,真菌能够分泌大量胞内或胞外蛋白/酶以及生物小分子,能够耐受较高浓度的AuCl_4^-,并且合成AuNPs的速度快、产量高、尺寸较为均一,因此具有大规模生产AuNPs的潜力。文章主要从合成AuNPs的真菌资源、影响纳米粒子形态的因素、合成机制与应用等方面进行综述,提出利用人工真菌群落合成AuNPs的新概念,并对未来该研究方向进行展望。
- 厉舒祯沈文丽刘洋荧邓晔由胜男裴晓芳李会杰张照婧曲媛媛
- 关键词：纳米金
- 一种基于k-mer算法的引物设计方法及系统
- 本发明提供一种基于k‑mer算法的引物设计方法及系统，该方法包括：构建功能基因核酸序列数据库，将数据库中的核酸序列分别切割为k‑mers；按照k‑mer出现频次从高到低选择若干k‑mers，作为引物备选k‑mers；将引...
- 邓晔吴悦妮
- 文献传递
- 生物降解芳香族化合物的分子检测技术研究进展被引量：9
- 2019年
- 编码环羟基化加氧酶的基因常作为评价环境中微生物降解芳香族化合物能力的分子标记.近年宏基因组学技术的出现极大地加速了对环境中功能基因及功能类群的研究.本文总结了目前关于芳香族化合物环羟基化加氧酶基因的数据库,介绍了微生物降解芳香族化合物(苯系物、萘及其它多环芳烃)过程中发挥重要作用的各类功能基因,总结了环境检测中使用的分子引物,并综述了它们在各类复杂环境样本中的检测应用,此外对使用宏基因组技术来研究微生物在环境中降解芳香族化合物的能力进行了总结与展望.
- 厉舒祯邓晔张照婧张照婧
- 关键词：芳香化合物功能基因宏基因组
- 全球变化下海岸带微生物生态研究进展
- 海岸带地区是元素循环最活跃的自然区域之一，微生物作为地球元素循环的主要驱动者，对该区域生态系统中物质转化与能量流动起着至关重要的作用。本文从典型海岸带生态系统：海岸带湿地、海草床与海藻森林、近岸水体出发，围绕微生物参与的...
- 周煜琦张照婧位光山张政邓晔
- 关键词：全球变化海岸带生态系统碳循环氮循环
- 全球变化下海岸带微生物生态研究进展
- 海岸带地区是元素循环最活跃的自然区域之一，微生物作为地球元素循环的主要驱动者，对该区域生态系统中物质转化与能量流动起着至关重要的作用。本文从典型海岸带生态系统：海岸带湿地、海草床与海藻森林、近岸水体出发，围绕微生物参与的...
- 周煜琦张照婧位光山张政邓晔
- 关键词：全球变化海岸带生态系统碳循环氮循环
- 土壤中塑料与微生物的相互作用及其生态效应被引量：16
- 2021年
- 聚焦于土壤环境中包括微塑料在内的塑料污染,综述了微生物与土壤塑料相互作用的最新研究成果.主要内容包括:(i)土壤塑料的来源、迁移及其在土壤中长期贮存的基本特征;(ii)土壤微生物对塑料的影响;(iii)塑料污染对土壤微生物群落及酶活性、土壤动物、农作物生产以及对全球陆地生态系统功能的影响.最后,本文展望了未来相关研究的重点方向,包括功能微生物、实验参数设置、塑料圈、塑料与土壤微生物的大尺度及长期研究等,为从微生物角度认识和解决土壤塑料污染问题提供参考.
- 鞠志成金德才邓晔
- 关键词：塑料土壤微生物生态影响
- 微生物还原Se(Ⅵ)和Se(Ⅳ)合成SeNPs机理研究新进展被引量：14
- 2017年
- 硒(Se)是自然界中重要的元素之一,微生物在硒的生物地球化学循环中发挥着至关重要的作用.细菌、真菌及放线菌等多种微生物能够通过同化还原、异化还原等途径将Se(VI)和Se(IV)还原为硒纳米粒子(Se NPs).本文综述了目前已知的能够还原Se(VI)和Se(IV)的微生物资源及其还原机理,并总结了在硒化合物转运、Se NPs尺寸控制和稳定等过程中发挥重要作用的蛋白质和酶.微生物对Se(VI)的还原主要通过硒酸盐还原酶实现,而对Se(IV)的还原则通过包括亚硫酸盐还原酶、亚硝酸盐还原酶、谷胱甘肽和谷胱甘肽还原酶、硫氧还蛋白和硫氧还蛋白还原酶等多种酶促还原途径、非酶促还原途径以及作为电子受体参与的细胞呼吸过程来实现.多种不同的蛋白质和酶在Se(VI)和Se(IV)的跨膜转运、Se NPs的尺寸控制、稳定及外排等过程中发挥着重要的作用,它们不仅控制着硒化合物的还原过程,也会对Se NPs进行修饰从而改变Se NPs的物理化学性质,影响硒在环境中的归趋.今后仍需要不断开发新的能够代谢硒化合物的微生物资源,并结合基因组学、转录组学、蛋白组学等多种组学手段对微生物转化硒化合物的关键基因和调控系统等进行深入解析.
- 厉舒祯沈文丽邓晔裴晓芳由胜男张照婧王经伟张旭旺曲媛媛
- 关键词：硒纳米硒
- 一种利用碳基纳米材料提升真菌群落检测准确性的方法
- 本发明公开了一种利用碳基纳米材料提升真菌群落检测准确性的方法，包括以下步骤：(1)采集真菌群落样本，提取真菌群落样本的ITS rRNA基因，并根据真菌群落样本的ITS rRNA基因设计并合成上下游引物；(2)将碳基纳米材...
- 邓晔刘洋荧厉舒祯
