郝园园
- 作品数：18 被引量：22H指数：3
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- 发文基金：国家自然科学基金海南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于加权关联网络分析的辣椒(Capsicum annuum L.)果实颜色转变相关基因的鉴定被引量：1
- 2022年
- 辣椒属于茄科(Solanaceae)辣椒属(Capsicum L.)一年生或多年生植物,其播种面积和产值在中国均居蔬菜首位。果色是辣椒众多经济性状中最直观的性状之一,直接影响人们的购买选择。辣椒果色受多种因素调控,相关色素生物合成的分子调控还需进一步解析。本研究以果实发育过程中呈现5种颜色的辣椒种质HNCA0076为实验材料,进行了生理检测、转录组测序以及WGCNA分析。在果实5个不同颜色时期,叶绿素含量变化较大,类胡萝卜素含量整体呈现递增趋势,类黄酮含量无明显变化,花色苷含量在紫色果期后逐渐降低,橙色果期后又逐渐升高。RNA测序数据质量满足进一步分析要求。4个转色期的上调(下调)表达基因数分别为826(276)、390(588)、1248(1800)和1528(2485),随着果实的逐步发育,相邻比较组合中的差异基因的数量逐渐增加。差异表达基因经GO富集分析,主要集中在分子功能中的四吡咯结合、血红素结合、转移酶活性、氧化还原酶活性、铁离子结合和水解酶活性等过程;KEGG富集分析主要富集在类胡萝卜素生物合成、类黄酮生物合成和淀粉、蔗糖代谢等信号通路,其中类胡萝卜素代谢途径的3个基因在紫色时期向黄色时期的转变过程中表达上调,类黄酮代谢途径的11个基因在黄色时期向红色时期的转变过程中表达下调。4个对比组合差异基因分别注释到8877、8736、8689、8573个转录因子,共同注释到8049个转录因子,包括AP2、F-box、MYB和UDPGT等类型。利用非冗余的差异表达基因进行了加权关联网络分析,关联到4个与叶绿素、类胡萝卜素、花色苷、类黄酮含量相关的模块,进一步分析表明p450(LOC107859314)、Pkinase(LOC107839192、LOC107875415)、F-box(LOC107863894)和zf-MYND(LOC107852593)等29个转录因子可能参与辣椒果实转色的调控。本研究为进一步探索辣椒果实色素形成过程中的关键调控因子以及分析�
- 金威恒MUMTAZ Muhammad Ali何成尧夏禹郝园园李彩朝汪志伟
- 关键词：转色类胡萝卜素类黄酮
- 一种由空心菜茎秆第一节间诱导再生植株的方法
- 本发明公开了一种由空心菜茎秆节间诱导再生植株的方法，包括选取种子灭菌后接种于生苗培养基暗培养至种子露白后，进行正常光照培养，生苗培养基为MS添加0.05％含量PPM；切取无菌苗茎秆第一节间作为外植体，接种于诱芽培养基上诱...
- 汪志伟郝园园舒黄英杨壮周燕成善汉朱国鹏
- 文献传递
- 空心菜离体再生体系的构建及不同光周期转录组分析
- 空心菜(Ipomoea aquatica Forsk)是旋花科番薯属一年或多年蔓生草本植物,既能水生也能陆生,极易长出不定根且具有耐高温高湿的特性。本研究以空心菜为试验材料,构建空心菜高频离体再生体系,同时对两个品种的空...
- 郝园园
- 关键词：空心菜不定芽诱导光周期转录组
- 空心菜WRKY基因家族成员鉴定与表达分析被引量：3
- 2023年
- 为了更好地了解植物特有的WRKY转录因子在调控空心菜(Ipomoea aquatica)花青素生物合成途径中的作用,利用课题组前期发表的高质量基因组数据,对空心菜WRKY基因家族成员(IaWRKY)进行了全基因组鉴定与表达分析。结果显示,空心菜拥有82个IaWRKY基因。其中,80个IaWRKY基因可以分为3组(Ⅰ组,Ⅱ组和Ⅲ组)。另有2个IaWRKY基因(IaWRKY10和IaWRKY75)没有与拟南芥WRKY基因(AtWRKY75)聚类在一起。此外,Ⅱ组可以进一步分为5个亚组。motif分析显示,同一亚组的IaWRKY蛋白具有相似的motif分布模式。基因结构分析显示,大多数IaWRKY基因拥有3个外显子。染色体定位分析显示,IaⅢWRKY基因不均匀分布在15条染色体和4条Scaffold上。启动子序列分析显示,IaWRKY基因具有多种顺式作用元件。RNA-seq与RT-qPCR结果分析显示,IaWRKY26基因在紫色茎秆空心菜中的转录本丰度是绿色茎秆空心菜中的30倍以上。本研究为探索植物花青素合成机理提供了重要的基因资源。
- 张宇欣刘征张唐权郝园园成善汉汪志伟朱婕马武强包文龙
- 关键词：空心菜WRKY转录因子生物信息学
- 中国辣椒和柔毛辣椒离体再生体系的构建
- 辣椒含有5个栽培种。目前辣椒离体再生的研究主要集中于一年生辣椒(Capsicum annuum),其它辣椒栽培种离体再生体系的研究较少。在辣椒再生体系研究中发现,基因型、外植体类型以及激素配比对辣椒再生具有重要影响,使其...
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- 关键词：中国辣椒
- 文献传递
- 一种柔毛辣椒外植体诱导再生苗的方法
- 本发明公开了一种柔毛辣椒外植体诱导再生苗的方法，包括先获取无菌苗，后切取带柄子叶作为外植体，接种到诱导培养基上诱导获得不定芽、再依次切分转移至伸长培养基和生根培养基，其中MS诱导培养基为MS+6‑BA 5.0mg/L+I...
- 汪志伟舒黄英朱丽蓉郝园园杨壮成善汉朱国鹏
- 文献传递
- 一种中国辣椒果实发育晚期红色性状的dCAPS标记及应用
- 本发明提供了一种新的与中国辣椒果实发育晚期颜色相关的SNP位点，其位于第6号染色体上的239864112位(参考基因组版本：ASM227189v2)；针对上述SNP位点，本发明还提供了相应的dCAPS分子标记、特异性引物...
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- 中国辣椒(Capsicum chinense)果色转变的比较代谢组分析被引量：1
- 2023年
- 为探究辣椒果实转色前后的代谢产物差异,本研究以中国辣椒两份种质(HNUCC16和HNUCC22)为实验材料,采用LC-MS法检测中国辣椒的非靶向代谢物质,比较分析了辣椒转色前后的代谢产物。结果表明,在两份中国辣椒种质果实中,转色后果实中的苯丙氨酸、L-天冬酰胺、天冬氨酸等代谢物的含量显著高于转色前的果实,并与ABC转运蛋白代谢通路(ABC transporters)、丙氨酸,天冬氨酸和谷氨酸代谢通路(Alanine,aspartate and glutamate metabolism)、氨酰t RNA生物合成(Aminoacyl-tRNA biosynthesis)等密切相关。通过比较两份中国辣椒种质转色后果实中的差异代谢物,发现HNUCC22中棕榈酸、次黄嘌呤、葡萄糖、天冬氨酸等物质含量显著高于HNUCC16,且与氨酰tRNA生物合成通路、半胱氨酸和蛋氨酸代谢等通路相关。本研究为中国辣椒果色等相关性状的分子遗传改良提供一定的参考。
- 张晓宁李彩朝金威恒叶正张雨李林舒黄英郝园园汪志伟
- 关键词：中国辣椒果色LC-MS
- 一种柔毛辣椒外植体诱导再生苗的方法
- 本发明公开了一种柔毛辣椒外植体诱导再生苗的方法，包括先获取无菌苗，后切取带柄子叶作为外植体，接种到诱导培养基上诱导获得不定芽、再依次切分转移至伸长培养基和生根培养基，其中MS诱导培养基为MS+6‑BA 5.0mg/L+I...
- 汪志伟舒黄英朱丽蓉郝园园杨壮成善汉朱国鹏
- 文献传递
- 一种下垂辣椒离体再生体系的构建方法
- 本发明公开了一种下垂辣椒离体再生体系的构建方法，属于植物组织培养技术领域。所示构建方法包括无菌苗的获取、诱导培养、继代培养、生根培养和炼苗移栽。本发明建立了经过无菌苗带柄子叶诱导获得下垂辣椒的高效再生体系，提高下垂辣椒再...
- 汪志伟舒黄英葛平飞郝园园成善汉朱国鹏
