张焕
- 作品数：2 被引量：7H指数：2
- 供职机构：南昌大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- CRISPR-Cas9多靶点载体构建及高效定向编辑水稻苯达松抗性基因CYP81A被引量：4
- 2017年
- 水稻CYP81A6基因(Bel)编码的细胞色素P450单加氧酶对苯达松和磺酰脲类除草剂具有抗性,该基因的隐性纯合突变体(bel)表现为苯达松敏感致死性,可作为植物化学致死标记,在水稻杂交制种中具有重要的应用价值。本研究在CYP81A6基因的首个外显子中设计两个靶位点,构建了含多靶点的CRISPR-Cas9载体,通过根癌农杆菌介导法转化粳稻中花11,获得了56株转基因T0代阳性植株,提取其中9株基因组DNA进行靶位点测序检测,发现基因敲除突变率为77.8%,其中纯合突变率高达71.4%,对纯合突变体水稻喷施苯达松,均表现出对苯达松敏感致死。为应用CRISPR-Cas9技术培育苯达松敏感致死水稻不育系和对其他水稻基因进行编辑提供理论依据。
- 聂旺彭威余雅心张焕陈秋生刘长爱廖鹏飞
- 关键词：苯达松
- 水稻OsHDT703基因的可变剪接体分析被引量：3
- 2019年
- 为了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703,并分析其存在的可变剪接体。利用生物信息学分析,结合RT-PCR、TA克隆和测序等方法,鉴定1个水稻中全新的HD2蛋白成员(OsHDT703)。结构域分析发现,在其N端含有HD2家族的NPL保守结构域。选取来源于7个物种的16个HD2蛋白,构建蛋白进化树,结果发现,OsHDT703蛋白与OsHDT702蛋白处于同一分支;OsHDT701则处于另一分支,说明水稻中HD2家族蛋白可能存在功能分化。根据预测的不同剪接体设计4对特异性引物,以粳稻中花11叶片和幼穗cDNA为模板,利用RT-PCR扩增,结合TA克隆,通过测序比对,成功鉴定到4种不同可变剪接体序列。由于3号(OsHDT703.3)和4号(OsHDT703.4)剪接体的CDS序列完全相同,所以证明OsHDT703至少存在4种不同可变剪接体。综上所述,鉴定到水稻中1个全新的HD2蛋白,命名为OsHDT703,并且鉴定出至少4种存在可变剪接体,为后续深入研究该基因生物学功能奠定基础。
- 邹志明邹海霞张焕李绍波王鑫欧阳解秀
- 关键词：水稻可变剪接生物信息学
