李斌
- 作品数：9 被引量：40H指数：3
- 供职机构：中南大学信息科学与工程学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金湖南省自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学农业科学建筑科学更多>>
- 生物信息学中的分布式计算被引量：3
- 2006年
- 生物信息学的发展给计算机技术带来了挑战,通过介绍当前在生物信息学研究领域已经得到广泛使用或正在研发的各种分布式计算平台、工具或研究项目,以此来概观生物信息学领域中分布式计算应用的现状。
- 李斌李义兵何红波
- 关键词：生物信息学分布式计算网格P2PAGENT
- 生物信息学对计算机科学发展的机遇与挑战被引量：22
- 2005年
- 生物信息学是一个发展很快的新兴学科 ,是计算机应用的最重要的领域之一 ,同时生物信息学的发展又给计算机学科提出了许多新的课题 ,从而促进计算机学科自身的发展。从数据库技术、海量存储技术、数据挖掘、计算几何、DNA计算、网格计算、机器学习、人工心智、webservice等方面 ,就生物信息学对计算机科学发展的促进作用进行了论述。
- 何红波谭晓超李斌李义兵
- 关键词：生物信息学数据库技术数据挖掘计算机科学
- 基于LZ复杂性距离的蛋白质三维结构比较
- 2007年
- 基于LZ复杂性距离提出了一种非比对的蛋白质三维结构比较方法.该方法以蛋白质结构单元间的条件LZ复杂性为特征参数,根据条件LZ复杂性计算LZ复杂性距离来作为蛋白质三维结构（不）相似程度的定量刻画.该方法可在二次多项式的时间限度内计算完成.蛋白质的结构数据采用接触图的表示方式,以避免PDB格式数据中的非结构信息和不同坐标系对结构比较的影响.以真实的蛋白质三维结构数据所组成的5个数据集为实例,基于LZ复杂性距离对各数据集中的蛋白质单链进行了结构聚类.聚类的结果符合各蛋白质单链在传统的结构分类数据库中的分类,表明论文提出的方法能够有效地对蛋白质三维结构进行定量比较.
- 李斌李义兵何红波
- 关键词：生物信息学蛋白质三维结构
- 基于LZ复杂性相似度的垃圾邮件识别被引量：3
- 2007年
- 提出一个基于符号序列间LZ复杂性相似度的垃圾邮件识别方法。相比基于向量空间模型的邮件识别,邮件文本间的LZ复杂性相似度计算无需对文本进行预处理和特征提取。同时,K近邻规则的延迟学习特性适合于垃圾邮件样本需要动态调整的应用环境。在Ling-Spam邮件语料集上对提出的识别方法进行十重交叉验证,其总体的识别效果优于基于向量空间模型的部分统计和机器学习方法。
- 李斌李义兵何红波
- 关键词：垃圾邮件
- 事件驱动法模拟输配水管网中余氯浓度变化被引量：4
- 2003年
- 考虑余氯在水体中衰减和与管壁发生反应两个消耗输配水管网中余氯的主要途径,依据这两个途径组合下的余氯浓度衰减模型,利用事件驱动模拟机制及事件调度算法,实现对输配水管网中余氯浓度变化的动态模拟.文中给出了一个模拟实例,模拟结果与真实的余氯浓度变化情况体现出良好的吻合性.
- 许仕荣李斌李黎武
- 关键词：输配水管网
- 基于DNA序列LZ复杂性距离的系统进化树重构被引量：4
- 2006年
- 根据LZ复杂性的原理,提出了序列间条件LZ复杂性的概念.基于条件LZ复杂性,定义了非空序列间的LZ复杂性距离.选取20种有胎盘哺乳动物,以它们的全线粒体基因组作为分子数据,计算两两之间的LZ复杂性距离,得出距离矩阵.根据计算出的LZ复杂性距离矩阵重构了20种有胎盘哺乳动物的系统进化树.基于LZ复杂性距离所得的系统进化树支持有胎盘哺乳动物中的灵长动物（Primates）、原蹄动物（Ferungulate）和啮齿动物（Rodents）三者之间灵长动物与原蹄动物之间亲缘关系更近一些的观点.
- 李斌何红波李义兵
- 关键词：生物信息学
- 一种基于正常简档聚类的自适应异常检测模型被引量：1
- 2009年
- 为解决入侵检测系统存在检测率低、网络数据变化适应性弱的问题,选取正常数据记录通过聚类算法建立正常简档,然后依据正常简档对网络数据记录进行检测,并结合已检测出来的正常数据记录对正常简档进行更新。KDDCUP99数据的实验表明,该系统能够适应数据的变化趋势,在保持较低的误报率前提下获得了较好的检测率。
- 刘卫国李斌
- 关键词：入侵检测聚类自适应
- 符号序列间的LZ复杂性距离及其应用被引量：2
- 2007年
- 在符号序列LZ复杂性的计算原理上,提出了序列间条件LZ复杂性的概念.基于条件LZ复杂性,定义了一个非空序列间的LZ复杂性距离并证明了该距离满足距离测度的4个基本性质.将LZ复杂性距离应用于计算语言学和生物信息学的研究领域,选取20种自然语言文本和29种有胎盘哺乳动物的全线粒体基因组,将它们视为不同符号集上的符号序列,分别计算两类符号序列的LZ复杂性距离矩阵.基于LZ复杂性距离矩阵,重构了20种语言的语言关系树和29种哺乳动物的系统进化树.其结果符合它们真实的演化关系,说明了LZ复杂性距离定量刻画符号序列间差异的有效性.
- 李斌李义兵何红波
- 关键词：计算语言学生物信息学
- 基于复杂性K近邻规则的蛋白质亚细胞位点预测被引量：1
- 2007年
- 提出了一个基于符号序列LZ复杂性相似度和K近邻规则的蛋白质亚细胞位点类型预测的方法。相比许多其他特征参数,蛋白质序列的LZ复杂性相似度计算无需深入的生物学领域知识和除序列数据以外的其他辅助数据。同时,K近邻规则的延迟学习特性适合于亚细胞位点类型已知的蛋白质数据的动态增加。在标准的RH数据集上对该预测方法进行10重交叉验证,其总体的预测准确率优于4种对照预测方法。
- 李斌李义兵何红波
- 关键词：生物信息学K近邻蛋白质
