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昆明地区2019年HIV/HCV共感染患者HCV核衣壳蛋白基因分型被引量：3: 2023年; 目的基于丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV)核衣壳蛋白(nucleocapsid protein)基因序列了解昆明地区人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus, HIV)/HCV共感染患者中HCV基因型及基因亚型流行情况。方法 2019年3—8月在云南省传染病医院收集临床诊断为HIV/HCV共感染住院且户籍地为昆明所辖14个县级市、区及县的患者血清,从血清中提取病毒RNA,反转录合成第一链cDNA,采用HCV核衣壳蛋白基因特异性引物进行巢式PCR扩增。结果共收集到临床诊断疑似HIV/HCV患者样本64例,采用HCV核衣壳蛋白基因特异性引物扩增,其中17例样品扩增阳性。序列分析结果显示,有9例病例的序列与HCV 3b基因亚型序列位于同一个进化分支,核苷酸同源性为93.3%~95.2%;5例病例的序列与HCV 1b基因亚型序列位于同一个进化分支,核苷酸同源性为96.8%~97.6%;1例病例序列与HCV 3a基因亚型序列位于同一个进化分支,核苷酸同源性为95.2%;1例病例序列与HCV 6n基因亚型序列位于同一个进化分支,核苷酸同源性为97.9%;1例病例与HCV 6u基因亚型序列位于同一个进化分支,核苷酸同源性为98.4%。结论昆明地区存在着HCV 1b、HCV 3a、HCV 3b、HCV 6n和HCV 6u等多个基因型/基因亚型HCV流行,以HCV 3b为主要流行的基因亚型。; 朱燕涛刘俊仪张米张念李健健杨壁珲亢丽娟李雄君刘家法王佳丽; 关键词：丙型肝炎病毒基因亚型核衣壳蛋白

一种优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白基因及其在制备病毒样颗粒中的应用: 本发明公开了一种优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白基因及其在制备病毒样颗粒中的应用。本发明经优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白全长基因如SEQ ID NO.1所示，该序列是针对大肠杆菌表达系统进行的部分优化。与密码子全部优化或不...; 涂亚斌蔡雪辉王刚孙明霞

大黄鱼肿大细胞病毒不同毒株的细胞培养及主要衣壳蛋白基因比较被引量：1: 2023年; 为建立大黄鱼肿大细胞病毒的培养方法,明确其分类地位,用肿大细胞病毒检测呈阳性的大黄鱼幼鱼病料(FD201807和SA201808)肾组织匀浆液感染鳜仔鱼细胞系(mandarin fish fry cell line-1,MFF-1)并连续传代,从病料组织匀浆液和细胞冻融液中提取病毒DNA,克隆病毒主要衣壳蛋白基因(mcp),测序后与NCBI GenBank中的虹彩病毒科肿大细胞病毒属病毒mcp以及2018—2020年所检出的15株大黄鱼肿大细胞病毒mcp进行比对分析。结果显示,病毒传至第4代才可引起MFF-1细胞病变,细胞病变的主要特征为细胞脱壁、变圆、折光度增强;感染时间越长脱壁细胞越多,同时培养液中的颗粒增加;透射电镜下可见感染细胞的细胞质散在大小为130~150 nm的六边形病毒粒子和空壳。感染细胞的病变周期随传代代次的增加而缩短,第15代次的FD201807株感染细胞80%细胞病变的时间为3 d,第15代次的SA201808株感染细胞80%细胞病变的时间为7~8 d。mcp序列比对和聚类分析发现,SA201808株与FD201807株的mcp序列存在21个碱基差异,二者的mcp序列分别与大黄鱼虹彩病毒(largeyellowcroakeriridovirus,LYCIV)LYCIVZhoushan(GenBank:MW139932.1)和花鲈虹彩病毒(Lateolabrax maculatus iridovirus,LMIV)(GenBank:MH577517.1)相近。15株从大黄鱼病料检出的肿大细胞病毒中,12株的mcp序列与SA201808株聚类;3株与FD201807聚类。本研究利用MFF-1细胞系分离培养了大黄鱼肿大细胞病毒,揭示了大黄鱼肿大细胞病毒存在差异,为更好地了解大黄鱼肿大细胞病毒提供了数据参考。; 杨西西池洪树郑在予刘晓东罗潘潘许斌福陈秀霞龚晖; 关键词：大黄鱼细胞培养

一种缺失衣壳蛋白基因的基孔肯雅病毒感染性克隆及构建方法和在制备减毒疫苗中的应用: 本发明属于生物技术领域，具体公开了一种缺失衣壳蛋白基因的基孔肯雅病毒感染性克隆及构建方法和在制备减毒疫苗中的应用，其克隆拯救出的CHIKV‑ΔC病毒可作为减毒疫苗，拯救出的病毒与野生型CHIKV病毒噬斑形态、生长趋势相似...; 张波邓成林张亚南李嘉琪李娜李晓张秋艳叶寒青袁志明; 文献传递

一种兔出血症病毒2型衣壳蛋白基因重组杆状病毒、疫苗及其制备方法和应用: 本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种兔出血症病毒2型衣壳蛋白基因重组杆状病毒、疫苗及其制备方法和应用。本发明通过反转录PCR扩增兔出血症病毒2型衣壳蛋白VP60基因，将基因序列进行昆虫细胞密码子优化后合成基因并克隆至真核...; 范志宇王芳胡波宋艳华魏后军陈萌萌仇汝龙朱伟峰薛家宾

一种优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白基因及其在制备病毒样颗粒中的应用: 本发明公开了一种优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白基因及其在制备病毒样颗粒中的应用。本发明经优化后的猪圆环病毒3型衣壳蛋白全长基因如SEQ ID NO.1所示，该序列是针对大肠杆菌表达系统进行的部分优化。与密码子全部优化或不...; 涂亚斌蔡雪辉王刚孙明霞; 文献传递

一种缺失衣壳蛋白基因的基孔肯雅病毒感染性克隆及构建方法和在制备减毒疫苗中的应用: 本发明属于生物技术领域，具体公开了一种缺失衣壳蛋白基因的基孔肯雅病毒感染性克隆及构建方法和在制备减毒疫苗中的应用，其克隆拯救出的CHIKV‑ΔC病毒可作为减毒疫苗，拯救出的病毒与野生型CHIKV病毒噬斑形态、生长趋势相似...; 张波邓成林张亚南李嘉琪李娜李晓张秋艳叶寒青袁志明; 文献传递

一种新型衣壳蛋白基因修饰腺病毒载体及其用途: 本发明涉及生物医学领域，涉及一种新型衣壳蛋白修饰的重组腺病毒载体。具体涉及到一种不影响包装、对人体正常细胞无毒害作用、并且对肿瘤或癌症细胞具有特异性高杀伤力的靶向性腺病毒载体及其用途。; 于彬于湘晖孔维王真; 文献传递

PCV2型衣壳蛋白基因、表达菌株及可溶性表达方法: 本发明公开了PCV2型衣壳蛋白基因、表达菌株及可溶性表达方法，所述基因的核苷酸序列为SEQ ID NO．1。所述基因在大肠杆菌中表达，所述大肠杆菌为大肠杆菌BL‑21。本发明利用生物信息学手段，通过自主设计，对猪圆环病毒...; 吴元子闫超蒋烨蔡振巫水根熊文丽; 文献传递

不同类型柑橘中黄脉病毒衣壳蛋白基因的保守性及复制水平被引量：4: 2017年; 为研究不同柑橘品种对柑橘黄脉病毒(Citrus yellow vein clearing virus,CYVCV)变异的影响,将CYVCV毒株CQ01嫁接接种于4类共35个柑橘品种,对不同植株中CYVCV的衣壳蛋白(CP)基因进行分析,结果发现仅有少数位点发生了变异。运用RT-qPCR技术检测不同柑橘品种中CYVCV的相对含量,发现甜橙类品种中CYVCV的相对含量最高,墨西哥来檬中CYVCV的相对含量最低。植株中CYVCV的含量与其症状不存在明显的关联。; 陈洪明马丹丹金鑫李太盛邓雨青刘翠花吴强李中安周彦; 关键词：柑橘 RT-QPCR

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