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宁夏地区葡萄卷叶伴随病毒遗传变异的PCR -SSCP 分析 被引量：5 2019年 PCR 技术对宁夏酿酒葡萄不同种植区的7个主栽品种的GLRaV-1和GLRaV-3进行分子检测,利用SSCP 技术对扩增片段进行遗传变异分析 .试验结果共获得8个GLRaV-1和13个GLRaV-3的阳性样本.8个GLRaV-1分离物基于CP基因分析 差异明显,可分为3类;13个GLRaV-3分离物基于RdRp基因分析 差异明显,可分为3类,而基于CP和HSP70基因分析 可分为2类.说明宁夏酿酒葡萄不同种植区、不同品种的GLRaV-1和GLRaV-3种群分子特性存在差异且遗传变异明显.这有助于宁夏地区酿酒葡萄GLRaVs流行学调查和分子诊断分析 ,为该病害的防控提供理论依据.关键词：葡萄卷叶伴随病毒 RT-PCR检测 SSCP 斑马鱼肠道细菌的16S rDNA分子鉴定及PCR -SSCP 分析 被引量：3 2018年 PCR -SSCP 分析 。结果表明:从斑马鱼肠道分离纯化出12株细菌,分别命名为Zf1、Zf2、Zf3、Zf4、Zf5、Zf6、Zf7、Zf8、Zf9、Zf10、Zf11和Zf12,其中对7株分离菌构建p MD18-T/16S r DNA的阳性克隆测序显示,Zf1、Zf11菌株与Aeromonas veronii的16S rDNA序列一致性为99%,Zf4、Zf8菌株与Sphingomonas sp.的一致性为99%,Zf5菌株与Bacillus subtilis的一致性为99%,Zf7菌株与Aeromonas sp.M10的一致性为99%,Zf10菌株与uncultured bacterium clone GI3-M-5-G01的一致性为92%;16S r DNA分子鉴定表明,Zf1、Zf7和Zf11属于气单胞菌属Aeromonas,Zf4、Zf8属于鞘氨醇单胞菌属Sphingomonas,Zf5属于芽孢杆菌属Bacillus,Zf10为一种新菌株;采用PCR -SSCP 技术对12株细菌16S r DNA基因V3区进行多态性分析 ,结果显示,斑马鱼肠道细菌16S r DNA基因V3区存在多态性,其中Zf1与Zf11菌株带型一致,Zf4与Zf8菌株带型一致。本研究结果可为揭示鱼类肠道菌群结构对其生命活动的影响提供科学参考。关键词：斑马鱼 肠道细菌 RDNA PCR-SSCP 小尾寒羊KAP6.4基因PCR -SSCP 分析 被引量：1 2016年 PCR -SSCP 技术检测KAP6.4基因的SNP多态。试验检测到2种基因型,其中AA(基因型频率为0.778)为优势基因型,A(等位基因频率为0.889)为优势等位基因。测序结果显示,AA型基因和Gen Bank登陆序列相一致,AB型基因在编码区发生了7处碱基突变和增添36 bp片段。分析 表明,AB型变异造成了3个氨基酸残基的变化。以上结果表明,KAP6.4基因在小尾寒羊群体中存在多态性,这为进一步在小尾寒羊群体中开展绒毛性状与KAP6.4基因多态性的关联分析 提供依据。关键词：PCR-SSCP 小尾寒羊 SNP 猪基因PCR -SSCP 分析 条件优化的研究 2016年 PCR -SSCP 技术作为一种区分检测基因组之间微小差异的有效方法 ,具有快速、简便、灵敏和适用于大量样品筛选的特点。但影响基因测验的因素很多,为探讨猪基因PCR -SSCP 分析 的优化条件,经过反复对照实验发现,在凝胶浓度12%,电压4℃120v12h或室温下250v10min后120v10h,甘油浓度0%,电泳温度4℃等条件下效果最佳,条带最清晰。关键词：PCR-SSCP 中卫山羊KAP6.2基因的PCR -SSCP 分析 被引量：3 2015年 PCR -SSCP 技术检测KAP6.2基因的SNP多态。试验检测到5种基因型,4个等位基因,其中AA(基因型频率为0.51)为优势基因型,A(等位基因频率为0.61)为优势等位基因。群体多态信息含量为0.45,为中等多态。试验结果显示KAP6.2基因在中卫山羊群体中存在中等多态性,这将为在中卫山羊群体中开展绒毛性状与KAP6.2基因多态性的关联分析 提供遗传根据。关键词：中卫山羊 KAP 羊绒 SNP 山羊GnRHR基因部分序列PCR -SSCP 分析 2015年 PCR -SSCP 技术分析 GnRHR基因外显子1、外显子2和外显子3部分序列在建昌黑山羊、努比亚山羊2个山羊品种中的多态性。结果表明,外显子2、3的扩增片段中,2个山羊品种都无多态性。而在外显子1的扩增片段中,2个山羊品种均检测到CC、CD基因型;建昌黑山羊的CC、CD基因型频率分别为0.62和0.38,努比亚山羊CC、CD基因型频率分别为0.64和0.36。多态片段测序分析 表明,GnRHR基因c DNA序列的第85处碱基发生C→A的突变,突变导致编码的氨基酸由亮氨酸(Leu)→异亮氨酸(IIe);第156处碱基发生A→G的突变,该突变没有导致氨基酸的突变,为沉默突变。关键词：建昌黑山羊 3个绵羊群体MSTN基因编码区PCR -SSCP 分析 被引量：3 2014年 PCR -SSCP 技术分析 了3个不同绵羊品种(杜泊绵羊、小尾寒羊、晋中绵羊)肌肉生长抑制素(MSTN)基因的单核苷酸多态性。根据3个绵羊品种MSTN基因Exon1(P1)、Exon2(P2和P3)和Exon3(P4和P5)序列设计5对PCR -SSCP 引物并扩增,经SSCP 分析 ,P1位点检测到A和B两个等位基因,AA、AB、BB三种基因型;且在晋中绵羊上处于Hardy-Weinberg平衡状态,而在小尾寒羊和杜泊绵羊上极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态。P2和P5位点没有检测到多态位点。P3位点检测到A和B两个等位基因,AA、BB两种基因型;且在3个绵羊品种上极显著偏离HardyWeinberg平衡状态。P4位点检测到A、B和C三个等位基因,AA、AB、AC三种基因型;且在小尾寒羊上处于Hardy-Weinberg平衡状态,在晋中绵羊上处于Hardy-Weinberg不平衡状态,在杜泊绵羊上极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态。关键词：MSTN PCR-SSCP 等位基因 甘南牦牛CYGB基因外显子多态性的PCR -SSCP 分析 PCR 扩增，成功获得了甘南牦牛的CYGB基因序列，并通过Lasergene7.1和PredictProtein等相关软件对其核苷酸序列、编码产物的基本...关键词：甘南牦牛 生物信息学 遗传多态性 文献传递 优质肉鸡ADSL及GART基因PCR -SSCP 分析 2013年 PCR -SSCP 技术对大恒鸡S01品系共计300只鸡的ADSL及GART基因进行多态性分析 ,结果显示:ADSL基因第9个外显子存在一个SNP位点,测序结果显示其纯合子CC与TT相比有一个C10191T的单碱基突变;GART基因在5’侧翼序列存一个SNP位点,其纯合子AA与BB相比有一个C153T单碱基突变,采用独立性χ2分析 发现,ADSL及GART基因都达到Hardy-Weinberg平衡.关键词：IMP PCR-SSCP 德保矮马生长激素受体基因PCR -SSCP 分析 被引量：3 2013年 PCR 扩增出德保矮马GHR基因的9个外显子片段(eoxn 2～10),单链构象多态性(SSCP )分析 这些片段多态性,并进行群体遗传学分析 。结果表明:德保矮马GHR基因9个片段中有3个片段表现出聚合酶链式反应-单链构象多态性,即E1、E3和E5,其他6个片段无多态性。E1片段表现为3种基因型AA、GG和AG型,GG型为优势基因型,G为优势等位基因;E3片段表现出4种基因型,即AA、AC、GA和GC,GA为优势基因型,A、G为优势等位基因;E5片段表现出3种基因型,即AA、AG和GG型,GG为优势基因型,G为优势等位基因。GHR基因E1、E3、E5片段均为中度多态;E1和E3片段处于Hardy-Weinberg非平衡状态,E5处于平衡状态。关键词：生长激素受体
