长江学者和创新团队发展计划(IRT0453)
- 作品数:217 被引量:2,424H指数:26
- 相关作者:荣廷昭潘光堂杨克诚李平郑有良更多>>
- 相关机构:四川农业大学教育部四川省农业科学院更多>>
- 发文基金:长江学者和创新团队发展计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 水稻全基因组编码抗病基因同源序列分析被引量:2
- 2010年
- 利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因组数据库(TIGR Rice Genome Annotation-Release5)中识别出565个编码抗病蛋白质的同源序列;利用识别出565个编码抗病蛋白质序列分别与籼稻基因组数据库进行BLASTP联配,共确定320个对应的等位基因。通过在线生物信息学软件,识别了这565个抗病基因的保守结构域、保守模体和DNA序列内转座子元件,其中有14个抗病基因同源序列注释错误。同时绘出了这些基因的基因组分布,并基于这些基因的同源树分析和基因组物理分布,认为基因的原位和远程复制事件产生了抗病基因的现存分布和多样性,其中转座子在复制过程中扮演了重要角色。这些对抗病机制研究和抗病基因进化研究以及抗病基因的转育具有重要意义。
- 任鄄胜肖培村陈勇吕启明王玉平赵慧霞李仕贵
- 关键词:抗病基因同源序列基因组
- 水稻籼粳交F_2、F_6群体遗传连锁图谱的比较分析被引量:10
- 2007年
- 以部分基因组和全基因组测序水稻籼稻(O sativa L.indica)品种"培矮64S"(Pei'ai64S♀)和粳稻(O sativa L.japonica)品种"日本晴"(Nipponbare♂)为构图亲本,选取F2代180个株系为作图群体,构建含138个微卫星位点的水稻遗传连锁图谱,覆盖基因组2046.2cM,平均图距17.1cM,即F2图谱;采用单粒传法获得F2:6代330个株系,用相同的多态性标记分析F6群体,构建含92个标记连锁图谱,覆盖基因组2563.5cM,平均图距27.86cM,即F6图谱;F2、F6图谱在连锁群数、定位标记数、标记的位置顺序、遗传图距、平均图距等方面发生了较大变化,并对产生这些差异的原因进行了初步分析。
- 梁永书彭勇叶少平李平孙林静马忠友李艳萍
- 关键词:水稻微卫星标记F2偏分离
- 利用SSR分子标记分析三峡库区玉米地方品种的遗传关系被引量:10
- 2007年
- 利用微卫星(SSR)标记技术和DNA混合取样方法,检测了来自三峡库区15个玉米地方品种的遗传多样性.42对SSR引物在15个玉米地方品种群体中共检测到248个多态性条带,每个位点的等位基因数为2~14个,平均5.9个;多态信息量0.28~0,81,平均为0.73;根据遗传相似系数矩阵做出的树状图,将15个玉米地方品种划分成3类,所有玉米地方品种间的遗传相似系数均在0.42以上.从15个玉米地方品种中选出5个,每个品种选取15个单株,共75个DNA单株样品,分析玉米地方品种群体的遗传结构.42对相同的SSR引物在5个玉米地方品种中检测到有效等位基因数Ae=3.40,平均期望杂合度He=0.67.遗传结构分析结果表明,玉米地方品种群体间及群体内的遗传结构均偏离了Hardy-Weinberg平衡;品种群体内和群体间的遗传变异分别占总变异的92%和8%.
- 姚启伦姚成强
- 关键词:玉米地方品种SSR标记三峡库区
- 一个新的水稻叶绿素缺失突变基因的遗传分析和分子标记定位被引量:19
- 2007年
- 从正常绿色水稻品种824B中发现1个黄化突变体824ys。该突变体具有叶绿素缺失突变特性,表现为植株黄绿色,分蘖数减少,生育期延长,总叶绿素、叶绿素a、叶绿素b的含量以及净光合速率比野生型亲本824B明显下降,每穗着粒数、结实率、千粒重等降低。对824ys与3个正常绿色品种杂交F1、F2的遗传分析表明,控制824ys的叶绿素缺失突变性状为1对隐性核基因。以495R/824ysF2作为定位群体,应用微卫星标记将824ys的叶绿素缺失突变基因定位于水稻第3染色体短臂,与RM218、RM282和RM6959等标记之间的遗传距离分别为25.6、5.2和21.8cM。认为该基因为一个新的水稻叶绿素缺失突变基因,暂命名为chl11(t)。
- 黄晓群王平荣赵海新邓晓建
- 关键词:水稻基因定位微卫星标记
- 川西北高原地区玉米育种现状及发展对策探讨被引量:2
- 2009年
- 玉米作为川西北高原地区主要粮食作物和重要饲料作物,其生产水平仍较低,供需矛盾十分突出。针对此情况,文章简述了川西北地区生态特点,概述了该地区玉米育种现状及存在的问题,在此基础上,结合高原玉米育种特点及目标,提出了相应的发展对策。
- 苟才明黄宁张吉海徐克诚吴全一杨荣志
- 关键词:高原玉米育种现状
- 应用RAPD标记和细胞质基因组PCR-RFLP技术研究大花蕙兰的遗传多样性被引量:20
- 2006年
- 利用RAPD、叶绿体和线粒体基因组PCRRFLP标记系统评价了大花蕙兰20个品种的遗传多样性。在50个RAPD引物分析中,有36个引物(72.0%)能揭示材料间的多态性,材料间遗传相似系数为0.503~0.765,平均0.598,根据遗传相似系数进行聚类分析表明,RAPD标记能将所有材料区分开。在7个叶绿体基因组(cpDNA)的PCRRFLP分析中,6个标记(87.5%)可扩增出1至多条清晰的谱带;扩增产物经7种限制性内切酶消化后,6个标记的19种引物/酶组合共检测到53条DNA片段,其中多态性片段有37条,占69.8%;材料间遗传相似系数变化范围为0.571~0.949,平均值为0.766。在8个线粒体基因组(mtDNA)的PCRRFLP标记分析中,只有3个(37.5%)标记能得到1条清晰的谱带;利用7种限制性内切酶对3个标记的扩增产物消化后,在10种标记/酶组合中,共检测到33条酶切片段,其中21条(63.6%)具有多态性;遗传相似系数为0.634~1.000,平均0.829。这些结果表明,RAPD标记揭示的大花蕙兰遗传多样性最高,其次为cpDNAPCRRFLP标记,而mtDNAPCRRFLP标记揭示的遗传多样性最低。
- 甘娜谭向红陈其兵魏育明郑有良
- 关键词:大花蕙兰RAPDPCR-RFLPCPDNAMTDNA
- 附子种质资源HPLC指纹图谱的初步研究被引量:5
- 2007年
- 为构建生附子药材的HPLC品质指纹图谱,建立附子种质资源品质评价高效准确的鉴定方法,以收集自四川、云南等地的14份附子种质资源和四川江油附子GAP基地的参照药材为材料,采用HPLC方法,在kromasil C18柱,水(6 mmol·L-1SDS、20mmol.L-1NaH2PO4)-甲醇,梯度洗脱,流速0.8 mL·min-1,检测波长240 nm等条件下建立生附子品质指纹图谱。结果表明各份供试样品色谱峰分离良好,符合指纹图谱有关规定,15份供试样品有9个共有峰,与参照药材比较相似度0.90以上的有7批。本研究所构建的指纹图谱可作为生附子药材鉴定和质量控制的参考依据,建立的HPLC方法可作为附子良种选育研究中对种质资源内在品质进行鉴定的有效方法。
- 田孟良易飞牛应泽刘帆黄玉碧
- 关键词:附子种质资源HPLC指纹图谱
- 秦岭黑麦75K γ-secalin亚基编码基因的克隆及序列分析
- 2008年
- 以中国春-帝国黑麦2R附加系(CS-2R)为对照,采用SDS-PAGE方法鉴定了秦岭黑麦75K γ-secalin亚基;对该亚基编码基因进行克隆测序和序列比较,结果表明:(1)秦岭黑麦75K γ-secalin(NCBI数据库登录号EU368041)具有75K γ-secalin亚基典型的氨基酸一级结构;(2)在DNA水平,秦岭黑麦同南非开普敦的栽培黑麦材料存在一个SNP位点,与欧洲的帝国黑麦存在8个SNP位点,与黑麦属其他3个种S.vavilovii、S.strictum、S.sylvestre分别存在2%、4%和6%的差异;(3)在氨基酸水平,秦岭黑麦与来自南非开普敦的栽培黑麦无差异,与欧洲的帝国黑麦差异极小,而与其他3个黑麦种的差异大,这为发掘75K γ-seca-lin基因提供了参考信息;(4)基于该基因构建的进化树能有效区分黑麦属内种间的亲缘关系,S.vavilovii种与栽培黑麦关系最近,S.sylvestre与栽培黑麦最远,而S.strictum则是介于中间的一个种,这与先前的细胞学、rDNA ITS及SSR等分析结果一致。
- 陈毅万陈其皎张连全刘登才
- 关键词:基因克隆SDS-PAGE
- 玉米未成熟胚胚性愈伤组织诱导率与内源激素含量的关系被引量:41
- 2006年
- 以胚性愈伤组织诱导率高低不同的9个玉米自交系未成熟胚为外植体,用改良N6培养基诱导培养愈伤组织。酶联免疫法测定不同培养时间后未成熟胚,以及由此诱导的胚性和非胚性愈伤组织,内源脱落酸(ABA)、吲哚乙酸(IAA)、赤霉素(GA3、GA4)和细胞分裂素(DHZRI、PA、ZR)含量。结果发现,胚性愈伤组织诱导率与未成熟胚ABA和IAA含量正相关,与胚性和非胚性愈伤组织ABA含量正相关,与胚性愈伤组织GA3含量负相关。在胚性愈伤组织开始发生之际,外植体的ABA和IAA含量出现峰值,GA3含量出现低谷。因此认为,未成熟胚高水平的ABAI、AA含量和低水平的GA3含量,有利于胚性愈伤组织的诱导。但是胚性愈伤组织的ABA含量却低于非胚性愈伤组织,且胚性愈伤组织诱导率与胚性愈伤组织IAA含量负相关。由此看来,胚性愈伤组织的诱导和保持,可能还与各种激素的协同作用有关。
- 付凤玲冯质雷渠柏艳李晚忱
- 关键词:玉米未成熟胚胚性愈伤组织诱导率内源激素
- 甘蓝型油菜白花性状的主基因+多基因遗传分析被引量:28
- 2009年
- 【目的】对甘蓝型油菜白花性状进行量化观察,研究其数量遗传特性,为育种利用提供理论依据。【方法】利用扫描仪和颜色提取软件对油菜新鲜花瓣进行处理,获得花瓣颜色特征值(CIERGB值),选择能反映花瓣颜色差异的B值,应用植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型多世代联合分析方法,对甘蓝型油菜杂交组合(HW243×HZ21-1和HW243×中油821)的P1、P2、F1、B1、B2和F2世代群体进行分析。【结果】甘蓝型油菜白花性状表现为一数量性状,其遗传符合两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因遗传模型,以主基因作用为主,多基因的作用相对较小。两对主基因的加性、显性和上位性效应均具有较大的作用。在F2群体中主基因的遗传率为96.94%和95.83%,多基因遗传率为3.93%和2.47%;在B1群体中主基因的遗传率为54.58%和49.57%,多基因遗传率分别为35.64%和46.9%;在B2群体中主基因的遗传率为98.14%和97.67%,多基因遗传率分别为0.98%和2.06%。【结论】甘蓝型油菜白花性状具有数量性状的遗传特性,其遗传符合两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因遗传模型,以主基因效应为主,多基因效应相对较小。主基因的遗传力较高,受环境影响较小。
- 田露申牛应泽余青青郭世星柳丽
- 关键词:甘蓝型油菜白花主基因+多基因