江西省重点科技攻关项目(20061B0260301)
- 作品数：10 被引量：19H指数：3
- 相关作者：胡成钰马梅生王丽坤吴初新王娜更多>>
- 相关机构：南昌大学江西师范大学萍乡高等专科学校更多>>
- 发文基金：江西省重点科技攻关项目江西省研究生创新基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 草鱼Annexin A4基因克隆、表达特性及进化被引量：1
- 2009年
- 草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Annexin A4基因克隆于肝肾cDNA文库,该cDNA全长为1307bp,其中,5′非编码区为104bp,3′非编码区为237bp,开放阅读框为966bp,编码321个氨基酸。草鱼Annexin A4编码的蛋白质N端由15个氨基酸残基组成,C端具有4个重复序列,每个重复序列都有一个Ⅱ型钙结合位点,在第4个钙结合位点中包含一个"KGD"序列。Annexin A4在草鱼肝、肾、脾、心、鳃、肠中的表达量均较高,而肌肉和脑中不表达;PolyⅠ:C诱导后,其表达均有所下调。系统发育树显示,草鱼Annexin A4与斑马鱼(Danio rerio)的进化距离最近。适应性进化分析没有检测到正选择位点,表明Annexin A4非常保守,受到强烈的功能约束。
- 吴初新马梅生王丽坤胡成钰
- 关键词：适应性进化POLY草鱼
- 草鱼Wap65基因的克隆和鉴定被引量：1
- 2011年
- 经Poly I∶C诱导的草鱼肝肾cDNA文库中筛选并克隆了一个Wap65(HM629798)。草鱼Wap65全长cDNA为1510 bp,包括5’非编码区55 bp,3’非翻译区327 bp,最大开放阅读框为1128bp。草鱼Wap65是一个376 aa的蛋白质,其中,第56～95 aa、102～153 aa、155～199 aa、200～243 aa、262～305 aa和307～352 aa为重复血红素结合域。进化树显示,草鱼Wap65与斑点叉尾鱼回Wap65-2进化关系最近。定量PCR研究草鱼Wap65的表达特征,Wap65在肝中有较强的本底表达,而在脾、肾、脑和肠等组织中该基因表达非常微弱。34℃热激2 h后,在脾脏中,Wap65的表达量有一定的上调;在肝脏中的该基因的相对表达量大量增加,而在其他受检组织中Wap65的表达无明显变化。因此,草鱼Wap65主要在肝脏中表达。以上结果表明,本研究克隆的草鱼Wap65可能是Wap65-2。
- 赵风云吴初新朱玉娇胡成钰
- 关键词：应激蛋白草鱼
- 热休克、Poly I:C上调草鱼GRP78基因表达被引量：4
- 2009年
- 葡萄糖调节蛋白78(GRP78)是细胞内一种应急蛋白,它通过对细胞内、外胁迫因子产生强烈的应答而调节内质网稳态.草鱼(Ctenopharyngodon idellus)GRP78克隆于草鱼肝肾cDNA文库,全长2490bp.其中,5'非编码区为155bp,含有7个热休克元件,3'非编码区为373bp,最大开放阅读框为1962bp,编码653个氨基酸.序列分析表明,草鱼GRP78的N端包含3个HSP70家族的签名序列,C末端为内质网蛋白滞留信号KDEL,草鱼GRP78与人及其它动物的同源性很高.适应性进化分析也显示GRP78非常保守,受到强烈的功能约束,说明该蛋白质在进化中非常重要.RT-PCR分析表明,相对于本底水平,34℃热激和Poly I:C诱导后,草鱼GRP78在肝、肾等组织中的表达明显上调.
- 吴初新刘毅马梅生王丽坤胡成钰
- 关键词：热休克POLYGRP78草鱼胁迫
- 草鱼转铁蛋白基因的克隆及其组织表达被引量：8
- 2010年
- 转铁蛋白(Transferrin,Tf)功能广泛,不仅参与机体内铁离子的运输和代谢,还在细胞呼吸、细胞生长和增殖中起重要作用,而且它具有抗菌杀菌的功能。研究从草鱼肝肾全长cDNA文库中克隆得到草鱼转铁蛋白基因(CtTf),该基因全长cDNA5′非编码区包含31bp,最大开放阅读框为2025bp,编码674个氨基酸,3′非编码区为266bp。研究使用了Signal P、SMART等在线软件对草鱼转铁蛋白全长cDNA的分子特征进行预测,结果显示CtTf编码的蛋白质N-端有1个由15个氨基酸残基组成的信号肽,第24—334个和第338—665个氨基酸为2个保守的结构域,二者同源率为31%。与其他物种的转铁蛋白类似,草鱼转铁蛋白每个结构域包含4个铁离子结合位点,它们在两个结构域中的位置相对保守,除了这8个铁离子结合位点外,还存在多个完全保守的氨基酸位点。草鱼转铁蛋白与人及其他物种有很高的同源性,与其他鲤科鱼类的同源性为65%—73%;与海洋鱼类同源性为43%—50%;与两栖、爬行、鸟类、哺乳类的同源性为40%—42%。系统进化树也显示草鱼转铁蛋白基因与斑马鱼和鲤鱼的亲缘关系最近。RT-PCR的实验结果表明,在草鱼肝、肠、肾、脾、心、肌肉、鳃和脑8种组织中,草鱼转铁蛋白基因在肝中的表达量最高,其次为脾和肠,在鳃和脑中有痕量表达。
- 王娜陈琼胡成钰
- 关键词：草鱼转铁蛋白
- 草鱼eIF-5A的克隆、组织表达和进化分析被引量：1
- 2009年
- 【目的】克隆和鉴定草鱼(Ctenopharyngodonidella)的eIF-5A基因,并分析其组织表达和适应性进化。【方法】在克隆草鱼eIF-5A全长cDNA的基础上,利用ORF finder、SMART等在线软件对草鱼eIF-5A的分子特征进行分析,并利用PAML 3.15软件包中的密码子替换模型检测eIF-5A的分子适应性进化;RT-PCR分析eIF-5A在草鱼心、脑、肌肉、鳃、脾、肝、肠、肾等组织中的本底表达和Poly I:C诱导表达。【结果】草鱼eIF-5A全长cDNA为2 249 bp,其中包含5′非编码区41 bp,3′非编码区1 743 bp;最大开放阅读框为465 bp,编码1个由155个氨基酸残基组成的蛋白质;草鱼eIF-5A分子质量为16.856 ku,等电点pI为5.18,N端含有eIF-5A家族共有的羧腐胺赖氨酸,C端包含一段富含亮氨酸的结构域。草鱼eIF-5A与人及其他动物具有较高的同源性,只有少数氨基酸残基发生替换;适应性进化分析也表明,eIF-5A不但具有结构的保守性,还具有功能的保守性;eIF-5A在草鱼心、脑、肌肉、鳃、脾、肝、肠、肾等组织中恒量表达,并且其表达不因Poly I:C的诱导而发生变化。【结论】eIF-5A是一类与细胞分裂和分化密切相关的蛋白质,在生物体中具有多种剪切体,提示eIF-5A对维持细胞生存非常重要;鉴定的草鱼eIF-5A为eIF-5A1,而非eIF-5A2。
- 王军花陈琼马梅生王丽坤胡成钰
- 关键词：基因克隆基因表达草鱼
- 草鱼CNBP的分子特征及其进化分析被引量：1
- 2008年
- 从草鱼(Ctenopharyngodon idella)肝肾cDNA文库中克隆到细胞核酸结合蛋白基因CNBP的完整开放阅读框序列。分析表明草鱼CNBP由163个氨基酸残基组成,含有7个保守CCHC型锌指结构、核定位信号区和RGG框,与其他鱼类的同源性很高。与人及其他脊椎动物的相比,草鱼细胞核酸结合蛋白在第3个锌指中的第5个氨基酸残基由Gly变成His,另外在第1锌指和第2锌指结构间,缺失6～14个氨基酸残基。虽然如此,适应性进化分析显示细胞核酸结合蛋白没有经历正达尔文选择(ω≤1),即这种结构的差异还不足以产生新的功能。这表明CNBP处于中性进化中。
- 陈琼林刚王娜胡成钰
- 关键词：进化草鱼
- 草鱼CCL4基因的克隆及表达被引量：3
- 2009年
- 草鱼CCL4基因全长854 bp,最大开放阅读框位于104~397 bp,编码97个氨基酸,其中32~73氨基酸为其保守的CC趋化因子家族结构域,N-端有1个由24个氨基酸组成的信号肽。草鱼CCL4与斑马鱼的同源性为69%,与其他鱼类和哺乳类的同源性在50%以下。系统进化分析也显示其与斑马鱼CCL4基因的亲缘关系最近。CCL4基因在草鱼各组织中都有表达,以脾脏表达量最高,心、肌、鳃、肝中次之,肠和肾中有少量表达,在脑中有痕量表达。经Poly I：C感染后,在肝脏、脾、肠、肾、鳃中,CCL4的表达水平有不同程度的增加,而在心、肌、脑中无明显变化。
- 王丽坤王娜马梅生胡成钰
- 关键词：草鱼CCL4
- 草鱼胶原凝集素基因的克隆及其功能分析被引量：1
- 2010年
- 从草鱼Ctenopharyngodon idella肝肾cDNA文库中克隆得到胶原凝集素基因。草鱼胶原凝集素全长cDNA为1128bp,其中5′非编码区229bp,3′非翻译区104bp,最大开放阅读框为795bp,编码264个氨基酸。系统进化分析表明草鱼胶原凝集素与斑马鱼的亲缘关系最近。根据草鱼胶原凝集素序列特征,克隆了包含糖基识别域(CRD)的cDNA,并进行原核表达、纯化获得其重组蛋白PCRD。进行PCRD与6种细菌的凝集和糖抑制实验,结果表明半乳糖、葡萄糖、甘露糖和麦芽糖4种糖都会使PCRD与嗜水气单胞菌的凝集明显下降甚至极大地干扰凝集;麦芽糖使金黄色葡萄球菌的凝集明显下降,而肽聚糖和甘露糖会使凝集受到抑制;此外,PCRD的凝集反应不依赖Ca2+。
- 李琴马梅生胡成钰
- 关键词：草鱼
- 草鱼GRP78基因分子特征、表达特性及其适应性进化分析
- GRP78(78kDa glucose-regulated protein,葡萄糖调节蛋白78)是Hsp70(Heat Shock Protein 70,热休克蛋白70)家族重要的一员,具有分子伴侣等广泛的生物学功能,在...
- 吴初新杨攀陈琼王娜胡成钰
- 关键词：草鱼GRP78适应性进化
- 文献传递
- 草鱼cyclin G1基因的克隆、鉴定及适应性进化分析
- 2011年
- 本研究从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝肾cDNA文库中克隆到草鱼cyclin G1基因。测序结果表明,草鱼cyclin G1全长cDNA为2118bp,使用ORF finder推译其开放阅读框为第256bp～第1155bp,编码299个aa,SMART在线软件预测其中N端第57个aa～第143个aa为细胞周期蛋白盒。同源性比对分析显示cyclin G1在鱼类中同源性极高,其中草鱼cyclin G1与斑马鱼的同源性为90%。通过PAML软件的密码子替换模型进行适应性进化分析,结果表明cyclin G1编码蛋白的26A、171A和225K氨基酸位点受到正选择作用。本研究为进一步了解草鱼cyclin G1结构功能与分子演化打下基础。
- 王海舟胡成钰
- 关键词：草鱼CYCLING1进化
