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青岛大学医学部微生物学教研室
作品数:
1
被引量:1
H指数:1
发文基金:
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相关领域:
生物学
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青岛市市立医...
作者
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毕春霞
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辛晓妮
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微生物学杂志
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1篇
2017
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寡氧单胞菌中CRISPR位点的分析
被引量:1
2017年
对寡氧单胞菌基因组中的CRISPR位点进行生物信息学分析。CRISPRdb数据库中公布的和NCBI上下载的共26株寡氧单胞菌的基因组序列,分析其CRISPR位点的分布情况、重复序列、间隔序列以及间隔序列和噬菌体序列数量之间的关系。共发现15个确定的CRISPR结构和132个可疑的CRISPR,不同菌株CRISPR结构中的重复序列具有较强的保守性。间隔序列的靶向基因主要来自细菌的基因组,说明寡氧单胞菌CRISPR的的进化与其他细菌基因有关。此外,间隔序列与前噬菌体数量之间的负相关关系,说明CRISPR能阻止噬菌体的入侵。寡氧单胞菌CRISPR位点的分析为进一步研究耐药性及基因组稳定性奠定了基础。
刘兴雨
毕春霞
辛晓妮
付恒霞
周明艳
王斌
闫志勇
关键词:
CRISPR
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