湖南农业大学生物科学技术学院道地药用植物规范化栽培与综合利用湖南省工程实验室
- 作品数：8 被引量：10H指数：2
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- 相关领域：医药卫生农业科学化学工程生物学更多>>
- 基于比较转录组学的盐肤木响应五倍子蚜胁迫的机理探究
- 2024年
- 五倍子(Galla chinensis)是五倍子蚜寄生在盐肤木上形成的虫瘿,是中国常用的中药材之一。目前,关于五倍子形成过程中盐肤木对五倍子蚜的胁迫响应机制鲜有研究。本研究以成瘿及未成瘿的盐肤木叶片为材料,通过新一代转录组测序技术研究五倍子形成过程中盐肤木对五倍子蚜的胁迫响应机理。测序共获得成瘿组和未成瘿组间差异表达基因26 117个,其中上调基因21 581个,下调基因4 536个。通过GO和KEGG功能注释发现,差异基因主要富集在物质合成及代谢、遗传物质变化、植物激素及光合作用等途径。本研究共筛选到植物激素合成及信号传导途径差异表达基因292个。其中,乙烯(ET)合成及信号传导途径基因差异最显著,与胁迫响应密切相关,筛选到ET信号转导途径关键基因CTR1、MPK6在两种材料中表达量出现显著差异。此外,对筛选到的差异表达基因进行转录因子注释,共得到差异表达转录因子381个,其中83个与植物响应胁迫密切相关的转录因子家族基因表达量出现明显差异,包括MYB、bHLH、AP2-EREBP、NAC、WRKY、b ZIP。本研究通过二代高通量转录组测序技术研究五倍子蚜侵染下盐肤木胁迫响应相关基因的表达特征,为今后研究盐肤木响应五倍子蚜的胁迫机制及五倍子形成的分子机理奠定了基础。
- 陈彦超汪启明饶力群彭国平王旭军李瑞莲屠小菊
- 关键词：盐肤木转录组学
- 基于网络药理学探索金银花抗菌有效成分及其分子机制被引量：5
- 2022年
- 本文旨在基于网络药理学方法分析金银花抗菌有效成分,预测其分子作用机制。从中药系统药理学数据库与分析平台TCSMP数据库以及文献中收集金银花有效成分及其作用的靶点,通过Uniprot蛋白数据转化为相对应的靶点基因。将有效成分和靶点基因导入Cytoscape3.7.2软件,构建金银花有效成分-靶点网络调控图。通过GeneCards数据库检索并筛选抗菌靶点,与金银花有效成分-靶点取交集得到金银花抗菌核心靶点。将金银花核心靶点基因上传至STRING数据库,构建抗菌靶点蛋白相互作用网络图。最后,通过DAVID数据库将金银花关键靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果显示,在金银花中共获得23种与抗菌活性有关的潜在化合物,获得了137个抗菌靶点。GO富集分析获得条目17个,其中生物过程10个、分子功能1个、细胞组成6个;它们参与了22条相关信号通路。预测槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇和β-胡萝卜素等化合物是金银花抗菌的主要成分。这些化合物作用于MYC原癌基因蛋白(MYC proto-oncogene protein,MYC)、管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)等关键靶点,并参与调控TNF信号通路、MAPK信号通路、ErbB信号通路、HIF-1信号通路和Toll样受体信号通路等发挥其抗菌作用。结果表明,金银花具有多成分、多靶点、多通路的抗菌分子机制,为深入阐释金银花及其抗菌分子机制提供理论参考。
- 徐楠杜丽桦刘一涵陈彦超汪启明饶力群
- 关键词：网络药理学金银花抗菌分子机制
- ITS2序列作为青风藤DNA条形码的研究
- 2016年
- 采用DNA试剂盒法提取采自不同地区的青风藤及其类似植物的基因组DNA,设计通用ITS2引物进行PCR扩增和测序,运用生物信息学软件对序列进行分析,从而对青风藤及其类似植物进行分子鉴定。结果表明：产地为陕西、贵州、湖北的青风藤样品序列长度分别为380~437、429~436、434~438 bp,GC含量在54.2%~55.7%,平均GC含量约为55%。青风藤及其类似植物的ITS2序列存在较大差异,且平均K2P遗传距离明显大于青风藤的种内平均K2P遗传距离。这说明内转录间隔区2（ITS2）作为DNA条形码可准确地鉴别青风藤与其他类似植物,为中药材的鉴别提供了新途径。
- 周池饶力群杨华
- 关键词：青风藤DNA条形码中药材
- 不同金银花品种叶的形态与显微构造特征
- 通过显微鉴别方法对金银花、灰毡毛忍冬、湘蕾山银花的相同发育时期叶片形态、大小、栅栏组织细胞层数及其与叶片的厚度比、海绵组织细胞形态、腺毛与非腺毛的形态构造、草酸钙簇晶的大小与分布等显微构造特征进行观察，结果表明三种金银花...
- 龙鹏陈咸吉饶力群汪启明彭国平
- 关键词：金银花灰毡毛忍冬显微构造
- 茯苓多糖的提取工艺优化被引量：4
- 2016年
- 为了改进茯苓多糖的提取工艺,以茯苓粉为原料,通过对Na OH浓度、反应温度、反应时间、料液比4个因素进行正交试验,探讨了茯苓多糖提取的优化条件。结果表明:茯苓多糖提取的最优制备工艺为:反应时间8 h,碱浓度0.7 mol/L,料液比1∶30,反应温度5℃。
- 刘欣熊芳琪余倩莎张城唐娟彭国平
- 关键词：茯苓茯苓多糖
- 陆地棉GhCRE1基因的生物信息学分析
- 2021年
- 细胞分裂素在植物的生长发育中起着非常重要的作用,CRE1已被鉴定为细胞分裂素受体,然而CRE1在棉花中的生物学功能尚不清楚。本文通过克隆GhCRE1基因,并对其序列进行生物信息学分析,发现GhCRE1基因有11个外显子和10个内含子;与可可和拟南芥两种植物同源基因相比,其分子量、pI和氨基酸数均不同,具有3个不同的蛋白结构域。通过多种生物信息学网站预测发现了15个与CRE1蛋白存在潜在相互作用的未鉴定蛋白和CRE1蛋白序列上的2个磷酸化位点。此外在CRE1启动子序列上发现了8个与光信号和激素相关的顺式作用元件。这些结果将有助于揭示该基因在陆地棉中的功能。
- ORNELLA MUSANIWABO Josee徐敏慧周池陈彦超饶力群汪启明
- 关键词：生物信息学分析基因蛋白启动子
- 不同组分羧甲基茯苓多糖对HepG2细胞增殖的影响被引量：1
- 2019年
- 目的:探究不同组分羧甲基茯苓多糖(CMP)对HepG2细胞增殖的影响。方法:在不同提取碱浓度和碱处理时间下,采用二次加碱法制备不同组分CMP。利用硫酸-蒽酮法、滴定法和CCK-8法对CMP的含量、取代度和HepG2细胞增殖检测。结果:获得7个组分CMP,含量为85%~90%,取代度为0.65~0.80。不同浓度CMP培养HepG2细胞24 h下,CMP 750μg/mL抑制细胞增殖效果最好,其中CMP3抑制率最高达50.035%。CMP 750μg/mL培养HepG2细胞24、48、72 h,在48 h下抑制效果最好,其中CMP3抑制效果最高达到76.05%。在72、48、24 h下CMP3培养HepG2细胞的IC50分别为26.34、34.06、763.64μg/mL。结论:CMP能有效抑制HepG2肿瘤细胞的增殖,其中CMP3是7个CMP组分中抑制效果最好的,这与CMP3的含量、浓度呈正相关性,48 h为CMP最适抑制时间。
- 杨焕治熊芳琪杨岚杨中扬陈咸吉聂现辉彭国平
- 关键词：不同组分羧甲基茯苓多糖HEPG2细胞增殖
- 粳稻糖基转移酶Ⅰ基因家族全基因组鉴定及功能分析
- 2022年
- 糖基转移酶Ⅰ(GTⅠ)家族是糖基转移酶中的一类,其主要功能涉及黄酮类化合物糖基的转移、淀粉和蔗糖的合成等。为揭示GTⅠ基因家族在粳稻生长发育以及抗逆中的作用,为粳稻GTⅠ基因家族成员的功能研究提供基础,为水稻的品种改良和提高水稻耐高温提供思路,采用生物信息学方法鉴定出30个GTⅠ基因家族成员,并分析了粳稻GTⅠ基因家族成员的基因结构、蛋白质理化性质、染色体定位及基因进化、系统发育关系、保守结构域和蛋白质三维结构建模等。结果显示,粳稻的30个GTⅠ基因家族成员在水稻12条染色体上均有分布,其基因结构、保守基序和遗传进化相对保守,家族成员启动子均预测到脱落酸响应元件,家族蛋白质的三维结构保守含有6个β-折叠和7个α-螺旋。通过转录组数据与实时荧光定量分析,GTⅠ基因家族大部分成员对高温胁迫的响应出现在高温处理后第6小时,其中OS-GT29表达量呈持续高表达。GTⅠ基因家族在拟南芥和粳稻功能存在相似。
- 周镇中罗彪骆鹰夏敏汪启明饶力群
- 关键词：粳稻基因家族生物信息学
