广西医科大学生命科学研究院广西生物医药协同创新中心
- 作品数：6 被引量：37H指数：3
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 新型冠状病毒Omicron变异株在中国内地的流行特征及传播规律
- 2023年
- 目的分析中国内地不同省市新型冠状病毒(SARS-CoV-2)Omicron变异株的流行趋势、传播网络及进化关系。方法从全球疫情服务抗役互助平台、国家及不同省份卫生健康委员会官网收集2021年12月9日-2022年1月15日公布的Omicron病例流调数据,通过文本挖掘等手段获取传播关系等信息,并绘制疫情病例数热图;利用cytoscape软件绘制传播网络图;从GISAID和NCBI下载病毒序列绘制系统进化树。结果2021年12月9日-2022年1月15日,中国内地12个省市确诊34例Omicron病例,初始Omicron病例主要集中在广东(16例,占47.06%)、上海(5例,占14.71%)、天津(4例,占11.76%)。绘制2021年12月9日-2022年1月15日中国内地31个省市累计及新增新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例数热图,发现除了陕西省以外,COVID-19疫情分布与Omicron变异株疫情分布基本一致(陕西省在2021年12月24日病例快速增加,与Omicron变异株疫情分布不一致,可能是该地区德尔塔变异株占主导)。Omicron变异株聚集性传播明显,且存在跨省市传播现象。该变异株在中国地区存在多个小的聚类,聚集关系相对分散。广东1例与澳大利亚(Omicron-australia-01、Omicron-australia-02、Omicron-australia-03、Omicron-australia-04)聚类;浙江3例与加拿大(Omicron-canada-01)聚类;天津1例与波兰(Omicron-poland-02)聚类;浙江2例与加拿大(Omicron-canada-02)聚类。结论中国内地Omicron变异株与多个国家基因距离近,系统进化关系复杂,不同省市之间存在明显传播关系,全国COVID-19新增病例趋势和Omicron分布趋势基本一致,疫情传播凶险,应加强境外输入管控力度,并加强本土聚集性传播和跨省市传播管控力度,打好疫情防疫攻坚战。
- 陈丽香王刚韦吴迪蒋俊俊包秀丽梁浩叶力
- 关键词：新型冠状病毒系统进化
- 基于百度指数的新型冠状病毒肺炎疫情与网络舆情监测分析被引量：5
- 2021年
- 目的研究新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease-19,COVID-19)疫情及网络舆情的变化趋势及相关性,探索网络大数据在疾病监测中的应用,为做好疾病舆情监测及管控工作提供科学依据。方法利用各级卫生健康委员会官网和百度指数平台,回顾性搜集2020年1月10日—2月20日COVID-19疫情数据和百度指数,并采用描述性统计和Spearman相关分析方法进行数据分析。结果截止2020年2月20日,全国、湖北省、其他省市COVID-19发病率分别为5.41/10万、105.90/10万、0.96/10万,病死率分别为2.96%、3.42%、0.72%。网民搜索指数中位数分别为1 065 318.0、37 449.5、1 027 478.0,资讯指数中位数分别为5 754.5、749.5、5 005.0。相关分析表明网民搜索和资讯关注均与病例报告数呈高度相关(R2>0.8,P<0.01)。趋势分析显示,早期网民搜索与媒体报道同步上升,资讯流出现较迟,当媒体报道回归低缓水平时,网民搜索量及资讯关注度仍处于较高水平。结论湖北省是我国COVID-19疫情重灾区,网民搜索和资讯关注均与病例报告数存在相关关系,而媒体报道与公众需求存在一定差距,有关部门应充分利用网络大数据,建立网络舆情监测系统,掌握公众舆情动态,及时发布权威信息,引导正面舆论。
- 韦秋宇刘洁张君涵潘沛江陈荣凤褚洁梅蒋俊俊梁冰玉梁浩叶力
- 关键词：新型冠状病毒
- 扶芳藤提取物抗HIV-1活性初步实验研究被引量：5
- 2019年
- 目的观察扶芳藤15%乙醇提取部位的抗HIV-1作用,为寻找新的有效治疗艾滋病药物提供依据方法以TZM-bl-HIV-1ⅢB系统和MT2-HIV-1ⅢB系统为实验模型,使用荧光素酶活性检测试剂检测病毒复制水平,ATP法检测不同浓度扶芳藤提取物作用下细胞的相对活力;通过酶标仪检测化学发光信号,计算相对病毒水平和相对细胞活力结果扶芳藤提取物在TZM-bl-HIV-1ⅢB系统和MT2-HIV-1ⅢB系统中,可在较大浓度范围对病毒感染产生抑制作用,而不对细胞造成较大毒性,因此该提取物为扶芳藤抗HIV-1中药有效部位结论扶芳藤15%乙醇提取部位,抗HIV-1效果明显,为今后深入研究其药用价值和临床意义提供了更为有力的理论基础.
- 刘欣温奇龙蔡丹昭梁冰玉蒋俊俊刘洁叶力梁浩
- 关键词：艾滋病扶芳藤细胞活力抗HIV-1活性
- 广西不同地区新型冠状病毒肺炎的流行特征被引量：22
- 2020年
- 目的通过对广西壮族自治区2020年1月23日至2月16日期间的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行情况进行统计,了解COVID-19疫情在广西不同地区的流行特征,为疫情防控提供参考依据。方法从广西壮族自治区卫生健康委员会官方网站获取全广西的COVID-19疫情数据,分析广西各城市疾病流行的特征并利用ArcGIS 10.6软件绘制广西不同时间点确诊病例时空分布地图。结果截至2020年2月16日,广西COVID-19的累计发病数为238例,累计发病率为0.48/10万,重症病例4例,危重病例7例,死亡2例。广西的确诊病例主要集中在南宁(51例,占21.43%)、北海(43例,占18.07%)和桂林(31例,占13.03%);北海(2.56/10万)和防城港(1.89/10万)的累计发病率明显高于其他城市,差异有统计学意义(P<0.05)。各城市每日新增病例数逐渐减少,整体上呈现下降趋势;其中来宾在2月4日前无确诊病例,之后5 d内病例显著上升(11例),2月9日后无新增病例。结论广西COVID-19疫情进展平缓,且得到一定程度的控制,每日新增病例数总体呈下降趋势。然而一些地区仍有聚集性暴发现象,应加强对疫情的监测。
- 王刚李玥琪蒋俊俊宁传艺陈荣凤赖菁贞叶力梁浩
- 广西一株HIV-1 CRF01_AE/CRF07_BC独特重组毒株的鉴定被引量：2
- 2021年
- 目的对一条不能明确亚型的HIV-1近似全长基因组序列进行分析,确定毒株的重组特征及可能来源。方法利用近末端稀释法分两段进行HIV-1近似全长基因组的扩增,获取序列后使用SimPlot软件分析近似全长基因组序列的重组模式及断点,采用分片段构建ML进化树的方法确认重组断点准确性,绘制重组病毒的基因镶嵌模式图。对各基因片段与相应亚型的全部近似全长基因组序列构建ML进化树,推测其亲本毒株可能来源。结果扩增及测序后,获得一条长度为8943 bp(HXB2:649~9599)的HIV-1近似全长基因组序列。断点分析表明,该序列的重组模式是以CRF01AE为骨架插入CRF07BC片段,其中片段Ⅰ、Ⅲ和Ⅴ来自CRF01AE毒株,片段Ⅱ和Ⅳ来自CRF07BC毒株,4个重组断点相对应于HXB2的位置分别为3957、4224、5560和5899。亲本毒株来源分析表明,与片段Ⅰ、Ⅲ和Ⅴ成簇的CRF01AE序列主要来自东南亚国家如泰国、老挝、越南。片段Ⅱ和Ⅳ则与我国西南地区吸毒人群中的CRF07BC序列聚集。结论获得一株由CRF01AE和CRF07BC重组形成的HIV-1独特重组毒株,其亲本病毒中的CRF01AE可能与东南亚国家的毒株同源,而CRF07BC可能来自我国西南地区的吸毒人群。
- 张菲梁华悦钟姗妹覃彩杨垚梁娜蒋家晓梁冰玉梁浩
- 关键词：系统进化亲本来源
- 2018年广西崇左边境ART人群HIV-1分子网络特征分析被引量：3
- 2021年
- 目的构建广西边境崇左市四个边境县接受ART的HIV/AIDS患者的本底分子网络并识别重点人群,为当地防控艾滋病进行重点干预提供依据。方法纳入2018年1-9月在广西崇左市大新县、宁明县、凭祥市、龙州县四个地区进行常规CD4细胞检测的在治HIV/AIDS患者作为研究对象,并收集研究对象基本信息,使用HIV-TRACE对研究对象pol区基因序列进行分子网络分析。结果共获得371例患者的HIV pol区序列,CRF01AE亚型是主要的传播亚型,占85.2%,其次是CRF08BC(6.7%)和CRF07BC(5.4%),CRF5501B、CRF5901B、B、A1和URF亚型散在分布。在371条pol序列中,有191条入网,形成31个包含2~53个序列以上的分子簇,入网率51.5%。农民、男性、壮族、小学文化、有商业性行为史,来自大新县、年龄大于60岁,CD4细胞计数大于500个/μL在入网人群中占比较高。病例来自大新县、龙州县及年龄>60岁的个体节点间的连接度较高。还发现一个CRF08BC亚型高度耐药簇,耐药突变位点以K103 N为主,主要对EFV和NVP产生耐药。结论崇左地区接受ART的HIV/AIDS患者基因亚型复杂,农村中老年和低文化程度人群传播风险较高,存在高度耐药毒株流行,需重视对该地区的耐药基因序列常规监测并加强对重点人群的性健康教育。
- 杨垚梁华悦钟姗妹于德蛾覃彩杨媛张菲梁冰玉梁浩
- 关键词：艾滋病病毒
