宋文涛
- 作品数：9 被引量：63H指数：5
- 供职机构：辽宁师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：辽宁省海洋与渔业厅科研计划项目国家自然科学基金辽宁省科学技术计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 文蛤外套膜和肝胰脏组织cDNA文库的构建及其线粒体全基因组序列的扩增
- 文蛤/(Meretrix meretrix/)属软体动物门/(Mollusca/)、双壳纲/(Lamellibranchia/)、异齿亚纲/(Heterodonta/)、帘蛤目/(Veneroida/)、帘蛤科/(Ven...
- 宋文涛
- 关键词：文蛤表达序列标签线粒体基因组
- 文献传递
- 文蛤肠、外套膜和肝胰脏组织cDNA文库构建及其ESTs序列分析被引量：7
- 2010年
- 利用SMART cDNA文库构建试剂盒构建了文蛤(Meretrix meretrix)肠、外套膜和肝胰脏组织的cDNA文库。经测定原始文库滴度分别为2.10×106、1.70×106和1.60×106,重组率高于95%,肠组织文库插入片段长度均大于1000bp,外套膜和肝胰脏组织文库的插入片段长度大于1kb的占87.5%,文库质量符合标准要求。随机选取文库的3168个克隆进行5′端测序,获得高质量表达序列标签(Expressed Sequence Tags,ESTs)3029个(肠:1005,外套膜:1019,肝胰脏:1005),测序成功率95.58%。经质量控制和拼接得到1796个单基因簇(Unigene),其中306个叠联群(Contigs),1490个单一序列(Singletons)。通过Blastx搜索比对、查询和注释分析,共得到已知基因696个(肠:216,外套膜:235个;肝胰脏:245个),占总数38.75%。在1796个单基因簇(Unigene)发现微卫星序列55条,这些存在微卫星位点的序列占整个ESTs数据库的3.1%。
- 高祥刚李云峰宋文涛王健傅立元刘卫东鲍相渤赫崇波
- 关键词：文蛤CDNA文库表达序列标签
- 虾夷扇贝遗传连锁图谱的初步构建被引量：23
- 2009年
- 用AFLP标记首次构建了虾夷扇贝遗传连锁图谱。用56对引物组合对父母本和52个F1代个体进行遗传连锁分析,共得到1855个标记,其中多态位点为598(32.2%)个,而354个符合孟德尔1:1分离比。用这些标记和23个偏分离标记(0.01
- 刘卫东鲍相渤宋文涛周遵春赫崇波虞星炬
- 关键词：虾夷扇贝遗传连锁图谱AFLP标记
- 鱼类基因内含子研究进展被引量：4
- 2009年
- 内含子是指断裂基因中的非编码区序列,在编码蛋白质前被去除。在高等生物中,内含子的长度远大于外显子,大部分随机突变会发生在内含子中。因此,内含子的存在使高等生物对突变的耐受能力大大增强了。研究表明,内含子可以提高基因表达效率;影响RNA的转录、剪接加工、出核孔以及翻译等过程;启动某些基因的表达;并通过选择性剪接调控基因的表达。内含子功能的研究成果给当前鱼类免疫基因研究开拓了全新的视野。对内含子的分类、剪接、功能以及鱼类内含子研究的新进展进行了综述,并展望了内含子在鱼类免疫基因研究中的应用。
- 宋文涛赫崇波高祥刚刘星耿惠君
- 关键词：内含子剪接基因表达多态性先天性免疫趋化因子
- 双壳贝类线粒体基因组结构的比较被引量：15
- 2009年
- 利用比较基因组学和生物信息学方法,比较分析了已登录到GenBank中的14种海产双壳贝类和2种淡水双壳贝类的线粒体基因组的结构特征。结果发现,双壳贝类线粒体的基因组结构、基因排列顺序均互不相同;不同目、科和属之间线粒体基因组的大小、基因排列方式以及基因种类也存在明显的差异,尤其是基因排列方式没有明显的规律。对16种双壳贝类的线粒体基因组全序列、编码基因序列进行系统分析,分别得到了不同的聚类结果,即用基因组全序列聚类时,16种贝类的聚类结果与传统的形态学分类地位基本相同;而将16种贝类的所有蛋白质编码基因和2个rRNA基因按照一致顺序排列起来进行聚类时,所得的系统分类情况与这些贝类传统的形态学分类地位相差较大。
- 宋文涛高祥刚李云峰刘卫东刘莹赫崇波
- 关键词：双壳贝类线粒体全基因组基因组结构多态性
- 双壳类线粒体全基因组的比较研究
- 宋文涛赫崇波高祥刚
- 关键词：双壳类线粒体全基因组基因组结构控制区串联重复序列
- 斑点叉尾中国养殖群体遗传多样性的AFLP分析被引量：7
- 2008年
- 采用AFLP分子遗传标记技术,对来自福建和湖北的1984年引进的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)养殖群体(P1984)、来自福建和辽宁的1997年引进的养殖群体(P1997)、来自湖南的2004年引进的养殖群体(P2004)和来自湖北的1984年与1997年引进养殖群体的杂交群体(P8497)的遗传多样性进行研究。用10对选择性引物共扩增出523个位点,其中,243个位点为多态位点,多态位点比例为46.46%;没有发现可以用于区分4个群体的特异性位点,但找到一些潜在的群体鉴别片段;P1984、P1997、P2004和P8497群体的多态位点比例(P)分别为28.93%、38.90%、31.02%和41.66%,Shannon多样性指数(I)分别为0.1439、0.2081、0.1545和0.2373,平均杂合度(H)分别为0.0781、0.0949、0.0803和0.1137。群体间的遗传分化系数(Fst)值为0.1036;根据4个群体之间的基因分化系数(Gst)、遗传距离(D)、遗传相似度(S)以及UPGMA聚类分析发现,P2004和P1997亲缘关系最近,P2004和P1984亲缘关系最远。通过比较分析认为,4个养殖群体的遗传多样性水平均较低。
- 赫崇波陈姝君高祥刚周遵春刘卫东宋文涛
- 关键词：AFLP多态性
