寸建萍 作品数:63 被引量:283 H指数:10 供职机构: 云南省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 更多>>
云南省EV71的分离鉴定和生物学特性分析 2013年 目的对云南省采集的8份EV71标本进行分离鉴定,进行生物学特征分析。方法采集HFMD患儿的标本,然后使用RT-PCR法进行鉴定,对鉴定为阳性的标本进行病毒分离,分离得到的病毒株在Vero细胞中培养,并进行VP1基因测序。用病毒免疫小鼠,免疫后血清进行中和试验和交叉保护试验。结果8份标本均为EV71,并均在Vero细胞中都表现出细胞病变;部分免疫血清效价可高达1:10000以上。结论8株病毒在Vero细胞中有良好的适应性;免疫血清对A和C4基因型保护效果明显。 赵世文 尹卫东 寸建萍 高强 尹洁 刘国军 陆林 徐闻关键词:肠道病毒属 基因型 云南省手足口病流行特征、影响因素及防控策略研究与应用 徐闻 姜黎黎 寸建萍 伏晓庆 周晓芳 向以斌 田炳 手足口病(Hand-foot-mouth Disease,HFMD)是由多种肠道病毒(EV)引起的一种儿童常见急性肠道传染病,病原以肠道病毒71型(EV-A71)和肠道病毒柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)较为常见。自...关键词:关键词:手足口病 肠道传染病 昆明市手足口病病原构成及柯萨奇病毒A组6型基因特征分析(2016-2018年) 被引量:4 2021年 目的了解2016-2018年昆明市手足口病病原构成情况,阐明昆明市流行的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)基因特征。方法对2016-2018年云南省手足口病实验室监测系统收集的昆明市手足口病患儿样本使用CV-A16和肠道病毒71型(EV-A71)+EV通用型核酸检测试剂盒进行实时荧光RT-PCR检测,并对非EV-A71和非CV-A16阳性样本进行普通RT-PCR扩增得到VP1全长序列。用MEGA 5.2软件对本次研究分离到的昆明市CV-A6毒株序列与参考序列构建系统进化树,分析其分子流行病学特征。结果2016-2018年昆明市手足口病病原监测结果显示,昆明市实验室诊断手足口病共2318例,其中,检出EV-A71阳性417例,CV-A16阳性883例,其他EV阳性1018例。2016年的优势病原为CV-A16(50.26%),2017和2018年优势病原均为其他EV,分别占56.06%和54.03%。从其他EV共分离出CV-A6毒株57株,均属于国内流行的D3a亚型。结论2016-2018年引起昆明市儿童手足口病的主要病原体是CV-A16和其他EV,应加强常规监测中其他EV的监测,并关注CV-A6毒株的持续流行。 李楠 姜黎黎 寸建萍 周晓芳 曹亿会 杨溪 田炳均关键词:手足口病 肠道病毒 VP1基因 进化分析 云南省2014年1株肠道病毒71型B5亚型病毒全基因组序列分析 被引量:1 2019年 目的对2014年云南省监测的1株手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)肠道病毒71型(enterovirus 71,EV-A71)B5基因亚型分离株进行全基因组序列分析。方法对收集到的手足口病病例粪便标本进行病毒分离培养和鉴定,对鉴定为EV-A71型B5亚型的毒株全基因组进行分段核酸扩增PCR并测定序列,获得的各段序列通过SeqMan拼接后获得全基因组序列,并与其他参考株构建遗传进化树进行基因分析。结果获得该肠道病毒71型B5基因亚型分离株(J098/YN/CHN/2014)的全基因组序列(7 290bp),它与B5亚型毒株同源性最高(92.4%~98.0%),未发现基因重组情况,其VP1区氨基酸在多个位点上与其他基因型参考株存在特异突变。结论云南由EV-A71引起的手足口病仍以C4a亚型为主,但EV-A71B5亚型毒株的出现提示应密切关注其流行变异情况,为今后手足口病的公共卫生策略提供依据。 周晓芳 向以斌 姜黎黎 徐闻 寸建萍关键词:手足口病 肠道病毒71型 全基因组 2017年昆明市手足口病患儿柯萨奇病毒A组6型VP1区基因特征分析 被引量:5 2020年 目的分析2017年昆明市手足口病(hand,foot and mouth disease)患儿柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CV-A6)VP1区(915bp)基因特征。方法对2017年云南省手足口病实验室监测系统分离到的昆明市21株CV-A6毒株的VP1区基因进行扩增和测序,并将测得的序列与NCBI数据库中的序列进行比对,运用MEGA 5.2软件构建系统进化树,进行分子流行病学分析。结果昆明市21株CVA6毒株之间的核苷酸和氨基酸相似性分别为92.24%~100.00%和96.72%~100.00%。与原型株Gdula(AF081297)的核苷酸和氨基酸相似性为81.53%~83.50%和94.10%~96.39%。基于VP1分型,昆明市21株CV-A6毒株均为D3a亚型,并分成2个不同的进化分支,其中20株为分支1(cluster 1),1株为分支2(cluster 2)。结论2017年昆明市引起手足口病的CV-A6毒株为D3a亚型,流行存在2个传播链,应进一步加强对昆明市CV-A6的持续监测。 李楠 伏晓庆 向以斌 寸建萍 姜黎黎 周晓芳 田炳均关键词:手足口病 VP1基因 2021年云南省手足口病病例中柯萨奇病毒A2型的测序定型和基因特征分析 被引量:2 2023年 目的对2021年云南省昆明市及曲靖市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例中非肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EVA71)和非柯萨奇病毒A组16型(coxsackie-virus A16,CVA16)的其他肠道病毒进行VP4/VP2区及VP1区基因测序检测,并对检测到的CVA2 VP1区基因进行基因进化分析,为CVA2的预防及控制提供实验室证据。方法按《手足口病实验室手册(2018年版)》,对2021年昆明市和曲靖市送到云南省疾病预防控制中心HFMD实验室的标本进行前处理,提取病毒RNA后,先用MD91/OL68-1引物扩增肠道病毒VP4/VP2结合区基因并测序,编辑后的序列在GenBank上搜索确定病毒型别,再用肠道病毒A组引物分两段扩增CVA2 VP1区基因完整序列并测序,通过肠道病毒在线定型工具(Enterovirus Genotyping tool Version 0.1)进行病毒型别确认。按文献下载CVA2 VP1区基因型/亚型代表株序列,Mega5.2软件构建基因进化树,分析病毒基因特征。结果共检测749份非EVA71和非CVA16的肠道病毒标本,两地皆以A组肠道病毒为主,B组肠道病毒有少量报告,CVA16居病原谱第一位。其中CVA25份,检出率为0.67%(5/749),为HFMD的稀有病原。VP4/VP2和VP1两个基因片段的测序检测、定型结果一致。基因特征分析表明,昆明市3株为基因型A,曲靖市2株为基因型D。结论2021年云南省HFMD监测网络中昆明市和曲靖市CVA2的检出率为0.67%,CVA2在这两个市是HFMD的稀有病原。基因进化分析表明,两个基因型分别在昆明市和曲靖市传播但尚未引起流行。昆明市CVA2基因型A为国内首次报道。加强云南省CVA2的实验室监测特别是分子流行病学监测,对追踪和分析病毒传染来源具有重要意义。 刘艳艳 杨善蕊 段忠文 姜黎黎 周晓芳 寸建萍 伏晓庆 罗春蕊 田炳均关键词:手足口病 VP1 基因特征分析 2021年云南省两地区手足口病病原构成及柯萨奇病毒B2型VP1区基因特征分析 2024年 目的对2021年云南省曲靖市和文山州两地区手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原构成及检测到的6株柯萨奇病毒B组2型(coxsackievirus B2,CVB2)VP1区基因特征进行分析,为今后手足口病及CVB2感染的防控提供科学依据。方法对2021年1—12月云南省曲靖市和文山州收集到的手足口病病例粪便标本开展肠道病毒实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time quantitative reverse transcription PCR,real-time qRT-PCR)检测,并对结果为其他肠道病毒(非EV-A71及非CVA16)的标本进行VP1区核酸序列测定。按文献下载CVB2病毒VP1基因代表株参考序列,用Mega 5.2软件进行基因特征分析,用邻位相接法构建系统进化树,所用模式为Kimura二参数置换法(Kimura 2-parameter substitution model)。结果2021年云南省曲靖市和文山州共收集手足口病病例粪便标本1164份,经real-time qRT-PCR检测,检出肠道病毒阳性标本927份,阳性率为79.64%(927/1164),其中EV-A71型109份,占9.36%(109/1164);CV A16型343份,占29.47%(343/1164);其他肠道病毒475份,占51.24%(475/927)。对其他肠道病毒进行基因测序,鉴定出6株CVB2(曲靖市2株、文山州4株),占比为1.26%(6/475),基因特征分析结果表明6株CVB2病毒属于基因型D中的分支2。结论2021年云南省曲靖市和文山州的手足口病病例标本中其他肠道病毒阳性检出率最高,两地区均检出CVB2病毒,且同为D基因型中的分支2,提示在今后手足口病病原监测中应加强对其他肠道病毒的分型分析,以便全面了解手足口病的病原构成,为科学防控提供依据。 寸建萍 李楠 皮自林 周雪花 曹亿会 姜黎黎 周晓芳 杨溪 伏晓庆 田炳均关键词:手足口病 病原 基因特征分析 2009-2011年云南省手足口病流行病学特征分析 被引量:5 2014年 目的了解云南省手足口病的流行特征,为防控提供科学的依据。方法用描述流行病学方法和χ2检验,对2009-2011年疾病监测系统报告的云南省手足口病病例进行分析。结果 2009-2011年,手足口病在全省均有发病,年报告发病率分别为33.17/10万、106.30/10万、84.97/10万,流行高峰主要在4~7月,病例主要集中在5岁以下儿童,尤其是1~3岁儿童,职业分布以散居儿童和幼托儿童为主;低年龄组、就诊不及时、散居儿童和幼托儿童是发生重症的高危因素;实验室检测EV71占53.44%(3 546/6 635),Cox A16占44.55%(2 956/6 635)。结论手足口病在云南省广泛流行,病原主要为EV71和Cox A16。就诊不及时、低年龄组儿童是发生重症的危险因素。 陈玉娟 尹洁 寸建萍 姜黎黎 刘国军 马跃 徐闻关键词:手足口病 重症 发病率 2018-2021年云南省手足口病病例柯萨奇病毒A4型流行株基因特征 被引量:1 2022年 目的 分析云南省手足口病(Hand, foot and mouth disease, HFMD)病例柯萨奇病毒A组4型(Coxsackievirus A4,CVA4)分离株基因特征。方法 在云南省7个市州采集2018-2021年HFMD病例粪便标本,进行肠道病毒RNA提取、VP1区基因扩增、序列测定和基因型别鉴定;构建CVA4分离株与基因库中参考株系统进化树,分析核苷酸和氨基酸相似性。结果 从28 565例HFMD病例粪便标本中获得13株CVA4,其中2018年1株、2019年1株、2020年6株、2021年5株;C2基因亚型11株、C4基因亚型2株。C4和C2基因亚型之间核苷酸、氨基酸平均相似性分别为85.77%、93.27%;与原型株HighPoint相比,C2基因亚型核苷酸、氨基酸平均相似性分别为84.51%、93.27%,C4基因亚型分别为84.44%、93.78%。结论 2018-2021年云南省HFMD病例CVA4的优势流行株为C2基因亚型;需继续加强CVA4分子流行病学监测。 杨溪 姜黎黎 周晓芳 寸建萍 罗春蕊 张勇 伏晓庆 田炳均关键词:手足口病 肠道病毒 基因特征 2019年云南省文山州柯萨奇病毒A16型的基因特征 被引量:5 2020年 目的对云南省文山州2019年手足口病(hand,foot and mouth disease,hfmd)病原分离情况和14株柯萨奇病毒a16型(coxsackievirus a16,cv-a16)的基因特征进行分析。方法对文山州2019年hfmd实验室送到云南省疾病预防控制中心hfmd实验室的595份手足口病患者粪便标本进行病毒分离,并对分离到的74株肠道病毒(enterovirus,ev)vp1区基因进行扩增和测序定型,对cv-a16病毒进行基因特征和分子流行病学分析。结果共从595份标本中分离到74株ev,ev分离率为12.44%(74/595),其中a组病毒(enterovirus species a,ev-a)72株,占97.30%(72/74),ev-b组病毒2株,占2.70%(2/74),未分离到ev-c和ev-d组病毒。ev-a组病毒中,cv-a6病毒最多,共44株,占ev-a组分离数的61.11%(44/72),cv-a16次之,共14株,占ev-a组病毒的19.44%(14/72),ev-a109株,占12.50%(9/72)。基因进化分析表明,14株cv-a16均为b1基因亚型(subgenotype b1)。它们分为2个不同的进化分支(b1a和b1b),其中8株为b1a,6株为b1b。结论2019年文山州hfmd病原以cv-a6组为主,cv-a16次之。cv-a16病毒b1a和b1b两个分支同时在文山州流行。 张丽芬 周雪花 徐敏 姜黎黎 寸建萍 周晓芳 伏晓庆 田炳均关键词:病原分析 柯萨奇病毒A16 VP1基因 基因特征分析