伏晓庆
- 作品数：100 被引量：433H指数：12
- 供职机构：云南省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项云南省应用基础研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学文化科学生物学更多>>
- 昆明地区急性呼吸道感染病毒病原谱分析被引量：6
- 2013年
- 目的了解昆明地区急性呼吸道感染病毒病原谱.方法采集急性呼吸道感染患者鼻、咽拭子,采用多重RT-PCR法进行15种呼吸道病毒病原体检测.结果 600例样本中检出病毒144株,阳性率24%,阳性率最高的是RSV(49/600,8.2%),依次是PIV(32/600,5.3%)、HRV(27/600,4.5%)和IFV(27/600,4.5%);不同年龄组呼吸道病毒感染情况不同,≤1岁年龄组病毒检出率最高(72/216,33.3%);不同季节呼吸道病毒感染情况也不同,其中第一季度病毒检出率最高(85/144,59%).结论 2011年昆明地区急性呼吸道感染的主要病原是RSV,患者中儿童检出率最高;第一季度的病毒检出率高于其他季度.
- 李娟向以斌曹艺会赵晓南宁德明伏晓庆
- 关键词：急性呼吸道感染病毒病原学
- 云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征被引量：1
- 2022年
- 目的分析云南省2021年手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)分离株基因特征。方法从2021年云南省2个市州HFMD病例粪便标本中分离E18;对VP1区基因进行扩增、测序和拼接,获得全序列;构建E18分离株与GenBank中参考株的系统进化树,分析基因特征。结果从HFMD病例中获得8株E18分离株,其完整VP1区序列的核苷酸、氨基酸同源性分别为96.75%-99.77%、97.21%-100%;与原型株Metcalf相比的核苷酸、氨基酸同源性分别为77.24%-78.63%、91.99%-93.73%。基于VP1区分型,8株分离株均属于基因型5分支2,且在VP1区存在特有的氨基酸位点变异(T80A、I240V、T274S和H281R)。结论本研究E18分离株属于基因型5,可能在环境中循环了一段时间。需进一步加强HFMD病例E18监测和分子生物学特征研究。
- 刘艳艳杨善蕊段忠文姜黎黎伏晓庆张勇
- 关键词：手足口病基因特征
- 云南传染病病原谱与流行规律研究及应用
- 赵世文尹洁徐闻古文鹏李娟伏晓庆赵智娴
- 1995年中国启动全国传染病报告系统，然而在2003年发生的非典型性肺炎(SARS)疫情中，暴露出了该系统报告内容不完善、疫情信息不透明、报告流程不规范、资源共享程度不高以及反馈机制不健全等问题。故国家建立"中国疾病预防...
- 关键词：
- 关键词：传染病防治病原学鉴定
- 2014-2018年云南省文山州手足口病病原学监测及柯萨奇病毒A6型的基因特征分析被引量：8
- 2021年
- 目的对2014-2018年云南省文山州手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病例进行病原分析,并对其中分离的柯萨奇病毒A6型(coxsackievirus A6,CV-A6)进行分子流行病学分析。方法用RD细胞和Hep-2细胞从HFMD病例粪便标本中分离病毒,提取病毒RNA,先用MD91/OL68-1引物对病毒VP4/VP2结合区基因进行RT-PCR和测序,确定病毒型别,再用各型病毒的相关引物扩增肠道病毒(enterovirus,EV)VP1区全序并测序;按参考文献下载基因库中CV-A6病毒完整VP1区基因参考序列,用MEGA5.2软件构建系统进化树,进行基因特征和分子流行病学分析。结果5年间共从2848份标本中分离到581株EV,病毒分离率为20.40%(581/2848)。581株病毒中CV-A674份,占阳性总数的12.74%(74/581),CV-A16124份,占21.34%(124/581),EV-A71374份,占64.37%(374/581)。其他病毒9份,占1.55%(9/581)。用MEGA5.2软件对74株CV-A6病毒的VP1基因完整序列(915 bp)作基因进化树,排除序列完全一样的序列后共对22株具有代表性的CV-A6病毒和52株参考株序列共74株病毒作基因进化分析,文山州所有22株均为D3a亚型,其中21株为分支1(cluster 1),1株为分支2(cluster 2)。结论2014-2018年云南省文山州HFMD流行以EV-A71(占64.37%)、CV-A16(占21.34%)和CV-A6(占12.74%)为主。基因特征分析表明,跟往年全国的情况一样,云南省文山州2014-2018年流行的CV-A6为D3a基因亚型,其中进化分支1(cluster 1)是主要的流行分支。
- 周雪花周永明姜黎黎李楠周晓芳寸建萍伏晓庆田炳均
- 关键词：手足口病病原分析VP1基因分子流行病学
- 2011-2016年云南省边境县手足口病流行特征聚类分析被引量：8
- 2018年
- 目的了解云南省边境县手足口病流行特征,为防控策略制定、跨境传染病联防联控工作提供参考依据。方法采用有序聚类和无序聚类方法,对2011-2016年云南省25个边境县的手足口病报告病例数和发病率,按不同月份、年龄段、县区进行分析。结果不同月份手足口病例数有序聚类可分为3类(1-3月、4-6月、7-12月各聚为一类)。无序分类可分为3类(1、4、7、9月; 5-6月及10-12月; 2-3月及8月各聚为一类)。不同年龄段手足口病例数有序分类可分为3类(0～岁、1～3岁、4～岁以上各聚为一类)。无序分类可分为4类(1～岁、2～岁、0～岁及3～4岁、5～岁以上各聚为一类)。按手足口发病率可将25个县聚为4类:1类为瑞丽市、盈江县; 2类为景洪市、勐海县、勐腊县、芒市;其余19个县可分别归为3类、4类。1类、2类县手足口病发病率高于3、4类。结论云南省25个边境县手足口病在不同时间、不同人群和不同地区之间流行具有差异性,应加强重点地区、重点人群的手足口病防控工作。
- 向以斌曹亿会杨景晖伏晓庆
- 关键词：手足口病聚类分析
- 云南省陇川县本土新冠疫情溯源和病毒基因组变异解析被引量：1
- 2022年
- 2021年7月14日,云南省陇川县报告了新型冠状病毒肺炎(COVID-19)本土疫情。为了阐明本次德宏州陇川县本土疫情的感染来源和SARS-CoV-2变异情况,我们收集疫情期间采集的9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例标本进行新冠病毒全基因组测序。通过一系列比较基因组学分析,发现9例陇川疫情本土病例和2例陇川境外病例病毒株基因组序列高度同源,均属Delta变异株(B.1.617.2进化分支),在系统发育树上单独成簇,为同一传播链。9例陇川疫情本土病例和2例境外病例病毒株基因组序列共享38个SNP突变位点和13个缺失。9例本土病例中的4例病毒株均额外增加了1个共享的SNP突变位点,其中2例本土病例病毒株新产生9个核苷酸缺失。这些病毒株S蛋白均发现L452R、T478K、P681R等可能影响病毒传播和免疫逃逸能力的关键性变异位点。该研究表明本次陇川疫情的暴发与发病前14天内德宏州陆路口岸输入病例以及瑞丽2021年7月14日疫情本土病例并无关联性,提示病毒传染源可能来自境外人员。因此,应持续加强边境从业人员和抵边村寨边民的病毒核酸检测以及本土/输入病例基因组变异规律的深入挖掘和监测。
- 张美玲伏晓庆刘照生赵晓南周洁楠
- 关键词：全基因组测序突变位点
- 1995-2006年云南省狂犬病流行情况及防制对策被引量：8
- 2007年
- 目的分析近年来云南省狂犬病流行特征,探讨发病率回升的因素及存在问题并提出相应的防制措施。方法对1995-2006年云南省狂犬病疫情报告、病例调查及监测资料进行分析。结果1995-2006年云南省狂犬病发病95例,死亡95例,病死率100%、除1995、1996、1998年3年无病例报告外,其余各年均有病例发生,发病呈逐年增长趋势,以5～10月份相对较多,占73.7%。全省有11个州(市)报告病例,其中文山、曲靖、德宏等3个州(市)是主要发病地区,集中了79%的病例。发病最多为农民(52.6%),其次是学生(23.2%);年龄最小的2岁,最大的65岁,男女性别比为25:1。病例以犬伤为主,70%以上未进行任何伤口处理和免疫接种。结论云南省狂犬病呈快速增长趋势。领导重视不够,犬只数量增多且缺乏监管,犬只免疫率极低,伤后大多未进行伤口处理和免疫接种等是狂犬病发病率回升的主要原因,今后应加强以上各方面的工作。
- 伏晓庆常利涛
- 关键词：狂犬病防制对策
- 云南省2株柯萨奇病毒A12型VP1区基因特征分析
- 2021年
- 目的:了解云南省手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)监测中分离到的2株柯萨奇病毒A12型(Coxsackievirus A12,CV-A12)VP1区基因序列特征。方法:对HFMD监测中获得的临床标本开展RD细胞上的病毒分离培养,通过荧光定量PCR和测序方法鉴定为CV-A12的毒株,进一步对其VP1区进行序列测定,并搜集GenBank中CV-A12其他型别的参考株,共同构建系统进化树,分析CV-A12的VP1区基因特征。结果:获得2株CV-A12分离株的VP1区序列(888 bp),与2018年的云南参考株毒株同源性最高,其VP1区氨基酸在多个位点上与其他云南参考株存在特异突变。结论:云南省HFMD标本中发现的CV-A12已经发生地区特异性VP1基因变异。
- 周晓芳寸建萍姜黎黎田炳均李楠伏晓庆曹亿会
- 关键词：手足口病VP1基因
- 云南省2012年柯萨奇病毒A组16型基因特征分析被引量：2
- 2016年
- 目的分析云南省2012年引起手足口病（hand-foot—and—mouth disease，HFMD）流行的柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16，CV-A16）的基因特征，为今后开展CV-A16的分子流行病学研究和疾病防控提供数据。方法对从云南省2012年HFMD患者样本中分离到的CV—A16，采用逆转录-聚合酶链反应扩增VP1基因片段全长，并对扩增产物进行测序。根据VP1基因核苷酸序列结果，从中选取20株与其他CV-A16毒株序列（来源于基因库）构建亲缘性关系树，并且进行核苷酸和氨基酸同源性分析。结果从云南省2012年HFMD患者样本中共分离到112株CV—A16，均为B1基因型，其中102株为Blb亚型，10株为Bla亚型，选取所有的Bla和10株Bib进行分析，核苷酸和氨基酸的同源性分别为89．10％～97．87％和98．91％～100．00％。结论引起2012年云南省HFMD流行的CV-A16毒株属于B1基因型的两大进化分支Bla和Blb，两个进化分支在云南共同进化和流行。
- 寸建萍尹洁姜黎黎周晓芳田炳均徐闻伏晓庆张勇
- 关键词：手足口病柯萨奇病毒A组16型基因型分子流行病学
- 基于发热症状监测系统的甲型副伤寒疾病负担分析被引量：1
- 2011年
- 目的评估云南省玉溪市红塔区2008年5月1日至2009年4月30日甲型副伤寒的流行病学负担。方法在建立基于全人群的发热症状监测系统基础上，分别调查和测算红塔区发热病例的就诊率，就诊病例采样率，样本检测率，检测方法灵敏度和实验室确诊病例报告率等，根据食源型疾病的疾病负担金字塔模型对当地伤寒、副伤寒的实际发病数进行估算和分析。结果发热症状监测系统一年内共监测红塔区发热病例6642例，采样并检测6570例，采样率为98．92％，检测率为100％。确诊居住在红塔区的甲型副伤寒阳性病例354例。调查发现发热病例就诊率为73．53％，其中10岁以下儿童就诊率为100％。依据参考文献假定血培养法检测甲型副伤寒的灵敏度为70％，病例网络报告率为90％，经倍数校正后估算红塔区甲型副伤寒年发病数为965例（95％CI：745～2284），年发病率为220．33／10万（95％CI：170．1～521．4），其中发病率最高的年龄组为15～44岁组（318．27／10万）。结论玉溪市红塔区甲型副伤寒处于高流行状态，15～44岁组为高发人群，应采取有针对性的防治措施以减缓甲型副伤寒的高发态势。
- 孙军玲张莹伏晓庆师玉琼李雪梅张伟东张静
- 关键词：甲型副伤寒疾病负担
