陶启蒙
- 作品数:11 被引量:48H指数:6
- 供职机构:中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室更多>>
- 发文基金:国家科技攻关计划中俄国际合作项目国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 禽流感病毒N8亚型神经氨酸酶基因的克隆和全序列分析
- 2010年
- 用SPF鸡胚增殖禽流感病毒A/Duck/Australia/341/83(H15N8),通过RT-PCR获得了NA基因全长,连接并转化,增菌培养后,提取阳性质粒进行序列测定,获得了禽流感病毒N8亚型的NA基因序列,分析了NA8基因与其他流感病毒神经氨酸酶基因的相互关系。结果显示,所获得的NA基因片段全长1459bp,最大开放阅读框编码457个氨基酸残基,经Blast分析,该基因与GenBank中其他13株N8亚型毒株的NA基因核苷酸序列同源性为91.6%~73.3%。与其他8个N1~N9亚型NA基因进行遗传演化分析,N8亚型与N5亚型NA基因的亲缘关系最近,与N3亚型NA基因的亲缘关系最远。结果表明,禽流感病毒N8亚型NA基因序列的测定对N8亚型流感病毒的诊断和预防具有重要意义。
- 王馥梅包红梅陶启蒙蔡东东赵玉辉王秀荣陈化兰
- 关键词:禽流感病毒同源性
- 4种禽病毒抗体可视化蛋白芯片的制备及应用被引量:8
- 2009年
- 【目的】研制可同时鉴别检测AI、ND、IB、IBD等4种禽病血清抗体的可视化蛋白芯片。【方法】用超速离心法和蔗糖密度梯度法分别纯化了4种病毒蛋白抗原,调整到合适浓度后点于醛基修饰的片基上,制备蛋白芯片;分别用4种禽病阳性血清杂交,再与金标二抗杂交,银染显色后读取结果,建立4种禽病的可视化蛋白芯片工作平台;进一步对此芯片的特异性以及灰度值与抗体浓度的相关性进行了研究;最后对18个现地血清样品进行了初步应用检测。【结果】结果显示经过条件优化后,芯片检测探针可特异性的相应的抗体进行杂交,呈现较强的杂交信号,且无交叉杂交。信号灰度值在抗体浓度为50~300μg·ml-1范围内成线性关系。用芯片和其它传统抗体检测方法同时检测18份现地样品,结果发现可视化蛋白芯片具有很好的特异性,并且灵敏性明显高于传统检测手段。【结论】研究表明该方法可用于同步鉴别4种禽病抗体,是一种有效的抗体检测新方法。
- 石霖王秀荣杨忠苹陶启蒙蔡冬冬武嘉男王馥梅田国彬陈化兰
- 关键词:可视化蛋白芯片禽病
- 禽流感病毒等RNA病毒鉴别基因芯片的制备被引量:6
- 2008年
- 将克隆和鉴定的AIV的HA、NA、M、NS、NP基因以及NDV、IBDV、IBV的保守基因片段作为探针,同时以克隆的GAPDH基因作为阳性对照,利用芯片点样系统spotArray TM24将探针与阳性对照、阴性对照和空白对照按照设计好的阵列点在基片上,制备了AIV等RNA病毒诊断芯片,并从点样条件和杂交条件两个方面进行了优化。结果显示,探针浓度在300~1200μg/mL时点样,Cy3-dUTP终浓度为0.05μmol/mL,杂交温度在42℃,杂交时间在8~12h时,杂交信号比较理想。该方法对20份已鉴定的H5N1亚型禽流感病毒的检出率为100%(20/20);10份现地送检的疑似AIV样品的检出率为70%(7/10),检测结果与RT—PCR和鸡胚传代分离鉴定的符合率为100%。结果表明,制备的DNA芯片可有效诊断上述病毒。
- 田丽娜王秀荣杨忠苹石霖陶启蒙包红梅李雁冰陈化兰
- 关键词:禽流感病毒基因芯片
- 禽流感、新城疫可目视化诊断蛋白芯片的制备及初步应用被引量:14
- 2009年
- 本研究制备了可以同时鉴别诊断禽流感(AI)、新城疫(ND)2种禽病血清抗体的可视化蛋白芯片。以超速离心法和蔗糖密度梯度法分别纯化了2种病毒蛋白抗原,用点样缓冲液稀释后点于醛基修饰的片基上,制备蛋白芯片;将芯片与待检血清杂交后,再与胶体金标记的二抗杂交,银染显色后根据灰度值判定结果,从而建立了2种禽病的可视化蛋白芯片鉴别诊断方法。采用该方法对18份现地血清样品进行初步检测,结果显示该芯片可特异性的与相应的抗体杂交,无交叉反应,而且呈现较强的杂交信号,其信号灰度值在阳性血清浓度为50μg/mL~300μg/mL范围内成线性关系(Y=0.426X+4.225)。用该芯片方法和琼扩(AGP)抗体检测方法对18份现地样品进行符合率检测,结果表明该可视化蛋白芯片具有很好的特异性,并且检测灵敏度为是AGP方法的400倍以上。研究表明该方法可用于同步鉴别2种禽病,是一种有效的抗体检测新方法。
- 石霖王秀荣杨忠苹陶启蒙王煜武嘉男蔡冬冬包红梅陈化兰
- 关键词:禽流感新城疫可视化蛋白芯片
- 区分禽流感病毒亚型诊断基因芯片的构建被引量:7
- 2008年
- 制备了可同时区分AIVH5、H7、H9血凝素亚型及N1、N2神经氨酸酶亚型的基因诊断芯片。试验以重组质粒为模板,进行PCR扩增,然后用异丙醇沉淀法进行纯化,制备探针及内参基因。将探针及内参基因用点样缓冲液稀释到0.3μg/μL后用芯片点样仪将其点制到醛基化基片上,样点中心间距450μm,样点直径220μm。将点好的基片在室温干燥24h以上,后经65℃再水合10s、80℃干燥、65mj紫外线交联照射25min后,再用封闭液封闭,95℃变性处理,成功构建了能区分禽流感血凝素H5,H7,H9亚型及神经氨酸酶N1,N2亚型的检测基因芯片。在PCR扩增中标记待检样品,对制备的检测芯片进行质量检验,结果表明,制备的区分禽流感病毒亚型基因芯片可区分AIV部分亚型。
- 杨忠苹王秀荣石霖田丽娜王煜陶启蒙陈化兰
- 关键词:禽流感基因芯片
- 单链标记与芯片结合鉴别AIV主要亚型的研究
- 结合单链标记和基因芯片两种技术,构建可同时区分AIV的H5、H7、H9血凝素亚型及N1、N2神经氨酸酶亚型的基因芯片。分别T\A克隆部分禽流感病毒的M基因,H5、H7、H9亚型HA基因,N1、N2亚型NA基因,并构建重组...
- 陶启蒙王秀荣武嘉男石霖李雁冰包红梅陈化兰
- 关键词:基因芯片
- 文献传递
- 禽流感基因诊断技术研究进展被引量:2
- 2008年
- 禽流感是由流感病毒引起的一种人和动物的高度传染性疾病,不但造成养禽业的巨大经济损失,还对人类公共卫生安全存在威胁。因此,快速、准确的基因诊断技术对于禽流感的防控显得非常重要。近年来,主要有RT-PCR技术、荧光定量RT-PCR技术、核酸依赖扩增技术(NASBA)以及基因芯片等基因诊断技术。文章就这些方法的基本原理、检测优点以及应用现状进行综述,以期为有效控制禽流感的发生与流行提供有力技术支撑。
- 田丽娜王秀荣杨忠苹石霖陶启蒙陈化兰
- 关键词:禽流感反转录-聚合酶链反应基因芯片
- H7亚型禽流感病毒一步法RT-PCR检测方法的建立被引量:2
- 2009年
- 通过分析流感数据库45个H7亚型禽流感病毒的HA序列,在保守区内设计并合成引物,建立了一步法RT-PCR检测方法,扩增片段大小为501bp。通过对H7亚型禽流感病毒尿囊液和棉拭子浸出液不同滴度检测,证实病毒尿囊液最低检出量为105.5EID50/mL;阳性棉拭子最低检出量为103EID50/mL。用该方法检测H1~H15亚型禽流感病毒和鸡新城疫病毒等其他14种禽病病原进行检测,仅有H7亚型AIV有特异性目的条带,与其他均无交叉反应。从脏器及咽喉、泄殖腔棉拭子样品的病毒分离和RT-PCR方法比较,表明在10-1的样品浓度下,两者可以达到相同的检出量。表明该一步法RT-PCR方法具有特异性强、敏感性高和准确率高的特点。
- 包红梅王秀荣陶启蒙蔡东东王馥梅陈化兰
- 关键词:禽流感病毒反转录聚合酶链反应H7N1
- 不对称RT-PCR结合芯片技术鉴别四种禽病的初步研究
- 本研究建立了一种基因芯片结合不对称RT-PCR鉴别诊断禽流感/(Avian influenza,AI/)及其主要亚型/(H5, H7, H9和N1,N2/)、鸡传染性支气管炎/(Infectious bronchitis...
- 陶启蒙
- 关键词:基因芯片禽病
- 文献传递
- H9亚型禽流感病毒RT-PCR检测方法的建立被引量:7
- 2010年
- 通过分析流感数据库中123个HA序列,根据HA保守区序列设计并合成了1对引物,建立了一步法RT-PCR检测方法,预期扩增片段大小为732 bp。通过对H9亚型禽流感病毒(AIV)不同稀释度的尿囊液和棉拭子浸出液进行检测,证实病毒尿囊液的最低检出量为1×10^4.7EID50/mL;阳性棉拭子的最低检出量为1×10^2.5EID50/mL。用该方法检测H1-H15亚型AIV和鸡新城疫病毒等其他14种禽病病原,结果仅有H9亚型AIV出现特异性目的条带,而其他均未出现目的条带。脏器及咽喉、泄殖腔棉拭子样品在1∶10稀释度下,病毒分离和RT-PCR方法可以达到相同的阳性检出率。表明建立的AIV H9亚型RT-PCR方法具有较好的特异性和敏感性。
- 包红梅王秀荣陶启蒙蔡东东王馥梅赵玉辉陈化兰
- 关键词:禽流感病毒一步法RT-PCRH9亚型