闫慧 作品数:14 被引量:17 H指数:2 供职机构: 重庆大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 四川省卫生厅科研基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 建筑科学 生物学 更多>>
引起血流感染常见的革兰氏阴性杆菌蛋白指纹图谱的建立 被引量:5 2012年 目的建立引起血流感染的临床常见革兰氏阴性杆菌的蛋白指纹图谱,为血流感染快速诊断奠定基础。方法在血培养分析仪报阳后8小时内抽取报阳血培养基3 ml,经离心、红细胞裂解液溶解红细胞及无菌去离水洗涤后,留取细菌悬液,应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术(surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrome-try,SELDI-TOF-MS)和Au蛋白芯片检测细菌蛋白,采用Ciphergen Proteinchip软件自动采集数据。每个标本重复测定4次评价SELDI-TOF-MS检测细菌蛋白的重复性。结果在分子量5~20 kD范围内不同种细菌具有不同的蛋白指纹图谱;同种细菌具有相似的蛋白指纹图谱,主要蛋白峰分子量的变异系数<0.1%;同一株细菌蛋白指纹图谱具有很好的重复性,主要蛋白峰分子量的变异系数<0.05%。结论在分子量5~20 kD范围内不同种细菌具有特征性蛋白指纹图谱,为血流感染病原菌的快速鉴定提供了新思路。 黄文芳 肖代雯 杨永长 谢春宝 张航峰 闫慧 钟敏关键词:血流感染 革兰氏阴性杆菌 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 一种保证基坑工程安全性的桩锚联合支护结构 本发明涉及基坑支护技术领域,公开了一种保证基坑工程安全性的桩锚联合支护结构,包括对称设置的支护板,支护板开设有滑槽,滑槽的内部滑动穿设有多个锚杆,锚杆上设有用于连接支护板的连接组件,支护板的上方设有连接板一,支护板顶端的... 王鲁琦 闫慧 赵敏 刘朋飞 张凯强 陈志昊 刘松林 林思成 华海成飞行时间质谱结合SDS-PAGE分析血小板蛋白 目的使用两种蛋白检测方法分析血小板蛋白,为血小板蛋白标志物筛选提供依据。方法分离全血样品中血小板,反复冻融使其裂解,离心提取蛋白,分别采用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI)和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(S... 黄文芳 闫慧 杨永长 肖代雯 姜伟 韵雪雪 齐伟 谢春宝文献传递 一种岩土工程用土体渗水预警装置 本发明涉及土体监测领域,公开了一种岩土工程用土体渗水预警装置,包括深入筒,其设置有多个;泵送机构,其设置在深入筒内,多个泵送机构之间依次连接;嵌入机构,其设置在深入筒内,其设置有多个;封装盖,其连接在最顶部的所述深入筒上... 王鲁琦 闫慧 张凯强 顾文帅 刘朋飞 孔德婧楠 刘松林 林思成 王硕 华海成临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹库的构建 目的:建立包含金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、溶血性葡萄球菌、粪肠球菌和屎肠球菌共5种临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹模型的蛋白指纹库,并通过与分子生物学方法鉴定结果比较,验证其诊断效率,为细菌快速鉴定奠定基础。 方法:1... 闫慧关键词:革兰氏阳性球菌 分子生物学鉴定 利用蛋白芯片技术诊断和评估肾损伤的临床应用 被引量:1 2011年 目的利用Au蛋白芯片(proteinchip gold array)技术检测肾损伤患者尿蛋白指纹图谱,探讨其灵敏、快速预测和评估肾损伤的临床应用价值。方法利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption-ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术及Au蛋白芯片检测477例尿蛋白指纹图,包括237例肾病患者和240例对照者。利用生物标志模型软件(biomarker patterns software,BPS)筛选标志蛋白,结合人工神经网络(artificialneural network,ANN)技术建立模型,评价其在诊断和评估肾损伤中的应用价值。通过电喷雾四级杆飞行时间质谱(electrospray ionization quadrupole time of flight,ESI-Q-TOF)结合比对标准蛋白质谱,对部分差异蛋白进行鉴定。结果肾病患者与对照者尿中差异表达的蛋白质峰有75个,其丰度值两组间比较差异均有统计学意义(t值为-11.6-28.1,P均<0.05),筛选质荷比(m/z)6182、88439、7402、37706、76508、0045和91 240蛋白质建立的ANN模型预测肾损伤的灵敏度为96.6%(84/87),特异度为94.4%(85/90)。鉴定结果表明11735、15150、22871、23770、67650 h和80045m/z蛋白分别为β2-微球蛋白、血红蛋白、α1-抗胰蛋白酶、α1-微球蛋白、白蛋白和转铁蛋白。结论基于Au蛋白芯片的SELDI-TOF-MS技术检测尿蛋白指纹图,在肾脏疾病的诊断、蛋白尿类型判断、肾损伤评估及治疗评价中具有潜在的应用价值。 姜伟 杨永长 肖代雯 张琳琳 韵雪雪 刘华 闫慧 黄文芳关键词:蛋白芯片 肾病 蛋白标志物 人工神经网络 临床常见革兰氏阳性球菌蛋白指纹库的构建 2011年 为建立临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库,为快速鉴定这些细菌奠定基础,收集了从临床中分离获得的185株革兰氏阳性球菌,包括金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、溶血性葡萄球菌、粪肠球菌和屎肠球菌。将这些菌株分成建模组和验证组,利用表面增强激光解析电离飞行时间质谱检测细菌蛋白,用ProteinChip和Biomarker Wizard软件对建模组细菌数据进行分析,筛选出每种细菌各自稳定表达的蛋白峰,并将数据导入自建的Fingerwave软件建立了临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库。随后,将验证组细菌的蛋白峰数据与蛋白指纹库中蛋白峰数据进行相似度分析,以评价其鉴定符合率。建立了包含5种临床常见革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库,利用其对验证组菌株进行鉴定,与应用传统微生物学鉴定及分子生物学方法获得的鉴定结果的符合率为100%。结果表明,进一步扩大并完善革兰氏阳性球菌的蛋白指纹库,将为临床病原菌的快速鉴定提供可能。 闫慧 黄文芳 杨永长 肖代雯 姜伟 罗春丽关键词:革兰氏阳性球菌 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 体外培养乳腺癌细胞线粒体差异蛋白的筛选 2011年 目的比较体外培养的乳腺癌细胞与正常乳腺细胞线粒体蛋白指纹图谱,筛选差异蛋白,为乳腺癌亚细胞蛋白标志物的研究奠定基础。方法提取乳腺癌细胞株MDA-MB-231、MCF-7及正常乳腺细胞株HBL-100线粒体蛋白,表面增强激光解析蛋白飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)检测蛋白表达,Biomarker Wizard Software分析软件统计结果,筛选差异蛋白,并探讨溶剂及长期冻存对结果分析的影响。结果在相对分子质量2 000~100 000范围内检测到近200个蛋白峰,HBL-100与MDA-MB-231和MCF-7细胞相比,差异蛋白峰分别为45个和36个(P<0.05),其中相对分子质量9 200、13 800、14 000和22 500的蛋白在2株癌细胞中表达均下降,相对分子质量10 000和11 600的蛋白在2株癌细胞中表达均升高。4‰的TritonX-114及冻存3~6个月对结果分析无影响。结论 SELDI-TOF-MS能够快速、灵敏地检测分析乳腺癌线粒体差异表达蛋白,为亚细胞水平乳腺癌标志物的研究提供了新的思路。 韵雪雪 杨永长 姜伟 肖代雯 闫慧 黄文芳 罗春丽关键词:乳腺肿瘤 线粒体蛋白质类 蛋白指纹图谱 差异蛋白 样品沉淀方法对线粒体蛋白指纹图谱分析影响 2011年 目的比较不同方法沉淀乳腺癌线粒体蛋白对Au芯片分析的影响,为Au芯片研究亚细胞蛋白奠定基础。方法提取体外培养乳腺癌细胞MCF-7的线粒体蛋白,分别采用丙酮沉淀,三氯醋酸-丙酮(TCA-丙酮)沉淀,饱和(NH4)2SO4沉淀处理样品,点样Au蛋白芯片,表面增强激光解析蛋白飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析蛋白指纹图谱,Biomaker Wizard Software分析软件收集数据。结果每种方法均重复试验20次,在质荷比(m/z)2000~100 000范围内检测蛋白点数目,统计结果分别为TCA-丙酮沉淀39个,丙酮沉淀71个,饱和(NH4)2SO4沉淀14个;选择8.6、10.0、11.3、14.0和15.6kD 5个含量较高的蛋白作为标志,采用q检验进行两两分析,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论对分子量(Mr)〈11 kD的蛋白,丙酮沉淀处理可以获得较好的蛋白指纹图谱,对Mr〉11 kD的蛋白TCA-丙酮沉淀处理结果好,综合使用2种方法分别处理样品上样Au芯片可以获得好的线粒体蛋白分析结果。 韵雪雪 杨永长 姜伟 肖代雯 刘华 闫慧 黄文芳乳腺癌细胞膜蛋白的SELDI-TOF-MS分析 被引量:1 2012年 目的比较乳腺癌细胞株和正常乳腺上皮细胞膜蛋白指纹图谱,为乳腺癌亚细胞蛋白组学的研究奠定基础。方法试剂盒提取两株乳腺癌细胞株MDA-MB-231,MCF-7及一株乳腺正常上皮细胞HBL-100的膜蛋白,SEL-DI-TOF-MS分析蛋白指纹图谱,寻找差异蛋白。结果在分子量2kD-100kD范围内3株细胞均可检测到近100个蛋白点,MDA-MB-231和MCF-7与HBL-100相比,膜蛋白差异点分别为32个和34个(P<0.05),其中7.8kD,8.3kD和8.8kD的蛋白在两株癌细胞中表达均降低,9.6kD的蛋白在两株癌细胞中表达均增高。结论 SELDI-TOF-MS可以快速灵敏地检测到乳腺癌亚细胞蛋白水平的差异,为乳腺癌早期诊断提供依据。 韵雪雪 杨永长 姜伟 肖代雯 闫慧 黄文芳关键词:膜蛋白 SELDI-TOF-MS 乳腺癌 蛋白组学