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陈海丽: 作品数：11 被引量：47H指数：4; 供职机构：上海市公共卫生临床中心更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项上海市卫生局青年科研基金更多>>; 相关领域：医药卫生更多>>

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2015—2016年上海地区成人门诊腹泻病例中诺如病毒GⅡ型流行特征被引量：5: 2020年; 目的了解2015—2016年上海地区成人门诊急性腹泻病例中诺如病毒(norovirus,NoV)GⅡ型的基因分型及分子流行病学特征。方法收集上海地区2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本,采用一步法定量逆转录PCR方法检测NoV GⅡ型,并扩增开放阅读框1(open reading frame,ORF1)的聚合酶和ORF2衣壳区域进行测序分型。结果2015年3月至2016年12月912份成人急性腹泻粪便标本NoV GⅡ型阳性检出率为17.76%(162/912),其中2015年NoV GⅡ型阳性率为15.08%(65/431),2016年阳性率为20.17%(97/481),阳性标本中针对ORF1的RdRp区域和ORF2区域5′端均分型的标本为145份,共有10种型别,分别为GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012(60份)、GⅡ.P17_GⅡ.17(45份)、GⅡ.P16_GⅡ.13(10份)、GⅡ.P12_GⅡ.3(10份)、GⅡ.P7_GⅡ.6(9份)、GⅡ.P21_GⅡ.21(5份)、GⅡ.P16_GⅡ.4 Sydney 2012(2份)、GⅡ.Pe_GⅡ.17(2份)、GⅡ.P2_GⅡ.2(1份)、GⅡ.P7_GⅡ.14(1份)。结论上海地区2015年春季主要流行GⅡ.P17_GⅡ.17,2015/2016年冬春季主要流行GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012和GⅡ.P17_GⅡ.17,而2016年秋季主要以GⅡ.Pe_GⅡ.4 Sydney 2012流行为主。进行持续的NoV暴发监测对于确定基因型分布的变化趋势和新毒株的发现非常重要。; 陈海丽杨春忆张万菊刘祎田棣王蔚易志刚朱召芹; 关键词：诺如病毒成人腹泻

CFP10-ESAT6融合蛋白用于结核分枝杆菌感染诊断ELISA方法的初步研究被引量：3: 2015年; 目的制备结核分枝杆菌CFP10-ESAT6融合蛋白,探讨CFP10-ESAT6融合蛋白在结核分枝杆菌免疫诊断中的应用价值。方法 PCR扩增得到CFP-10、ESAT6基因片断,将其先后克隆入pET-28a表达载体。优化表达条件、用镍亲和层析的方法纯化带His标签的重组CFP10-ESAT6融合蛋白(rCFP10-ESAT6)。制备兔多克隆抗体,建立rCFP10-ESAT6为抗原的酶联免疫吸附试验(ELISA)方法,以健康者血清为对照,检测170例结核患者血清的抗体。结果重组质粒pET28a-CFP10-ESAT6靶基因测序结果与预计设计完全一致。融合蛋白在E.coli BL21(DE3)工程菌中均为可溶性表达,表达量占菌体总蛋白的40%。利用金属螯合亲和层析直接纯化重组蛋白,纯度达到95%以上。Western blot分析表明,重组蛋白能与结核患者血清发生特异性免疫结合反应,与健康者血清不发生反应。CFP10-ESAT6的兔多克隆抗体的效价为1∶8 000,CFP10-ESAT6作为包被抗原的检测结核病人血清中特异性抗体的间接ELISA最佳包被浓度为0.002μg/mL,患者血清的最佳稀释度为1∶500。检测结果与临床诊断的符合率,ELISPOT>ELISA(rCFP10-ESAT6)>ELISA(kit)。结论CFP10-ESAT6融合蛋白具有较高的抗原特异性和免疫反应性,有可能成为结核病免疫学诊断的特异抗原,对结核的诊断具有重要参考价值。; 许艳陈海丽刘晓茜熊延青席秀红宰淑蓓蔡金凤卢水华朱召芹; 关键词：结核分枝杆菌

2010--2012年上海市两家哨点医院门诊腹泻病例副溶血弧菌感染状况及菌株分子特征分析被引量：9: 2015年; 目的分析2010--2012年上海市两家哨点医院肠道门诊腹泻病例副溶血弧菌感染情况，以及菌株携带毒力基因状况和分子特征。方法于2010--2012年，以上海市两家医院的肠道门诊为监测哨点，以医院的2729例腹泻病例为研究对象，采集每例1份粪便样本。采用硫代硫酸盐柠檬酸盐胆盐蔗糖（TCBS）琼脂培养基及生化反应分离和鉴定副溶血弧菌，采用多重PCR检测分离菌株的毒力基因携带情况，采用PFGE对菌株进行聚类分析，同时进行多位点序列分型（MLST）。结果2729份样本中，分离到副溶血弧菌30株，2010--2012年的分离率分别为1．1％（11／973）、1．0％（11／1120）、1．3％（8／636）。携带tlh、tdh、trh基因的菌株分别占100％（30／30）、97％（29／30）、0-30株副溶血弧菌临床分离株共分为13种PFGE型（P1～13）和3种MLST型（ST-189、STG99、ST-3）。其中，P4型菌株占30％（9／30），1x）、P10型均占12％（4／30），P1、P2、P12、P13型均占7％（2／30），其余PFGE型均占3％（1／30）；ST-3型占84％（25／30），ST-189型占13％（4／30），ST-799型占3％（1／30）。结论2010--2012年上海市两家哨点医院腹泻病例副溶血弧菌感染率较低；副溶血弧菌临床分离株均携带t腕基因，不携带￡旃基因，MLST型以ST-3型为主。; 陈海丽周海健宰淑蓓蔡金凤钱方兴马亮王茉婴沈震李杨张军胡芸文阚飙朱召芹; 关键词：弧菌副溶血性脉冲场多位点序列分型

新型冠状病毒肺炎合并新生隐球菌感染1例报道被引量：1: 2020年; 新型冠状病毒肺炎(corona virus disease 2019,COVID-19)是继严重急性呼吸综合征冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus,SARS-CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(middle east respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)后出现的又一种能引起人严重呼吸系统疾病的新型冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARSCoV-2)感染引发的传染病[1]。COVID-19传染性强、临床表现多样,给疫情防控和疾病治疗带来了一定的困难[2]。; 蔡金凤曹宇硕王棪陈海丽胡绿荫朱召芹; 关键词：病毒性肺炎新生隐球菌感染

基于CRISPR/Cas9技术的MAVS和NFκB1基因敲除MDCK细胞系的构建及初步鉴定被引量：2: 2020年; 目的构建线粒体抗病毒信号(mitochondrial antiviral signaling,MAVS)和核因子κB1(nuclear factor kappa B1,NFκB1)基因敲除的犬肾细胞系(Madin-Daby canine kidney cells,MDCK),对细胞系的生长特性、流感病毒(influenza virus,Flu)的增殖特性进行初步鉴定。方法采用CRISPR/Cas9技术,将MDCK细胞的MAVS和NFκB1基因敲除,获得稳定的敲除细胞系。接种Flu并检测培养上清中病毒的血凝(hemagglutinination,HA)滴度和TCID50滴度,与野生MDCK细胞进行比较。结果获得2株稳定敲除的MDCK细胞系MDCK-MAVS-和MDCK-NFκB1-,与野生MDCK细胞同样为贴壁的上皮样细胞。接种Flu后,2株敲除细胞系测定的病毒HA滴度与野生细胞相比无明显差异,TCID50分别比野生MDCK细胞系提高了9.5倍和10倍,其差异有统计学意义(P=0.0316)。结论本研究构建的2株基因敲除细胞系MDCK-MAVS-和MDCK-NFκB1-能够提高Flu的感染力,为Flu的分离培养提供了新的候选细胞系。; 田棣刘祎陈海丽杨春忆王蔚易志刚张万菊; 关键词：核因子基因敲除

上海某医院2011年1至5月住院病例2044份血及体液标本血培养结果分析被引量：13: 2014年; 目的监测和分析上海市公共卫生临床中心血及体液标本血培养分离各种细菌的分布趋势,评价全自动血培养仪阳性结果中的菌群类型和假阳性/假阴性情况。方法采用法国生物梅里埃公司全自动血培养仪和细菌鉴定仪对2011年1至5月收集的2 044份血及体液标本进行培养和鉴定,并进行结果分析。结果不同标本的细菌阳性检出率不同,穿刺液标本的细菌阳性检出率最高(38.10%),其次为血液标本(30.74%)。共分离出231株细菌,总阳性检出率为11.30%,均为单一菌种。其中凝固酶阴性葡萄球菌最多(41.13%),其次为真菌(18.18%),金黄色葡萄球菌所占比例最少(0.87%)。结论了解血及体液标本培养的菌群类型和分布情况,对致病菌和污染菌进行综合鉴别和分析,将有助于指导或帮助临床用药,预防败血症的发生。; 赵忆文朱召芹蔡金凤陈海丽王茉婴胡芸文张军宰淑蓓; 关键词：血培养全自动血培养仪

霍乱弧菌中调控aphB的基因筛选及其功能被引量：1: 2012年; 【目的】筛选霍乱弧菌C6706-中调控LysR家族蛋白AphB表达的基因。【方法】将霍乱弧菌埃尔托型菌株C6706-aphB启动子区克隆到2个报告质粒pBBRLux和pKP302上,并将其导入霍乱弧菌C6706-中,以此作为出发菌株。利用出发菌株与转座子pSC123接合构建LZV630-302转座子随机突变文库,通过测定化学发光强度检测aphB启动子的表达水平,筛选aphB表达受影响的突变株。利用随机PCR方法检测转座子插入位点,并测序比对分析基因。【结果】从7个转座子库中(共约4万个突变株)得到能影响aphB表达(均导致下降)的2株突变株T1和T2。测序比对发现T1中转座子插入在vc1585读码框内,T2中转座子插入在距vc1602基因末端7 bp处。【结论】获得aphB表达改变的突变株,基因vc1585和vc1602可能直接或间接影响aphB表达,为进一步研究aphB表达调控影响因素奠定了基础。; 陈海丽朱召芹钟增涛朱军阚飙; 关键词：霍乱弧菌基因调控

El Tor霍乱弧菌双精氨酸转运系统功能单位的分析研究被引量：2: 2012年; 本文旨在分析El Tor霍乱弧菌双精氨酸转运(Tat)系统的基因簇构成,对其功能进行分析,确定其最小功能单位。通过与大肠埃希菌Tat系统基因簇的基因同源性比较,推测霍乱国际测序标准株N16961的Tat系统基因簇构成;分别对霍乱弧菌Tat系统的基因簇进行单基因缺失、双基因缺失和全基因缺失,建立缺失株和回补株,并与野生株进行表型比较,进一步分析霍乱弧菌Tat系统的基因构成和最小功能单位。结果显示,霍乱弧菌Tat系统基因簇由tatA、tatB、tatC、tatA_2 4个基因构成,其中tatA、tatB和tatC基因位于霍乱弧菌Ⅰ号染色体,tatA_2基因位于霍乱弧菌Ⅱ号染色体。tatB和tatC基因缺失影响霍乱弧菌Tat系统功能,tatA或tatA_2单基因缺失后均可基本保持Tat系统功能,但同时缺失则导致菌株Tat系统功能丧失。提示霍乱弧菌Tat系统最小功能单位是tatA-tatB-tatC或tatA_2-tatB-tatC,tatA与tatA_2功能重复。; 朱召芹景怀琦陈海丽胡芸文阚飙; 关键词：霍乱弧菌

霍乱弧菌双精氨酸转运系统基因共转录和同源性分析被引量：1: 2015年; 目的研究霍乱弧菌双精氨酸转运系统（twin—arginine translocation system，Tat）基因簇各个基因的共转录情况，并确定参与Tat转录基因簇构成。方法选择霍乱弧菌埃尔托生物型菌株N16961和tatABC基因缺失株N169-dtat进行Tat基因簇及上下游基因，即上游蛋白质生物合成ubi aarF基因和下游细胞色素C551过氧化物酶编码基因咧551基因进行逆转录，分析Tat基因簇的共转录情况。选择霍乱弧菌及其他弧菌属菌株，通过PCR产物测序和序列比对，对Tat转运系统的同源性进行比较，进行Tat基因簇各基因聚类分析。结果Tat基因簇4个基因（tatA、tatB、tatC和ratE）均可以共转录。ubi aarF基因可以与tatA及tatB共转录。cyt551基因与上游的4个基因均不共转录；通过N16961 Tat基因缺失株总RNA逆转录分析发现，虽然ubi aarF与tatA、tatB的共转录由于基因缺失被阻断，但该基因仍可以被分别转录。不同型别的霍乱弧菌和其他弧菌属的菌株tarA、tatB、tatC、ratE单基因和tatABC基因簇聚类分析结果表明，Tat基因簇的种属变异性很小，是一段很保守的序列。结论霍乱弧菌ubi aarF基因与Tat基因簇可能共同受调控因子的作用；Tat基因在弧菌属中属于保守结构。; 朱召芹陈海丽周海健景怀琦闫梅英宰淑蓓蔡金凤胡芸文阚飙; 关键词：基因序列同源性

E1 Tor霍乱弧菌Tat转运系统最小功能单位研究: 为分析El Tor霍乱弧菌双精氨酸转运(Tat)系统的基因簇构成，确定其最小功能单位。通过与大肠杆菌Tat基因簇的基因同源性比较，推测对霍乱国际测序标准株N16961的Tat系统基因簇的构成;分别对霍乱弧菌Tat系统的基...; 朱召芹景怀琦陈海丽胡芸文阚飙; 关键词：霍乱弧菌生物学功能; 文献传递

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