陶美凤
- 作品数：41 被引量：70H指数：5
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金The Royal Society武汉市青年科技晨光计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 变铅青链霉菌高效异源表达宿主SBT5的构建被引量：5
- 2014年
- 以变铅青链霉菌TK24为出发菌株,依次敲除钙依赖抗生素(CDA)、放线紫红素(ACT)和十一烷基灵菌红素(RED)这3个内源抗生素的生物合成基因簇,同时在钙依赖抗生素基因簇原位整合了来自棒状链霉菌的全局性调控基因afsRScla,构建得到变铅青链霉菌菌株SBT5。将来自天蓝色链霉菌的放线紫红素生物合成基因簇导入SBT5中,接合子产生大量蓝色的放线紫红素,而出发菌株TK24只产微量蓝色抗生素;SBT5接合子的ACT产量也显著高于导入了额外act基因簇拷贝的出发菌株接合子。SBT5菌株次级代谢背景清晰,不产色素类抗生素和抗细菌抗生素,可作为高效宿主用于次级代谢产物基因簇的异源表达和筛选。
- 白亭丽俞燕飞徐钟陶美凤
- 关键词：变铅青链霉菌次级代谢产物基因敲除
- 一个巨大的多烯抗生素基因簇中聚酮合酶(PKS)基因单元在大肠杆菌中的双重诱导超量表达被引量：2
- 1999年
- 根据序列分析信息，将链霉菌FR－008中与多烯大环内酯抗生素生物合成直接有关的PKS基因簇内长2671bp的一个PKS单元以正确框架克隆于表达载体pET－15b中P（T7）启动子下游的BamHI位点上，经IPTG诱导只得到微量PKS表达。同样地克隆于pBV220中PRPL启动子下游的PKS基因在42℃诱导后也不能超量表达出PKS蛋白。然而克隆于串联启动子PRP（T7）或PRPLP（T7）下游的PKS基因却得到了超量表达。在PRPLP（T7）下游PKS基因的超量表达依赖于IPTG及42℃两个条件的双重诱导，而42℃及IPTG单独诱导只得到常量表达。而在PRP（T7）启动子下游时PKS基因在42℃、IPTG单独诱导或42℃＋IPTG双重诱导时均可获得超量表达。据此构建了启动子PR、P（T7）串联排列的表达载体pH2330。外源基因克隆于该载体起始密码子下游的多克隆位点时，表达的外源蛋白可用Ni（＋＋）"柱亲和纯化。此外，用在大肠杆菌中表达的PKS蛋白作为抗原免疫大白兔制备了特异性的抗体，Westernblotting实验证明该抗体是PKS特异性的，可用于PKS基因簇及PKS异源表达的深入研究。
- 陶美凤胡志浩周秀芬周启邓子新Tobias KIESERDavid A HOPWOOD
- 关键词：PKS大肠杆菌
- 刺糖多孢菌鼠李糖和福乐糖胺合成基因的克隆和组装被引量：2
- 2012年
- 鼠李糖和福乐糖胺是多杀菌素生物合成必需的2个脱氧糖结构单元,负责其合成的4种酶的基因(gtt、epi、gdh、kre)与多杀菌素生物合成基因簇并不在一起,而是分散分布在染色体的3个位点上。为克隆到完整的多杀菌素生物合成基因簇,采用构建基因组文库、PCR扩增等手段从刺糖多孢菌NRRL18395染色体分别克隆gtt、epi、gdh和kre基因,并将其克隆组装在同一整合型载体上,以便于构建用于表达多杀菌素糖单元合成基因的表达载体。
- 郭航白亭丽陶美凤
- 关键词：刺糖多孢菌多杀菌素鼠李糖原位杂交
- 大肠杆菌乙酰-CoA羧化酶基因异源表达对变铅青链霉菌次级代谢的影响被引量：3
- 2013年
- 克隆组装了大肠杆菌的乙酰-CoA羧化酶基因acc,以研究其异源表达对变铅青链霉菌中2种"沉默"抗生素放线紫红素和十一烷基灵菌红素合成的影响。大肠杆菌ACC由4个基因编码,通过PCR扩增4个基因,并通过重叠延伸PCR加上ermE启动子,构建得到4个重组基因;再将重组基因依次组装得到异源表达质粒pHLZ11,接合转移到变铅青链霉菌中进行异源表达。结果显示:含有异源表达质粒的变铅青链霉菌接合转移子能合成放线紫红素而十一烷基灵菌红素产量提高。表明大肠杆菌acc基因异源表达能够激活变铅青链霉菌沉默抗生素的合成,并提高已有抗生素产量。
- 郑华亮白亭丽陶美凤
- 关键词：变铅青链霉菌大肠杆菌
- 用于提高链霉菌抗生素产量的方法及菌株
- 本发明属于链霉菌技术领域，具体地说属于利用分子生物学方法提高链霉菌抗生素产量的方法及其高产链霉菌株的选育。本发明的方法包括：从链霉菌的基因组文库或总DNA中将含有nsdA基因的片段克隆下来，得到含有nsdA基因片段的重组...
- 陶美凤应新王茜李文成余贞邓子新周秀芬
- 文献传递
- 3，7‑二羟基卓酚酮生物合成基因簇及其应用
- 本发明公开了一种3，7‑二羟基卓酚酮生物合成基因簇及其应用。该生物合成基因簇共包含8个结构基因：trlA、trlB、trlC、trlD、trlE、trlF、trlH以及trlI；1个调控相关基因：trlJ；以及1个其他功...
- 陶美凤陈雪斐徐敏王业民邓子新
- 一个巨大的抗真菌抗生素基因簇及其与植物生物技术的潜在关系被引量：2
- 1996年
- 从链霉菌ＦＲ－００８中克隆出一个七烯大环内酯抗生素的生物合成基因簇，基因置换试验证实克隆的基因片段与抗生素生物合成直接相关。ＦＲ－００８抗生素含有一个３８员由聚酮所衍生的内酯大环，由编码红霉素聚酮合酶的活性域基因片段为探针所进行的Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交试验证明，链霉菌ＦＲ－００８的聚酮合酶（ＰＫＳ）的基因簇占据１０５ｋｂ连续和具有重复功能单元（模块）的序列；假设每个ＰＫＳ模块为５ｋｂ，这与ＦＲ－００８碳链形成需要２１个缩合过程的预期数值极其吻合。链霉菌ＦＲ－００８的基因克隆系统（包括转化、转座、从大肠杆菌向链霉菌的属间接合转移、基因置换和基因中断体系和限制性缺陷菌株）均已得到发展，使我们能够充分利用基因工程技术来操纵七烯大环内酯的生物合成并产生新的抗生素衍生物。同时利用该基因簇中的部分ＰＫＳ基因序列构建了一个可用于转化植物的质粒ｐＨＺ３２１，为尝试在水稻等植物中表达链霉菌Ⅰ型ＰＫＳ基因以探索高Ｇ十Ｃ（７６％）含量的链霉菌ＰＫＳ基因能否在植物中表达提供了材料和工具。用此质粒来转化植物的研究，将为进一步利用这个巨大的抗真菌抗生素基因簇进行植物抗真菌的基因工程育种提供理论依据。
- 胡志浩陶美凤鲍锴周秀芬周启邓子新
- 关键词：链霉菌基因簇
- 拟无枝酸菌宿主构建及次级代谢基因簇异源表达
- 2022年
- 为将生长快、发酵时间短、遗传操作便捷的稀有放线菌拟无枝酸菌TNS106开发成异源表达宿主,通过同源重组将内源的瑞斯托霉素生物合成关键基因rpsA替换为ΦC31和ΦBT1噬菌体细菌附着位点attB,清除代谢背景并引入整合位点,得到菌株HXR1;将含有来自天蓝色链霉菌的放线紫红素基因簇或来自刺糖多孢菌的多杀菌素基因簇的质粒转到HXR1进行异源表达,检测发酵产物。结果显示,HXR1成功表达放线紫红素和多杀菌素;与红色糖多孢菌宿主LJ161相比,放线紫红素的产生提前1 d,产量提高1.3倍。拟无枝酸菌异源表达宿主HXR1可为从链霉菌和稀有放线菌中发现新的次级代谢产物提供有用的平台。
- 胡欣瑞贺卫军吕金王业民陶美凤
- 关键词：稀有放线菌异源表达多杀菌素次级代谢产物
- 林可链霉菌NRRL 2936中帕马霉素生物合成基因簇的异源表达及调控基因功能研究被引量：2
- 2018年
- 【背景】帕马霉素属于大环内酯类抗生素,具有较好的抗感染活性。该类化合物独特的化学结构和显著的生理活性受到了许多研究者的关注。同时,本实验室在林可链霉菌NRRL2936的全基因组序列中发现了帕马霉素的生物合成基因簇。【目的】尽管其生物合成途径已经得到了解析,但其生物合成基因簇中的2个调控基因功能尚不清楚。本研究从林可链霉菌NRRL2936的基因组文库中克隆了含有帕马霉素生物合成完整基因簇的质粒pJQK450,开展了质粒pJQK450在链霉菌中的异源表达,实现了帕马霉素的异源合成,并初步确定该生物合成基因簇中两个调控基因的功能。【方法】利用聚合酶链式反应递缩基因组文库筛选的方法,从林可链霉菌(Streptomyces lincolnensis)NRRL 2936基因组文库中筛选到了含有帕马霉素生物合成完整基因簇的Fosmid质粒pJQK450。然后,将该质粒转化到E.coli ET12567/pUZ8002中,利用大肠杆菌-链霉菌双亲接合转移的方法将pJQK450转入异源宿主中。对获得的异源表达菌株进行发酵产物的制备,采用耻垢分枝杆菌mc2155作为指示菌株进行帕马霉素生物活性测试,并结合LC-MS的分析确定帕马霉素的产生情况。最后,通过基因失活与回补的方法,考察帕马霉素生物合成基因簇中调控蛋白PamR1和PamR2对帕马霉素生物合成的影响。【结果】帕马霉素生物合成基因簇在天蓝色链霉菌M1154中实现了表达,证明PamR1和PamR2负调控了帕马霉素生物合成的过程。【结论】帕马霉素完整基因簇的成功异源表达,一方面便于其生物合成途径的遗传改造,为帕马霉素的生物合成及优产改造研究奠定了基础;另外,调控基因功能的研究为帕马霉素的产量优化提供了改造的目标。
- 蒋程恺孟思童张菲胡晓婧谢守锋陶美凤梁晶丹康前进白林泉邓子新
- 关键词：异源表达生物活性分析
- 3,7‑二羟基卓酚酮高产菌株及其发酵培养方法
- 本发明公开了3,7‑二羟基卓酚酮高产菌株及其发酵培养方法；本发明公开了两株通过生物合成基因簇克隆和异源表达的方式构建的天蓝色链霉菌M1152/pCXF1和M1154/pCXF1，能够生产大量的3,7‑二羟基卓酚酮，利用R...
- 陶美凤陈雪斐徐敏王业民邓子新
