付岩
- 作品数：43 被引量：126H指数：4
- 供职机构：中国科学院计算技术研究所更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学理学电子电信更多>>
- 企业信息平台
- 白硕程学旗郭莉廖华明熊锦华刘萍余智华付岩周立新张华开耿晖曲鹏李栋栋熊瑞勤冯国臻朱茂盛王海波姜吉发陈颖李磊郭岩向泓沙瀛孙萍宋铟
- 该课题主要研究基于ASP+COM/DCOM+关系数据库+WEB+元数据的计算框架，实现一个基本架构，旨在对内外各类不同的用户提供一个统一的Web方式的入口，集成各种不同的数据源以及应用，基于角色的统一授权与认证（RBAC...
- 关键词：
- 关键词：企业信息化企业门户企业信息平台
- 基于机器学习技术的生物信息检索研究
- 在知识和数据爆炸的今天，信息检索系统在各个领域都扮演着越来越重要的角色。检索函数(有日寸也被称为打分函数或排位函数)是所有检索系统的关键组成部分，其任务是对数据库中保存的数据对象与用户查询之间的相关性进行度量。检索函数的...
- 付岩
- 关键词：生物信息学信息检索机器学习技术
- 文献传递
- 基于信息技术的蛋白质识别研究被引量：3
- 2003年
- 随着质谱技术和NMR等仪器测定技术的飞速发展,利用大规模质谱技术可以得到海量蛋白质的质谱数据。同时,利用NMR技术也可获得蛋白质的精确三维结构数据。这些数据以及面向这些数据的分析方法使得蛋白质组研究迅速发展,其基础理论和技术方法,都在不断地进步和完善。利用信息工程技术辅助生物学家开展面向质谱技术的高通量蛋白识别,面向NMR的蛋白质三维结构识别,以及功能发现研究,已经成为蛋白质组中的生命科学与信息科学交叉研究的热点和挑战问题。本文侧重从信息技术的角度对上述问题进行综述,并提出我们解决问题的思路和方法。
- 陈益强高文付岩李德泉陈翔
- 关键词：蛋白质质谱信息技术
- 肽鉴定结果评估模型的特征选择研究
- 在串联质谱鉴定中,高通量的数据库搜索和相似性比对会产生大量的鉴定结果.如何对这些结果进行定量的有效性评估是目前蛋白质组学研究的一个关键问题.从模式分类的角度看,该问题可以理解为根据比对打分特征对鉴定结果进行真阳性和假阳性...
- 李德泉付岩孙瑞祥贺思敏高文
- 关键词：支持向量机生物信息学数据库搜索蛋白质鉴定
- 文献传递
- 一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统
- 本发明有关于一种蛋白质鉴定的大规模分布式并行加速方法及其系统，其中该方法包括：步骤1，对蛋白质序列进行理论酶切得到肽序列，对肽序列进行排序、去冗余处理，以创建肽索引文件块；步骤2，用并行处理方法，对质谱谱图进行排序，并将...
- 王乐珩王文平迟浩吴妍洁周郴付岩孙瑞祥贺思敏
- 基于质谱技术的计算蛋白质组学研究被引量：26
- 2006年
- 蛋白质组是继人类基因组计划完成之后又一新兴的生命科学研究对象,蛋白质组学研究细胞或组织内所有表达的蛋白质.生物质谱技术已为蛋白质组学研究产生了大规模的质谱数据;而如何从这些数据中提取和发现有关蛋白质组的重要生物学知识为计算蛋白质组学的研究提出了重大需求,如蛋白质鉴定、翻译后修饰、定量分析,以及疾病模式的发现等.本文研究了如何应用计算技术来解决蛋白质组学研究中质谱信息处理的这几个关键问题.
- 孙瑞祥付岩李德泉张京芬王晓彪盛泉虎曾嵘陈益强贺思敏高文
- 关键词：质谱技术蛋白质鉴定生物信息学
- 一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法及相应的系统
- 本发明提供一种规模化蛋白质鉴定中的索引加速方法，包括：为肽序列设定质量区间；为计数窗口设定大小，并结合质量区间设定计数窗口的数目以及各个计数窗口的范围；对蛋白质数据库做模拟酶切，根据模拟酶切所得到的肽序列的质量计算肽序列...
- 李由李德泉王乐珩迟浩王海鹏付岩孙瑞祥贺思敏刘超袁作飞王文平秀丽蕴
- 一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法
- 本发明公开了一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法，包括步骤：将要被鉴定的肽进行实验碎裂以生成实验串联质谱；将数据库中的多个候选肽进行理论碎裂以生成多个理论串联质谱；用径向基函数核分别计算多个理论串联质谱与实验串联质谱的相似度...
- 高文付岩李德泉孙瑞祥贺思敏杨强曾嵘周虎陈益强王晓彪
- 文献传递
- 一种对字符串排序和查找的方法
- 本发明提供一种对字符串进行排序的方法，包括：为所要排序的所有字符串中的字符分类，为一个类别的字符赋予一个数值，不同类别的字符所赋予的数值互不相同；结合各个字符所赋予的值，采用哥德尔编码方法对所要排序的各个字符串分别进行编...
- 李由贺思敏付岩袁作飞迟浩王海鹏王乐珩孙瑞祥
- 文献传递
- 一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法
- 本发明公开了一种使用串联质谱数据鉴定肽的方法，包括步骤：将要被鉴定的肽进行实验碎裂以生成实验串联质谱；将数据库中的多个候选肽进行理论碎裂以生成多个理论串联质谱；用径向基函数核分别计算多个理论串联质谱与实验串联质谱的相似度...
- 高文付岩李德泉孙瑞祥贺思敏杨强曾嵘周虎陈益强王晓彪
- 文献传递
