保曙琳 作品数:12 被引量:145 H指数:8 供职机构: 南京师范大学生命科学学院 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 江苏省教育厅自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 环境科学与工程 生物学 农业科学 更多>>
兜唇石斛的位点特异性PCR鉴别 被引量:22 2002年 根据兜唇石斛及其它37种枫斗类和黄草类石斛的rDNAITS序列,设计了鉴别兜唇石斛的位点特异性PCR引物DC JB01S和DC JB01X,并对兜唇石斛成功地进行了位点特异性PCR鉴别.在进行位点特异性PCR鉴别之前,首先运用扩增ITS区的通用引物P1、P2对模板DNA进行扩增,以验证模板的可靠性和扩增的合适浓度.当退火温度上升为64℃,只有兜唇石斛的模板DNA能被扩增出来,而其它的37种石斛属植物均为阴性.该鉴别反应重复性好,已在鉴别我国兜唇石斛中发挥重要作用.与DNA测序鉴别方法相比,位点特异性PCR具有简单、省时、高效、准确等优点. 丁小余 徐珞珊 常俊 保曙琳 丁秉中关键词:位点特异性PCR 药材 花椒品种的DNA分子甄别 被引量:2 2003年 本文对花椒不同居群的 r DNA ITS区序列片段进行了测定和分析。 r DNA ITS区序列片段有 60 3 bp、GC百分比为 60 .3 %。在所比较的花椒居群中 ,ITS区序列片段存在着 2 2个变异位点。依据花椒 r DNA ITS区的碱基差异 ,我们可以有效鉴别陕西凤县凤椒、甘肃武都大红袍。 沈洁 丁小余 张卫明 保曙琳 常俊 唐凤关键词:花椒 细叶石斛的位点特异性PCR鉴别 被引量:15 2002年 根据细叶石斛及其它 37种枫斗类和黄草类石斛的rDNAITS序列,我们设计了位点特异性PCR鉴别引物XY JB0 1S和XY JB0 1X,对细叶石斛进行了成功的DNA分子鉴别.在进行位点特异性鉴别PCR之前,首先运用扩增ITS区的通用引物P1、P2对模板DNA进行扩增,以验证模板的可靠性和扩增的合适浓度.当退火温度上升为 64℃,只有细叶石斛的模板DNA能被扩增出来,而其它的 37种石斛属植物均为阴性.该鉴别反应重复性好,已在鉴别细叶石斛中发挥重要作用.与DNA测序鉴别方法相比,位点特异性PCR具有简单、省时、高效、准确等优点. 罗玉明 丁小余 徐珞珊 保曙琳 常俊关键词:位点特异性PCR 长江中下游地区菱属植物的DNA分子鉴别 被引量:16 2004年 目的 对野生菱和栽培菱种rDNAITS片段进行分析 ,探讨该片段在两大群体中的系统学及鉴别研究意义。方法 对菱的rDNAITS区进行了PCR扩增、测序 ,运用Clustal、Mega2 0等软件对ITS区进行序列分析鉴别。结果 获得rDNAITS1、ITS2和 5 8SrDNA完整序列 ,10个居群菱的ITS1与ITS2序列的长度分别为 2 34~2 36bp和 2 2 0~ 2 2 1bp ,5 8S区均为 16 4bp ,不同居群的碱基差异为 0 2 2 %~ 2 94 %。变异位点数为 16个 ,信息位点数 6个。用NJ法根据ITS序列数据构建系统发生树。结论 尽管菱属各居群间rDNAITS的差异百分率较小 ,其亲缘关系较近 ,但根据ITS序列的特征可以很好地鉴别野生菱、栽培菱 ,菱属植物有可能都起源于同一种野生类居群。 保曙琳 丁小余 常俊 沈洁 唐凤关键词:菱属 RDNA ITS序列 物种起源 中国菱属植物种质的DNA分子鉴别及铈对镉毒害的缓解研究 菱属(Trapa L.)植物是中国原产的水生植物,早在新石器时代的河姆渡遗址就曾掘出过菱实,距今约有7000多年的栽培历史.菱果实鲜嫩可口,茎、叶、果实还可以入药,据《本草纲目》记载,菱具有'安中补脏,养神强志,耳聪目明... 保曙琳关键词:菱属 系统发育 重金属污染 文献传递 稀土元素铈缓解镉对菱叶的毒害效应研究 被引量:16 2006年 利用不同浓度的Cd^2+和不同浓度的Cd^2+加5mgL^-1Ce^3+分别处理菱植株,对菱叶中的叶绿素、脯氨酸、保护酶——超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)和过氧化氢酶(CAT)活性的动态变化进行了研究:实验结果表明:在镉胁迫下,随着镉浓度的上升(0~4mgL^-1)菱叶中叶绿素含量下降,SOD、POD活性和脯氨酸含量在镉低浓度时上升而高浓度时下降,相反,CAT活性在镉低浓度时下降而高浓度时上升。与镉离子单一处理相比,Cd^2+-Ce^3+复合处理中的Ce^3+可提高叶片中叶绿素的含量和SOD、POD的活性,尤其是在1mgL^-1 Cd^2+加5mgL^-1Ce^3+复合处理中,POD活性较对照提高了8.33倍。由此表明,5mgL^-1Ce^3+对低浓度镉引起菱叶片的毒害作用有较为明显的缓解效果。 罗玉明 保曙琳 丁秉中 丁小余 杨晋彬关键词:稀土元素 铈 镉胁迫 喇叭唇石斛组织培养的研究 被引量:14 2004年 目的 :筛选喇叭唇石斛快速繁殖体系的适宜培养基及培养条件。方法 :对基本培养基、光照条件、激素、天然提取物浓度等进行比较研究。进行叶绿素含量、可溶性蛋白含量测定。结果 :N6培养基是种胚萌发成苗适宜培养基 ,而 1/ 2MS +NAA 0 .5mg·L-1易于原球茎膨大增殖。先暗培养 2 0d再光照培养有利于胚的萌发及苗的生长。 1/ 2MS +NAA 0~ 0 .5mg·L-1有利于原球茎大量增殖 ,N6+6 BA 2 .0mg·L-1+NAA 0 .5mg·L-1+10 %马铃薯汁是原球茎分化的适宜培养基 ,添加激素和马铃薯汁促进叶绿素和可溶性蛋白含量上升。N6+NAA 0 .5mg·L-1+10 %香蕉汁生根壮苗最适宜。结论 :无机盐浓度、氮源形态、光照条件对胚萌发生长影响较大 ;氮源形态对原球茎增殖有影响 ;叶绿素含量、可溶性蛋白含量能反映组培苗的生长状态 。 常俊 丁小余 保曙琳 刘冬扬 贺佳 唐凤 丁秉中关键词:培养基 可溶性蛋白 叶绿素 花椒cpDNA trnL-F间隔区序列的特征及其在混淆品鉴别中的应用 被引量:10 2004年 目的 :通过分析花椒cpDNAtrnL -F间隔区序列特点 ,探讨该序列在花椒与其混淆品鉴别中的意义。方法 :对花椒及其混淆品进行cpDNAtrnL -F间隔区序列比较研究。结果 :花椒cpDNAtrnL -F间隔区序列为 349bp、AT百分比为 6 2 .1%。尽管花椒的果实在外部形态 ,物理特性上与混淆品差异较小 ,但在cpDNAtrnL -F间隔区序列上却存在着显著而稳定的差异。该序列在属以下的分类阶元中同源性极高 ,可达 10 0 %。结论 :根据cpDNAtrnL-F间隔区碱基序列的差异 。 沈洁 丁小余 张卫明 保曙琳 常俊 唐凤关键词:花椒 果实 植物分类学 芸香科 细叶石斛的位点特异性PCR鉴别(英文) 被引量:3 2002年 根据细叶石斛及其它37种枫斗类和黄草类石斛的rDNAITS序列,我们设计了位点特异性PCR鉴别引物XY-JB01S和XY-JB01X,对细叶石斛进行了成功的DNA分子鉴别。在进行位点特异性鉴别PCR之前,首先运用扩增ITS区的通用引物P1、P2对模板DNA进行扩增,以验证模板的可靠性和扩增的合适浓度。当退火温度上升为64℃,只有细叶石斛的模板DNA能被扩增出来,而其它的37种石斛属植物均为阴性。该鉴别反应重复性好,已在鉴别细叶石斛中发挥重要作用。与DNA测序鉴别方法相比,位点特异性PCR具有简单、省时、高效、准确等优点。 丁小余 张卫明 保曙琳 常俊关键词:位点特异性PCR 紫苏属药用植物的rDNA ITS区SNP分子标记与位点特异性PCR鉴别 被引量:33 2006年 目的 分析单种属——紫苏属各变种间rDNA ITS区的序列以及存在的单核苷酸多态性(SNP)现象,设计出位点特异性PCR引物,用于紫苏属各变种间的分子标记鉴别。方法 对紫苏属各变种多个体的rDNA ITS区全序列进行了准确测定,运用Clustral X1.8,MEGA3.0进行排序并进行SNP分析,从而设计出鉴别各变种的等位基因位点特异性PCR鉴别引物。结果 紫苏属各变种(紫苏、白苏、鸡冠苏和耳齿紫苏等)的rDNA ITS区全序列共有615~618bp的长度,ITS1为233~235bp,5.8S为179bp,ITS2为203~204bp,GC含量为61.5%~61.9%。从rDNA ITS区碱基变异的整体情况来看,紫苏属各变种间不仅在非编码的转录间隔区ITS1和ITS2内存在非编码区单核苷酸多态性(ncSNP),而且在保守的5.8S编码区内也存在3个位点的单核苷酸多态性,即编码区SNP(cSNP),所有的SNP均只具2等位多态性。5.8S区cSNP的出现与产生该变异的变种出现的显著形态差异关联。本文还利用这些SNP位点设计出了鉴别紫苏属各变种的位点特异性PCR引物,无需测序即可对紫苏属的原植物及“苏子”、“苏叶”等药材进行有效准确的分子鉴别。结论 紫苏属药用植物rDNA ITS区存在的SNP可用作紫苏属各变种鉴别的分子标记。 罗玉明 张卫明 丁小余 沈洁 保曙琳 褚必海 毛善国关键词:紫苏属 ITS区 位点特异性PCR 分子鉴别