姜永杰
- 作品数:7 被引量:26H指数:3
- 供职机构:中国水产科学研究院南海水产研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划广东省科技计划工业攻关项目农业部农业结构调整重大技术研究专项项目更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析
- 本文对中国南海海域5个斑节对虾野生群体(三亚群体(SY)、深圳群体(SZ)、阳江群体(YJ)、湛江群体(ZJ)、北海群体(BH))100个样品的mtDNA 16SrRNA序列进行PCR扩增,并对扩增产物进行了测序。用Cl...
- 周发林江世贵姜永杰黄建华马之明
- 关键词:斑节对虾
- 文献传递
- 南海野生斑节对虾的线粒体16S rRNA基因序列单倍型分析被引量:3
- 2008年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对我国南海海域5个地点(三亚、深圳、阳江、湛江、北海)的野生斑节对虾100个个体的mtDNA16S rRNA序列进行扩增,扩增产物经纯化后进行测序。用Clustal_X排序软件对所得的100个mtDNA16S rRNA序列进行比对。通过ARLEQUIN软件对所得100个mtDNA16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型。19单倍型序列的碱基组成显示出较高的A+T比例(69.0%)。19种单倍型序列的遗传距离在0.002-0.033。根据构建的单倍型进化关系网,5个地点群体中的单倍型呈现一种混杂的分布格局。此外,根据单倍型在5个地点群体出现的频率和单倍型进化关系网,单倍型7是最为原始的单倍型,其他18种单倍型均起源于单倍型7。
- 周发林江世贵姜永杰黄建华
- 关键词:MTDNARRNA斑节对虾单倍型
- 深圳海域斑节对虾野生种群线粒体控制区序列的多态性分析被引量:10
- 2006年
- 采用聚合酶链式反应技术对深圳斑节对虾种群的20个个体进行了分析,通过对mtDNA的控制区基因序列进行扩增,获得了大小约为650bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了526bp的核苷酸序列。用Clustal_X排序软件对控制区序列进行了对位排列。通过Mega软件对所得线粒体控制区序列的片段进行比较,共检测出114个碱基存在变异,其中包括84个简约信息位点,5个碱基存在插入/缺失;并用Mega的“Pairwise distance”计算个体间的相对遗传距离。结果表明:其序列差异(转换+颠换)在0.010-0.154之间,得出20个个体有20种单倍型;并构建了UPGMA和NJ系统树。运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性(R)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.05278和27.500。研究结果表明:深圳斑节对虾野生种群控制区序列个体变异程度很大,该种群的遗传多样性水平很高,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析。
- 姜永杰周发林黄建华马之明江世贵
- 关键词:斑节对虾线粒体控制区序列
- 中国南海野生斑节对虾5个地理群体线粒体16S rRNA基因序列比较分析被引量:9
- 2009年
- 对中国南海海域5个斑节对虾野生群体三亚群体(SY)、深圳群体(SZ)、阳江群体(YJ)、湛江群体(ZJ)、北海群体(BH)——100个样品的16S rRNA序列进行PCR扩增,并对扩增产物进行了测序。用CLUSTAL_X排序软件对测序所得的100个16S rRNA序列进行比对。通过ARLEQUIN软件对所得100个16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型。三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的核苷酸多样性(π)依次分别为0.004 35,0.005 86,0.010 50,0.010 81,0.011 68。三亚、深圳、阳江、湛江以及北海等5个野生群体的单倍型多样性(H)依次分别为0.689 5,0.521 1,0.573 7,0.600 0,0.721 1。对5个野生群体的16S rRNA序列进行FST分析,结果表明湛江、北海群体分别与三亚、深圳两个群体有显著的遗传差异,其余群体之间的遗传差异不显著。对5个群体进行AMOVA分析结果表明,5个群体间存在显著性遗传差异。对5个群体构建分子系统树,结果表明,三亚和深圳群体之间的亲缘关系最近;北海、湛江群体与三亚、深圳群体的亲缘关系很远。实验表明,中国南海海域5个斑节对虾野生群体可以为斑节对虾的选择育种提供两个基础群体:一个是三亚、深圳野生原种基础群体;另一个是湛江和北海野生原种基础群体。
- 周发林江世贵姜永杰黄建华马之明
- 关键词:斑节对虾RRNA
- 海南三亚斑节对虾野生种群线粒体16S rRNA基因和控制区序列的多态性研究
- 聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚的斑节对虾(Penaeusmonodon)群体(n=20)的mtDNA16SrRNA基因和控制区序列进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到16SrRNA序列495bp的核苷酸片段...
- 周发林姜永杰黄建华马之明江世贵
- 关键词:斑节对虾
- 斑节对虾全人工繁育技术
- 江世贵李卓佳杨丛海周发林黄建华何建国翁少萍邱丽华林黑着苏天凤曹煜成张殿昌杨其彬叶乐温为庚马之明文国樑陈旭夏军红陈怡飚姜永杰於叶兵吴成福熊小飞黄忠陈亮王卫芳吴开畅朱彩艳李建柱
- 该成果主要包括以下几个方面的内容:(1)在斑节对虾亲虾培育方面,阐明了全人工养殖条件下的斑节对虾性腺发育规律;掌握了人工养殖条件下斑节对虾性成熟特点;深入了解了斑节对虾亲虾性腺发育的营养学特点和关键营养物质的变化规律;探...
- 关键词:
- 关键词:斑节对虾人工育苗遗传育种
- 海南三亚斑节对虾野生种群mtDNA 16S rRNA基因和控制区序列的多态性被引量:12
- 2006年
- 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对海南三亚野生斑节对虾(Penaeus monodon)20个个体的mtDNA 16S rRNA基因和控制区序列进行扩增,PCR产物经纯化后进行测序,得到16S rRNA基因的495 bp的核苷酸序列和控制区序列470 bp的核苷酸片段。用Clustal X软件对16S rRNA和控制区序列进行了比对,通过ARLEQUIN 2000软件对所得线粒体16S rRNA基因片段和控制区序列进行了比较分析。16S rRNA序列检测出17个多态位点,8种单倍型;控制区序列检测出100个多态位点,17种单倍型。该种群16S rRNA序列基因多样度(H)和碱基多样度(π)分别为0.700和0.0045;控制区序列的H和π分别为0.984和0.0480。研究结果表明:16S rRNA序列不适应斑节对虾的种群遗传多样性分析;控制区序列适应斑节对虾种群遗传多样性研究。
- 周发林江世贵姜永杰黄建华马之明
- 关键词:斑节对虾MTDNARRNA控制区序列